RNASEL

RNASEL
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WDY, 4G8K, 4G8L, 4OAU, 4OAV
Ідентифікатори
Символи	RNASEL, PRCA1, RNS4, ribonuclease L
Зовнішні ІД	OMIM: 180435 MGI: 1098272 HomoloGene: 8040 GeneCards: RNASEL
Пов'язані генетичні захворювання
	Розсіяний склероз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • protein kinase activity; • rRNA binding; • зв'язування з іоном металу; • endoribonuclease activity; • ribonuclease activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • nuclease activity; • ribonucleoprotein complex binding; • endonuclease activity; • hydrolase activity; • ATP binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear matrix; • мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • компонент клітини;
Біологічний процес	• regulation of mRNA stability; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • mRNA processing; • protein phosphorylation; • negative regulation of viral genome replication; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • defense response to virus; • type I interferon signaling pathway; • rRNA processing; • fat cell differentiation; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • positive regulation of glucose import;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6041
	24014
	ENSG00000135828
	ENSMUSG00000066800
	Q05823
	Q05921
	NM_021133
	NM_011882
	NP_066956
	NP_036012
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNASEL (англ. Ribonuclease L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 83 533[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESRDHNNPQ	EGPTSSSGRR	AAVEDNHLLI	KAVQNEDVDL	VQQLLEGGAN
VNFQEEEGGW	TPLHNAVQMS	REDIVELLLR	HGADPVLRKK	NGATPFILAA
IAGSVKLLKL	FLSKGADVNE	CDFYGFTAFM	EAAVYGKVKA	LKFLYKRGAN
VNLRRKTKED	QERLRKGGAT	ALMDAAEKGH	VEVLKILLDE	MGADVNACDN
MGRNALIHAL	LSSDDSDVEA	ITHLLLDHGA	DVNVRGERGK	TPLILAVEKK
HLGLVQRLLE	QEHIEINDTD	SDGKTALLLA	VELKLKKIAE	LLCKRGASTD
CGDLVMTARR	NYDHSLVKVL	LSHGAKEDFH	PPAEDWKPQS	SHWGAALKDL
HRIYRPMIGK	LKFFIDEKYK	IADTSEGGIY	LGFYEKQEVA	VKTFCEGSPR
AQREVSCLQS	SRENSHLVTF	YGSESHRGHL	FVCVTLCEQT	LEACLDVHRG
EDVENEEDEF	ARNVLSSIFK	AVQELHLSCG	YTHQDLQPQN	ILIDSKKAAH
LADFDKSIKW	AGDPQEVKRD	LEDLGRLVLY	VVKKGSISFE	DLKAQSNEEV
VQLSPDEETK	DLIHRLFHPG	EHVRDCLSDL	LGHPFFWTWE	SRYRTLRNVG
NESDIKTRKS	ESEILRLLQP	GPSEHSKSFD	KWTTKINECV	MKKMNKFYEK
RGNFYQNTVG	DLLKFIRNLG	EHIDEEKHKK	MKLKIGDPSL	YFQKTFPDLV
IYVYTKLQNT	EYRKHFPQTH	SPNKPQCDGA	GGASGLASPG	C

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

Zhou A., Hassel B.A., Silverman R.H. (1993). Expression cloning of 2-5A-dependent RNAase: a uniquely regulated mediator of interferon action.. Cell 72: 753 — 765. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(93)90403-D
Zhou A., Nie H., Silverman R.H. (2000). Analysis and origins of the human and mouse RNase L genes: mediators of interferon action.. Mamm. Genome 11: 989 — 992. PubMed DOI:10.1007/s003350010194
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bisbal C., Martinand C., Silhol M., Lebleu B., Salehzada T. (1995). Cloning and characterization of a RNase L inhibitor. A new component of the interferon-regulated 2-5A pathway.. J. Biol. Chem. 270: 13308 — 13317. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.22.13308
Castelli J., Wood K.A., Youle R.J. (1998). The 2-5A system in viral infection and apoptosis.. Biomed. Pharmacother. 52: 386 — 390. PubMed DOI:10.1016/S0753-3322(99)80006-7
Dong B., Silverman R.H. (1999). Alternative function of a protein kinase homology domain in 2', 5'-oligoadenylate dependent RNase L.. Nucleic Acids Res. 27: 439 — 445. PubMed DOI:10.1093/nar/27.2.439

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з RNASEL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10050 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, Q05823 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RNASEL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10050 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q05823 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.