RORC

RORC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3B0W, 3KYT, 3L0J, 3L0L, 4NB6, 4NIE, 4QM0, 4S14, 4WLB, 4WPF, 4WQP, 4XT9, 4YMQ, 4ZJR, 4ZJW, 4ZOM, 5C4O, 5APK, 5APJ, 5APH, 5C4U, 5C4S, 5C4T, 4YPQ, 5AYG, 5IXK, 5IZ0, 5EJV, 5ETH
Ідентифікатори
Символи	RORC, NR1F3, RORG, RZR-GAMMA, RZRG, TOR, RAR-related orphan receptor gamma, IMD42, RAR related orphan receptor C
Зовнішні ІД	OMIM: 602943 MGI: 104856 HomoloGene: 21051 GeneCards: RORC
Пов'язані генетичні захворювання
	inflammatory bowel diseases[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • ligand-activated transcription factor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • oxysterol binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription coactivator binding;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • ритмічний процес; • cellular response to sterol; • negative regulation of thymocyte apoptotic process; • circadian regulation of gene expression; • regulation of fat cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • regulation of steroid metabolic process; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • regulation of glucose metabolic process; • Циркадний ритм; • xenobiotic metabolic process; • positive regulation of circadian rhythm; • adipose tissue development; • T-helper 17 cell differentiation; • Peyer's patch development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • T-helper cell differentiation; • lymph node development; • steroid hormone mediated signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6097
	19885
	ENSG00000143365
	ENSMUSG00000028150
	P51449
	P51450
	NM_001001523; NM_005060
	NM_001293734; NM_011281
	NP_001001523; NP_005051
	NP_001280663; NP_035411
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RORC (англ. RAR related orphan receptor C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 58 195[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDRAPQRQHR	ASRELLAAKK	THTSQIEVIP	CKICGDKSSG	IHYGVITCEG
CKGFFRRSQR	CNAAYSCTRQ	QNCPIDRTSR	NRCQHCRLQK	CLALGMSRDA
VKFGRMSKKQ	RDSLHAEVQK	QLQQRQQQQQ	EPVVKTPPAG	AQGADTLTYT
LGLPDGQLPL	GSSPDLPEAS	ACPPGLLKAS	GSGPSYSNNL	AKAGLNGASC
HLEYSPERGK	AEGRESFYST	GSQLTPDRCG	LRFEEHRHPG	LGELGQGPDS
YGSPSFRSTP	EAPYASLTEI	EHLVQSVCKS	YRETCQLRLE	DLLRQRSNIF
SREEVTGYQR	KSMWEMWERC	AHHLTEAIQY	VVEFAKRLSG	FMELCQNDQI
VLLKAGAMEV	VLVRMCRAYN	ADNRTVFFEG	KYGGMELFRA	LGCSELISSI
FDFSHSLSAL	HFSEDEIALY	TALVLINAHR	PGLQEKRKVE	QLQYNLELAF
HHHLCKTHRQ	SILAKLPPKG	KLRSLCSQHV	ERLQIFQHLH	PIVVQAAFPP
LYKELFSTET	ESPVGLSK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hirose T., Smith R.J., Jetten A.M. (1994). ROR gamma: the third member of ROR/RZR orphan receptor subfamily that is highly expressed in skeletal muscle.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1976 — 1983. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1994.2902
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Jetten A.M. (2009). Retinoid-related orphan receptors (RORs): critical roles in development, immunity, circadian rhythm, and cellular metabolism.. Nucl. Recept. Signal. 7: 3 — 35. PubMed DOI:10.1621/nrs.07003
Wang Y., Kumar N., Crumbley C., Griffin P.R., Burris T.P. (2010). A second class of nuclear receptors for oxysterols: Regulation of RORalpha and RORgamma activity by 24S-hydroxycholesterol (cerebrosterol).. Biochim. Biophys. Acta 1801: 917 — 923. PubMed DOI:10.1016/j.bbalip.2010.02.012
Solt L.A., Burris T.P. (2012). Action of RORs and their ligands in (patho)physiology.. Trends Endocrinol. Metab. 23: 619 — 627. PubMed DOI:10.1016/j.tem.2012.05.012

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з RORC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10260 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P51449 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RORC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10260 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P51449 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.