RPA2

RPA2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DPU, 1L1O, 1QUQ, 1Z1D, 2PI2, 2PQA, 2Z6K, 3KDF, 4MQV, 4OU0
Ідентифікатори
Символи	RPA2, REPA2, RP-A p32, RP-A p34, RPA32, replication protein A2
Зовнішні ІД	OMIM: 179836 MGI: 1339939 HomoloGene: 37712 GeneCards: RPA2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein N-terminus binding; • single-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • protein phosphatase binding; • ubiquitin protein ligase binding; • G-rich strand telomeric DNA binding; • double-stranded DNA binding; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• site of double-strand break; • PML body; • Нуклеоплазма; • Теломера; • DNA replication factor A complex; • Хроматин; • клітинне ядро; • Ядерні тільця; • condensed nuclear chromosome;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair, DNA gap filling; • DNA recombination; • interstrand cross-link repair; • regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • error-free translesion synthesis; • G1 phase; • error-prone translesion synthesis; • cellular response to DNA damage stimulus; • Реплікація ДНК; • mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling; • regulation of DNA damage checkpoint; • regulation of cellular response to heat; • mismatch repair; • translesion synthesis; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair, DNA incision; • base-excision repair; • nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • Репарація ДНК; • double-strand break repair via homologous recombination; • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion; • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion; • protein localization to chromosome; • telomere maintenance; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • telomere maintenance via recombination; • DNA topological change; • DNA unwinding involved in DNA replication; • mitotic recombination; • telomere maintenance via telomerase; • reciprocal meiotic recombination; • heteroduplex formation; • positive regulation of helicase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6118
	19891
	ENSG00000117748
	ENSMUSG00000028884
	P15927
	Q62193
	NM_001286076; NM_001297558; NM_002946; NM_001355128; NM_001355129
	NM_011284
	NP_001273005; NP_001284487; NP_002937; NP_001342057; NP_001342058
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RPA2 (англ. Replication protein A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 247[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWNSGFESYG	SSSYGGAGGY	TQSPGGFGSP	APSQAEKKSR	ARAQHIVPCT
ISQLLSATLV	DEVFRIGNVE	ISQVTIVGII	RHAEKAPTNI	VYKIDDMTAA
PMDVRQWVDT	DDTSSENTVV	PPETYVKVAG	HLRSFQNKKS	LVAFKIMPLE
DMNEFTTHIL	EVINAHMVLS	KANSQPSAGR	APISNPGMSE	AGNFGGNSFM
PANGLTVAQN	QVLNLIKACP	RPEGLNFQDL	KNQLKHMSVS	SIKQAVDFLS
NEGHIYSTVD	DDHFKSTDAE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Din S., Brill S.J., Fairman M.P., Stillman B. (1990). Cell-cycle-regulated phosphorylation of DNA replication factor A from human and yeast cells.. Genes Dev. 4: 968 — 977. PubMed DOI:10.1101/gad.4.6.968
Liu V.F., Weaver D.T. (1993). The ionizing radiation-induced replication protein A phosphorylation response differs between ataxia telangiectasia and normal human cells.. Mol. Cell. Biol. 13: 7222 — 7231. PubMed DOI:10.1128/MCB.13.12.7222
He Z., Henricksen L.A., Wold M.S., Ingles C.J. (1995). RPA involvement in the damage-recognition and incision steps of nucleotide excision repair.. Nature 374: 566 — 569. PubMed DOI:10.1038/374566a0
Park M.S., Ludwig D.L., Stigger E., Lee S.H. (1996). Physical interaction between human RAD52 and RPA is required for homologous recombination in mammalian cells.. J. Biol. Chem. 271: 18996 — 19000. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.31.18996
Zernik-Kobak M., Vasunia K., Connelly M., Anderson C.W., Dixon K. (1997). Sites of UV-induced phosphorylation of the p34 subunit of replication protein A from HeLa cells.. J. Biol. Chem. 272: 23896 — 23904. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.38.23896

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10290 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P15927 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10290 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P15927 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.