RRP1B

RRP1B
Ідентифікатори
Символи	RRP1B, KIAA0179, NNP1L, Nnp1, PPP1R136, RRP1, ribosomal RNA processing 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 610654 MGI: 1919712 HomoloGene: 57086 GeneCards: RRP1B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Гетерохроматин; • preribosome, small subunit precursor; • гіалоплазма; • Еухроматин; • Ядерце; • клітинне ядро; • preribosome, large subunit precursor; • granular component; • Нуклеоплазма; • хромосома;
Біологічний процес	• negative regulation of phosphatase activity; • rRNA processing; • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity; • positive regulation of apoptotic process; • regulation of RNA splicing; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to virus; • mRNA processing; • Апоптоз; • Сплайсинг;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23076
	72462
	ENSG00000160208
	ENSMUSG00000058392
	Q14684
	Q91YK2
	NM_015056
	NM_001163734; NM_028244
	NP_055871
	NP_001157206; NP_082520
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RRP1B (англ. Ribosomal RNA processing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 758 амінокислот, а молекулярна маса — 84 428[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPAMQPAEI	QFAQRLASSE	KGIRDRAVKK	LRQYISVKTQ	RETGGFSQEE
LLKIWKGLFY	CMWVQDEPLL	QEELANTIAQ	LVHAVNNSAA	QHLFIQTFWQ
TMNREWKGID	RLRLDKYYML	IRLVLRQSFE	VLKRNGWEES	RIKVFLDVLM
KEVLCPESQS	PNGVRFHFID	IYLDELSKVG	GKELLADQNL	KFIDPFCKIA
AKTKDHTLVQ	TIARGVFEAI	VDQSPFVPEE	TMEEQKTKVG	DGDLSAEEIP
ENEVSLRRAV	SKKKTALGKN	HSRKDGLSDE	RGRDDCGTFE	DTGPLLQFDY
KAVADRLLEM	TSRKNTPHFN	RKRLSKLIKK	FQDLSEGSSI	SQLSFAEDIS
ADEDDQILSQ	GKHKKKGNKL	LEKTNLEKEK	GSRVFCVEEE	DSESSLQKRR
RKKKKKHHLQ	PENPGPGGAA	PSLEQNRGRE	PEASGLKALK	ARVAEPGAEA
TSSTGEESGS	EHPPAVPMHN	KRKRPRKKSP	RAHREMLESA	VLPPEDMSQS
GPSGSHPQGP	RGSPTGGAQL	LKRKRKLGVV	PVNGSGLSTP	AWPPLQQEGP
PTGPAEGANS	HTTLPQRRRL	QKKKAGPGSL	ELCGLPSQKT	ASLKKRKKMR
VMSNLVEHNG	VLESEAGQPQ	ALGSSGTCSS	LKKQKLRAES	DFVKFDTPFL
PKPLFFRRAK	SSTATHPPGP	AVQLNKTPSS	SKKVTFGLNR	NMTAEFKKTD
KSILVSPTGP	SRVAFDPEQK	PLHGVLKTPT	SSPASSPLVA	KKPLTTTPRR
RPRAMDFF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1.. DNA Res. 3: 17 — 24. PubMed DOI:10.1093/dnares/3.1.17
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23818 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q14684 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23818 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q14684 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.