RTN4R

RTN4R
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OZN, 1P8T
Ідентифікатори
Символи	RTN4R, NGR, NOGOR, Reticulon 4 receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605566 MGI: 2136886 HomoloGene: 11299 GeneCards: RTN4R
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• neuregulin receptor activity; • protein kinase inhibitor activity; • GO:0001948 protein binding; • heparin binding; • chondroitin sulfate binding; • ganglioside GM1 binding; • ganglioside GT1b binding; • lipid binding; • signaling receptor activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • growth cone; • клітинна мембрана; • axonal growth cone; • integral component of plasma membrane; • neuronal cell body; • Ендоплазматичний ретикулум; • anchored component of membrane; • neuron projection; • Екзосома; • cell surface; • anchored component of external side of plasma membrane; • dendritic shaft; • membrane raft; • Аксон; • Дендрит (нейробіологія); • cell projection; • Перикаріон; • presynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• negative regulation of protein kinase activity; • cytokine-mediated signaling pathway; • neuronal signal transduction; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • negative regulation of axonogenesis; • negative regulation of axon extension; • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; • negative regulation of neuron projection development; • negative regulation of axon regeneration; • cell surface receptor signaling pathway; • axonogenesis; • corpus callosum development; • positive regulation of Rho protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	65078
	65079
	ENSG00000040608
	ENSMUSG00000043811
	Q9BZR6
	Q99PI8
	NM_023004
	NM_022982
	NP_075380
	NP_075358
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RTN4R (англ. Reticulon 4 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 50 708[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRASAGGSR	LLAWVLWLQA	WQVAAPCPGA	CVCYNEPKVT	TSCPQQGLQA
VPVGIPAASQ	RIFLHGNRIS	HVPAASFRAC	RNLTILWLHS	NVLARIDAAA
FTGLALLEQL	DLSDNAQLRS	VDPATFHGLG	RLHTLHLDRC	GLQELGPGLF
RGLAALQYLY	LQDNALQALP	DDTFRDLGNL	THLFLHGNRI	SSVPERAFRG
LHSLDRLLLH	QNRVAHVHPH	AFRDLGRLMT	LYLFANNLSA	LPTEALAPLR
ALQYLRLNDN	PWVCDCRARP	LWAWLQKFRG	SSSEVPCSLP	QRLAGRDLKR
LAANDLQGCA	VATGPYHPIW	TGRATDEEPL	GLPKCCQPDA	ADKASVLEPG
RPASAGNALK	GRVPPGDSPP	GNGSGPRHIN	DSPFGTLPGS	AEPPLTAVRP
EGSEPPGFPT	SGPRRRPGCS	RKNRTRSHCR	LGQAGSGGGG	TGDSEGSGAL
PSLTCSLTPL	GLALVLWTVL	GPC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Fournier A.E., GrandPre T., Strittmatter S.M. (2001). Identification of a receptor mediating Nogo-66 inhibition of axonal regeneration.. Nature 409: 341 — 346. PubMed DOI:10.1038/35053072
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
GrandPre T., Li S., Strittmatter S.M. (2002). Nogo-66 receptor antagonist peptide promotes axonal regeneration.. Nature 417: 547 — 551. PubMed DOI:10.1038/417547a
Liu B.P., Fournier A., GrandPre T., Strittmatter S.M. (2002). Myelin-associated glycoprotein as a functional ligand for the Nogo-66 receptor.. Science 297: 1190 — 1193. PubMed DOI:10.1126/science.1073031
Woolf C.J., Bloechlinger S. (2002). It takes more than two to Nogo.. Science 297: 1132 — 1134. PubMed DOI:10.1126/science.1076247

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з RTN4R переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18601 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9BZR6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RTN4R переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18601 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9BZR6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.