S100A8

S100A8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MR8, 1XK4, 4GGF, 4XJK, 5HLO, 5HLV
Ідентифікатори
Символи	S100A8, 60B8AG, CAGA, CFAG, CGLA, CP-10, L1Ag, MA387, MIF, MRP8, NIF, P8, S100 calcium binding protein A8, S100-A8
Зовнішні ІД	OMIM: 123885 MGI: 88244 HomoloGene: 2225 GeneCards: S100A8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Toll-like receptor 4 binding; • RAGE receptor binding; • microtubule binding; • GO:0001948 protein binding; • calcium ion binding; • arachidonic acid binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Цитоскелет; • гіалоплазма; • Екзосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • цитоплазма; • extracellular space; • secretory granule lumen; • intermediate filament cytoskeleton; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• regulation of inflammatory response; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • immune system process; • positive regulation of inflammatory response; • neutrophil chemotaxis; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • defense response to fungus; • response to ethanol; • chemokine production; • response to zinc ion; • acute inflammatory response; • defense response to bacterium; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • peptidyl-cysteine S-nitrosylation; • sequestering of zinc ion; • neutrophil aggregation; • response to lipopolysaccharide; • хемотаксис; • positive regulation of peptide secretion; • chronic inflammatory response; • astrocyte development; • Загоєння ран; • Апоптоз; • positive regulation of cell growth; • Автофагія; • inflammatory response; • regulation of cytoskeleton organization; • cytokine production; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • Вроджений імунітет; • toll-like receptor signaling pathway; • antimicrobial humoral response; • neutrophil degranulation; • autocrine signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6279
	20201
	ENSG00000143546
	ENSMUSG00000056054
	P05109
	P27005
	NM_002964; NM_001319196; NM_001319197; NM_001319198; NM_001319201
	NM_013650
	NP_001306125; NP_001306126; NP_001306127; NP_001306130; NP_002955
	NP_038678
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100A8 (англ. S100 calcium binding protein A8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 93 амінокислот, а молекулярна маса — 10 835[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLTELEKALN		SIIDVYHKYS		LIKGNFHAVY		RDDLKKLLET		ECPQYIRKKG
ADVWFKELDI		NTDGAVNFQE		FLILVIKMGV		AAHKKSHEES		HKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, хемотаксис, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Lagasse E., Clerc R.G. (1988). Cloning and expression of two human genes encoding calcium-binding proteins that are regulated during myeloid differentiation.. Mol. Cell. Biol. 8: 2402 — 2410. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.6.2402
Schaefer T., Sachse G.E., Gassen H.G. (1991). The calcium-binding protein MRP-8 is produced by human pulmonary tumor cells.. Biol. Chem. Hoppe-Seyler 372: 1 — 4. PubMed DOI:10.1515/bchm3.1991.372.1.1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454 — 458. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
Miyasaki K.T., Bodeau A.L., Murthy A.R., Lehrer R.I. (1993). In vitro antimicrobial activity of the human neutrophil cytosolic S-100 protein complex, calprotectin, against Capnocytophaga sputigena.. J. Dent. Res. 72: 517 — 523. PubMed DOI:10.1177/00220345930720020801
Ryckman C., Vandal K., Rouleau P., Talbot M., Tessier P.A. (2003). Proinflammatory activities of S100: proteins S100A8, S100A9, and S100A8/A9 induce neutrophil chemotaxis and adhesion.. J. Immunol. 170: 3233 — 3242. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.170.6.3233

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10498 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P05109 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10498 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P05109 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.