S100B

S100B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI
Ідентифікатори
Символи	S100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 calcium binding protein B
Зовнішні ІД	OMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • S100 protein binding; • protein homodimerization activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • tau protein binding; • signaling receptor binding; • RAGE receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ruffle; • extracellular region; • neuronal cell body; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • extracellular space;
Біологічний процес	• axonogenesis; • response to glucocorticoid; • пам'ять; • negative regulation of skeletal muscle cell differentiation; • central nervous system development; • astrocyte differentiation; • positive regulation of synaptic transmission; • positive regulation of cell population proliferation; • regulation of cell shape; • positive regulation of apoptotic process; • learning or memory; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • response to methylmercury; • проліферація; • Вроджений імунітет; • cellular response to hypoxia; • long-term synaptic potentiation; • positive regulation of myelination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6285
	20203
	ENSG00000160307
	ENSMUSG00000033208
	P04271
	P50114
	NM_006272
	NM_009115
	NP_006263
	NP_033141
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100B (англ. S100 calcium binding protein B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 713[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSELEKAMVA		LIDVFHQYSG		REGDKHKLKK		SELKELINNE		LSHFLEEIKE
QEVVDKVMET		LDNDGDGECD		FQEFMAFVAM		VTTACHEFFE		HE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Jensen R., Marshak D.R., Anderson C., Lukas T.J., Watterson D.M. (1985). Characterization of human brain S100 protein fraction: amino acid sequence of S100 beta.. J. Neurochem. 45: 700 — 705. PubMed DOI:10.1111/j.1471-4159.1985.tb04048.x
Baudier J., Glasser N., Haglid K., Gerard D. (1984). Purification, characterization and ion binding properties of human brain S100b protein.. Biochim. Biophys. Acta 790: 164 — 173. PubMed DOI:10.1016/0167-4838(84)90220-6
Yang Q., O'Hanlon D., Heizmann C.W., Marks A. (1999). Demonstration of heterodimer formation between S100B and S100A6 in the yeast two-hybrid system and human melanoma.. Exp. Cell Res. 246: 501 — 509. PubMed DOI:10.1006/excr.1998.4314
Park H., Adsit F.G., Boyington J.C. (2010). The 1.5 A crystal structure of human receptor for advanced glycation endproducts (RAGE) ectodomains reveals unique features determining ligand binding.. J. Biol. Chem. 285: 40762 — 40770. PubMed DOI:10.1074/jbc.M110.169276
Smith S.P., Shaw G.S. (1998). A novel calcium-sensitive switch revealed by the structure of human S100B in the calcium-bound form.. Structure 6: 211 — 222. PubMed DOI:10.1016/S0969-2126(98)00022-7

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P04271 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04271 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.