SCARB1

SCARB1
Ідентифікатори
Символи	SCARB1, CD36L1, CLA-1, CLA1, HDLQTL6, SR-BI, SRB1, scavenger receptor class B member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601040 MGI: 893578 HomoloGene: 21132 GeneCards: SCARB1
Пов'язані генетичні захворювання
	Рак нирки[1]
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• apolipoprotein binding; • protein homodimerization activity; • virus receptor activity; • transporter activity; • high-density lipoprotein particle receptor activity; • phosphatidylserine binding; • apolipoprotein A-I binding; • lipopolysaccharide binding; • low-density lipoprotein particle binding; • 1-phosphatidylinositol binding; • GO:0001948 protein binding; • high-density lipoprotein particle binding; • lipopolysaccharide immune receptor activity; • amyloid-beta binding; • scavenger receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • lysosomal membrane; • caveola; • Екзосома; • microvillus membrane;
Біологічний процес	• cholesterol import; • positive regulation of triglyceride biosynthetic process; • regulation of phosphatidylcholine catabolic process; • recognition of apoptotic cell; • lipid transport; • low-density lipoprotein particle clearance; • blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of cholesterol storage; • phospholipid transport; • cholesterol transport; • Загоєння ран; • cholesterol catabolic process; • Рецептор-опосередкований ендоцитоз; • high-density lipoprotein particle remodeling; • positive regulation of endothelial cell migration; • androgen biosynthetic process; • vitamin transmembrane transport; • positive regulation of nitric-oxide synthase activity; • endothelial cell proliferation; • lipopolysaccharide transport; • cholesterol efflux; • phagocytosis, recognition; • viral entry into host cell; • intestinal absorption; • cholesterol homeostasis; • regulation of phagocytosis; • GO:0051856 adhesion of symbiont to host; • GO:0022415 viral process; • detection of lipopolysaccharide; • triglyceride homeostasis; • reverse cholesterol transport; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • high-density lipoprotein particle clearance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	949
	20778
	ENSG00000073060
	ENSMUSG00000037936
	Q8WTV0
	Q61009
	NM_005505; NM_001082959
	NM_001205082; NM_001205083; NM_016741
NP_001076428; NP_005496; NP_001354910; NP_001354911; NP_001354912;
	NP_001354913; NP_001354914; NP_001354915; NP_001354916; NP_001354917; NP_001354918
	NP_001192011; NP_001192012; NP_058021
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCARB1 (англ. Scavenger receptor class B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 552 амінокислот, а молекулярна маса — 60 878[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCSAKARWA	AGALGVAGLL	CAVLGAVMIV	MVPSLIKQQV	LKNVRIDPSS
LSFNMWKEIP	IPFYLSVYFF	DVMNPSEILK	GEKPQVRERG	PYVYREFRHK
SNITFNNNDT	VSFLEYRTFQ	FQPSKSHGSE	SDYIVMPNIL	VLGAAVMMEN
KPMTLKLIMT	LAFTTLGERA	FMNRTVGEIM	WGYKDPLVNL	INKYFPGMFP
FKDKFGLFAE	LNNSDSGLFT	VFTGVQNISR	IHLVDKWNGL	SKVDFWHSDQ
CNMINGTSGQ	MWPPFMTPES	SLEFYSPEAC	RSMKLMYKES	GVFEGIPTYR
FVAPKTLFAN	GSIYPPNEGF	CPCLESGIQN	VSTCRFSAPL	FLSHPHFLNA
DPVLAEAVTG	LHPNQEAHSL	FLDIHPVTGI	PMNCSVKLQL	SLYMKSVAGI
GQTGKIEPVV	LPLLWFAESG	AMEGETLHTF	YTQLVLMPKV	MHYAQYVLLA
LGCVLLLVPV	ICQIRSQVGA	GQRAARADSH	SLACWGKGAS	DRTLWPTAAW
SPPPAAVLRL	CRSGSGHCWG	LRSTLASFAC	RVATTLPVLE	GLGPSLGGGT
GS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kawasaki Y., Nakagawa A., Nagaosa K., Shiratsuchi A., Nakanishi Y. (2002). Phosphatidylserine binding of class B scavenger receptor type I, a phagocytosis receptor of testicular Sertoli cells.. J. Biol. Chem. 277: 27559 — 27566. PubMed DOI:10.1074/jbc.M202879200
Philips J.A., Rubin E.J., Perrimon N. (2005). Drosophila RNAi screen reveals CD36 family member required for mycobacterial infection.. Science 309: 1251 — 1253. PubMed DOI:10.1126/science.1116006
Calvo D., Vega M. (1993). Identification, primary structure and distribution of CLA-1, a novel member of the CD36/LIMPII gene family.. J. Biol. Chem. 268: 18929 — 18935. PubMed
Webb N.R., de Villiers W.J., Connell P.M., de Beer F.C., van der Westhuyzen D.R. (1997). Alternative forms of the scavenger receptor BI (SR-BI).. J. Lipid Res. 38: 1490 — 1495. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1664 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q8WTV0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1664 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q8WTV0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.