SET

SET
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E50
Ідентифікатори
Символи	SET, 2PP2A, I2PP2A, IGAAD, IPP2A2, PHAPII, TAF-I, TAF-IBETA, SET nuclear proto-oncogene, MRD58
Зовнішні ІД	OMIM: 600960 MGI: 1860267 HomoloGene: 55707 GeneCards: SET
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • histone binding; • GO:0001948 protein binding; • protein phosphatase inhibitor activity; • protein phosphatase regulator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Нуклеоплазма; • ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • lipid droplet; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of neuron apoptotic process; • nucleosome assembly; • regulation of mRNA stability; • Реплікація ДНК; • nucleosome disassembly; • nucleocytoplasmic transport; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of histone acetylation; • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • regulation of phosphoprotein phosphatase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6418
	56086
	ENSG00000119335
	ENSMUSG00000054766
	Q01105
	Q9EQU5
	NM_001122821; NM_001248000; NM_001248001; NM_003011; NM_001374326
	NM_001204875; NM_023871
	NP_001116293; NP_001234929; NP_001234930; NP_003002; NP_001361255
	NP_001191804; NP_076360
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SET (англ. SET nuclear proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 33 489[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPKRQSPLP	PQKKKPRPPP	ALGPEETSAS	AGLPKKGEKE	QQEAIEHIDE
VQNEIDRLNE	QASEEILKVE	QKYNKLRQPF	FQKRSELIAK	IPNFWVTTFV
NHPQVSALLG	EEDEEALHYL	TRVEVTEFED	IKSGYRIDFY	FDENPYFENK
VLSKEFHLNE	SGDPSSKSTE	IKWKSGKDLT	KRSSQTQNKA	SRKRQHEEPE
SFFTWFTDHS	DAGADELGEV	IKDDIWPNPL	QYYLVPDMDD	EEGEGEEDDD
DDEEEEGLED	IDEEGDEDEG	EEDEDDDEGE	EGEEDEGEDD

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Li M., Makkinje A., Damuni Z. (1996). The myeloid leukemia-associated protein SET is a potent inhibitor of protein phosphatase 2A.. J. Biol. Chem. 271: 11059 — 11062. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.19.11059
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fan Z., Beresford P.J., Zhang D., Lieberman J. (2002). HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T-lymphocyte protease granzyme A.. Mol. Cell. Biol. 22: 2810 — 2820. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002
Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Tumor suppressor NM23-H1 is a granzyme A-activated DNase during CTL-mediated apoptosis, and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor.. Cell 112: 659 — 672. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(03)00150-8
Adachi Y., Pavlaki G.N., Copeland T.D. (1994). Identification and characterization of SET, a nuclear phosphoprotein encoded by the translocation break point in acute undifferentiated leukemia.. J. Biol. Chem. 269: 2258 — 2262. PubMed
Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Cell 115: 241 — 241.

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10760 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, Q01105 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10760 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q01105 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.