SMC2

SMC2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4U4P
Ідентифікатори
Символи	SMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, structural maintenance of chromosomes 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 GeneCards: SMC2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • ATP binding; • single-stranded DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • хромосома; • Нуклеоплазма; • Конденсин; • nuclear chromosome; • Ядерце; • Екзосома; • condensed chromosome; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• kinetochore organization; • meiotic chromosome condensation; • chromosome organization; • meiotic chromosome segregation; • поділ клітини; • chromosome condensation; • Клітинний цикл; • mitotic chromosome condensation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10592
	14211
	ENSG00000136824
	ENSMUSG00000028312
	O95347; Q05D74
	Q8CG48
	NM_001042550; NM_001042551; NM_001265602; NM_006444
	NM_001301412; NM_008017
	NP_001036015; NP_001036016; NP_001252531; NP_006435; NP_006435.2
	NP_001288341; NP_032043
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMC2 (англ. Structural maintenance of chromosomes 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 197 амінокислот, а молекулярна маса — 135 656[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHIKSIILEG	FKSYAQRTEV	NGFDPLFNAI	TGLNGSGKSN	ILDSICFLLG
ISNLSQVRAS	NLQDLVYKNG	QAGITKASVS	ITFDNSDKKQ	SPLGFEVHDE
ITVTRQVVIG	GRNKYLINGV	NANNTRVQDL	FCSVGLNVNN	PHFLIMQGRI
TKVLNMKPPE	ILSMIEEAAG	TRMYEYKKIA	AQKTIEKKEA	KLKEIKTILE
EEITPTIQKL	KEERSSYLEY	QKVMREIEHL	SRLYIAYQFL	LAEDTKVRSA
EELKEMQDKV	IKLQEELSEN	DKKIKALNHE	IEELEKRKDK	ETGGILRSLE
DALAEAQRVN	TKSQSAFDLK	KKNLACEESK	RKELEKNMVE	DSKTLAAKEK
EVKKITDGLH	ALQEASNKDA	EALAAAQQHF	NAVSAGLSSN	EDGAEATLAG
QMMACKNDIS	KAQTEAKQAQ	MKLKHAQQEL	KNKQAEVKKM	DSGYRKDQEA
LEAVKRLKEK	LEAEMKKLNY	EENKEESLLE	KRRQLSRDIG	RLKETYEALL
ARFPNLRFAY	KDPEKNWNRN	CVKGLVASLI	SVKDTSATTA	LELVAGERLY
NVVVDTEVTG	KKLLERGELK	RRYTIIPLNK	ISARCIAPET	LRVAQNLVGP
DNVHVALSLV	EYKPELQKAM	EFVFGTTFVC	DNMDNAKKVA	FDKRIMTRTV
TLGGDVFDPH	GTLSGGARSQ	AASILTKFQE	LKDVQDELRI	KENELRALEE
ELAGLKNTAE	KYRQLKQQWE	MKTEEADLLQ	TKLQQSSYHK	QQEELDALKK
TIEESEETLK	NTKEIQRKAE	EKYEVLENKM	KNAEAERERE	LKDAQKKLDC
AKTKADASSK	KMKEKQQEVE	AITLELEELK	REHTSYKQQL	EAVNEAIKSY
ESQIEVMAAE	VAKNKESVNK	AQEEVTKQKE	VITAQDTVIK	AKYAEVAKHK
EQNNDSQLKI	KELDHNISKH	KREAEDGAAK	VSKMLKDYDW	INAERHLFGQ
PNSAYDFKTN	NPKEAGQRLQ	KLQEMKEKLG	RNVNMRAMNV	LTEAEERYND
LMKKKRIVEN	DKSKILTTIE	DLDQKKNQAL	NIAWQKVNKD	FGSIFSTLLP
GANAMLAPPE	GQTVLDGLEF	KVALGNTWKE	NLTELSGGQR	SLVALSLILS
MLLFKPAPIY	ILDEVDAALD	LSHTQNIGQM	LRTHFTHSQF	IVVSLKEGMF
NNANVLFKTK	FVDGVSTVAR	FTQCQNGKIS	KEAKSKAKPP	KGAHVEV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications.. Mol. Biol. Evol. 21: 332 — 347. PubMed DOI:10.1093/molbev/msh023
Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation.. Mol. Cell. Biol. 20: 6996 — 7006. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts.. J. Biol. Chem. 276: 5417 — 5420. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000873200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14011 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, O95347 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14011 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95347 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.