SMC4

SMC4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4U4P
Ідентифікатори
Символи	SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity; • nucleotide binding; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • single-stranded DNA binding;
Клітинна компонента	• хромосома; • клітинне ядро; • Конденсин; • Нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• mitotic sister chromatid segregation; • meiotic chromosome segregation; • поділ клітини; • Клітинний цикл; • kinetochore organization; • mitotic chromosome condensation; • meiotic chromosome condensation; • chromosome condensation; • chromosome organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10051
	70099
	ENSG00000113810
	ENSMUSG00000034349
	Q9NTJ3
	Q8CG47
	NM_001002799; NM_001002800; NM_001288753; NM_005496
	NM_133786; NM_001356976
	NP_001002800; NP_001275682; NP_005487
	NP_598547; NP_001343905
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMC4 (англ. Structural maintenance of chromosomes 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 288 амінокислот, а молекулярна маса — 147 182[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRKGTQPST	ARRREEGPPP	PSPDGASSDA	EPEPPSGRTE	SPATAAETAS
EELDNRSLEE	ILNSIPPPPP	PAMTNEAGAP	RLMITHIVNQ	NFKSYAGEKI
LGPFHKRFSC	IIGPNGSGKS	NVIDSMLFVF	GYRAQKIRSK	KLSVLIHNSD
EHKDIQSCTV	EVHFQKIIDK	EGDDYEVIPN	SNFYVSRTAC	RDNTSVYHIS
GKKKTFKDVG	NLLRSHGIDL	DHNRFLILQG	EVEQIAMMKP	KGQTEHDEGM
LEYLEDIIGC	GRLNEPIKVL	CRRVEILNEH	RGEKLNRVKM	VEKEKDALEG
EKNIAIEFLT	LENEIFRKKN	HVCQYYIYEL	QKRIAEMETQ	KEKIHEDTKE
INEKSNILSN	EMKAKNKDVK	DTEKKLNKIT	KFIEENKEKF	TQLDLEDVQV
REKLKHATSK	AKKLEKQLQK	DKEKVEEFKS	IPAKSNNIIN	ETTTRNNALE
KEKEKEEKKL	KEVMDSLKQE	TQGLQKEKES	REKELMGFSK	SVNEARSKMD
VAQSELDIYL	SRHNTAVSQL	TKAKEALIAA	SETLKERKAA	IRDIEGKLPQ
TEQELKEKEK	ELQKLTQEET	NFKSLVHDLF	QKVEEAKSSL	AMNRSRGKVL
DAIIQEKKSG	RIPGIYGRLG	DLGAIDEKYD	VAISSCCHAL	DYIVVDSIDI
AQECVNFLKR	QNIGVATFIG	LDKMAVWAKK	MTEIQTPENT	PRLFDLVKVK
DEKIRQAFYF	ALRDTLVADN	LDQATRVAYQ	KDRRWRVVTL	QGQIIEQSGT
MTGGGSKVMK	GRMGSSLVIE	ISEEEVNKME	SQLQNDSKKA	MQIQEQKVQL
EERVVKLRHS	EREMRNTLEK	FTASIQRLIE	QEEYLNVQVK	ELEANVLATA
PDKKKQKLLE	ENVSAFKTEY	DAVAEKAGKV	EAEVKRLHNT	IVEINNHKLK
AQQDKLDKIN	KQLDECASAI	TKAQVAIKTA	DRNLQKAQDS	VLRTEKEIKD
TEKEVDDLTA	ELKSLEDKAA	EVVKNTNAAE	ESLPEIQKEH	RNLLQELKVI
QENEHALQKD	ALSIKLKLEQ	IDGHIAEHNS	KIKYWHKEIS	KISLHPIEDN
PIEEISVLSP	EDLEAIKNPD	SITNQIALLE	ARCHEMKPNL	GAIAEYKKKE
ELYLQRVAEL	DKITYERDSF	RQAYEDLRKQ	RLNEFMAGFY	IITNKLKENY
QMLTLGGDAE	LELVDSLDPF	SEGIMFSVRP	PKKSWKKIFN	LSGGEKTLSS
LALVFALHHY	KPTPLYFMDE	IDAALDFKNV	SIVAFYIYEQ	TKNAQFIIIS
LRNNMFEISD	RLIGIYKTYN	ITKSVAVNPK	EIASKGLC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation.. Mol. Cell. Biol. 20: 6996 — 7006. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts.. J. Biol. Chem. 276: 5417 — 5420. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000873200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14013 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q9NTJ3 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14013 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NTJ3 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.