SMC6
SMC6 (англ. Structural maintenance of chromosomes 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 091 амінокислот, а молекулярна маса — 126 326[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAKRKEENFS | SPKNAKRPRQ | EELEDFDKDG | DEDECKGTTL | TAAEVGIIES | ||||
| IHLKNFMCHS | MLGPFKFGSN | VNFVVGNNGS | GKSAVLTALI | VGLGGRAVAT | ||||
| NRGSSLKGFV | KDGQNSADIS | ITLRNRGDDA | FKASVYGNSI | LIQQHISIDG | ||||
| SRSYKLKSAT | GSVVSTRKEE | LIAILDHFNI | QVDNPVSVLT | QEMSKQFLQS | ||||
| KNEGDKYKFF | MKATQLEQMK | EDYSYIMETK | ERTKEQIHQG | EERLTELKRQ | ||||
| CVEKEERFQS | IAGLSTMKTN | LESLKHEMAW | AVVNEIEKQL | NAIRDNIKIG | ||||
| EDRAARLDRK | MEEQQVRLNE | AEQKYKDIQD | KLEKISEETN | ARAPECMALK | ||||
| ADVVAKKRAY | NEAEVLYNRS | LNEYKALKKD | DEQLCKRIEE | LKKSTDQSLE | ||||
| PERLERQKKI | SWLKERVKAF | QNQENSVNQE | IEQFQQAIEK | DKEEHGKIKR | ||||
| EELDVKHALS | YNQRQLKELK | DSKTDRLKRF | GPNVPALLEA | IDDAYRQGHF | ||||
| TYKPVGPLGA | CIHLRDPELA | LAIESCLKGL | LQAYCCHNHA | DERVLQALMK | ||||
| RFYLPGTSRP | PIIVSEFRNE | IYDVRHRAAY | HPDFPTVLTA | LEIDNAVVAN | ||||
| SLIDMRGIET | VLLIKNNSVA | RAVMQSQKPP | KNCREAFTAD | GDQVFAGRYY | ||||
| SSENTRPKFL | SRDVDSEISD | LENEVENKTA | QILNLQQHLS | ALEKDIKHNE | ||||
| ELLKRCQLHY | KELKMKIRKN | ISEIRELENI | EEHQSVDIAT | LEDEAQENKS | ||||
| KMKMVEEHME | QQKENMEHLK | SLKIEAENKY | DAIKFKINQL | SELADPLKDE | ||||
| LNLADSEVDN | QKRGKRHYEE | KQKEHLDTLN | KKKRELDMKE | KELEEKMSQA | ||||
| RQICPERIEV | EKSASILDKE | INRLRQKIQA | EHASHGDREE | IMRQYQEARE | ||||
| TYLDLDSKVR | TLKKFIKLLG | EIMEHRFKTY | QQFRRCLTLR | CKLYFDNLLS | ||||
| QRAYCGKMNF | DHKNETLSIS | VQPGEGNKAA | FNDMRALSGG | ERSFSTVCFI | ||||
| LSLWSIAESP | FRCLDEFDVY | MDMVNRRIAM | DLILKMADSQ | RFRQFILLTP | ||||
| QSMSSLPSSK | LIRILRMSDP | ERGQTTLPFR | PVTQEEDDDQ | R |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Harvey S.H., Sheedy D.M., Cuddihy A.R., O'Connell M.J. (2004). Coordination of DNA damage responses via the Smc5/Smc6 complex.. Mol. Cell. Biol. 24: 662 — 674. PubMed DOI:10.1128/MCB.24.2.662-674.2004
- Potts P.R., Yu H. (2005). Human MMS21/NSE2 is a SUMO ligase required for DNA repair.. Mol. Cell. Biol. 25: 7021 — 7032. PubMed DOI:10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005
- Potts P.R., Porteus M.H., Yu H. (2006). Human SMC5/6 complex promotes sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1/3 cohesin complex to double-strand breaks.. EMBO J. 25: 3377 — 3388. PubMed DOI:10.1038/sj.emboj.7601218
- Potts P.R., Yu H. (2007). The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins.. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 581 — 590. PubMed DOI:10.1038/nsmb1259
- Taylor E.M., Copsey A.C., Hudson J.J., Vidot S., Lehmann A.R. (2008). Identification of the proteins, including MAGEG1, that make up the human SMC5-6 protein complex.. Mol. Cell. Biol. 28: 1197 — 1206. PubMed DOI:10.1128/MCB.00767-07
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20466 (англ.). Процитовано 29 серпня 2017.
- UniProt, Q96SB8 (англ.). Процитовано 29 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.