SNAI1

SNAI1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Y48, 3W5K, 4QLI
Ідентифікатори
Символи	SNAI1, SLUGH2, SNA, SNAH, SNAIL, SNAIL1, dJ710H13.1, snail family zinc finger 1, snail family transcriptional repressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • kinase binding; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • E-box binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма; • Нуклеоплазма; • pericentric heterochromatin; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• trophoblast giant cell differentiation; • roof of mouth development; • regulation of bicellular tight junction assembly; • positive regulation of cell migration; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • multicellular organism development; • negative regulation of vitamin D biosynthetic process; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • osteoblast differentiation; • negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development; • cartilage morphogenesis; • hair follicle morphogenesis; • left/right pattern formation; • mesoderm development; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • cell migration; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • Notch signaling involved in heart development; • mesoderm formation; • Епітеліально-мезенхімальний перехід; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • heterochromatin organization; • aortic valve morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6615
	20613
	ENSG00000124216
	ENSMUSG00000042821
	O95863
	Q02085
	NM_005985
	NM_011427
	NP_005976
	NP_035557
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNAI1 (англ. Snail family transcriptional repressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 264 амінокислот, а молекулярна маса — 29 083[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRSFLVRKP	SDPNRKPNYS	ELQDSNPEFT	FQQPYDQAHL	LAAIPPPEIL
NPTASLPMLI	WDSVLAPQAQ	PIAWASLRLQ	ESPRVAELTS	LSDEDSGKGS
QPPSPPSPAP	SSFSSTSVSS	LEAEAYAAFP	GLGQVPKQLA	QLSEAKDLQA
RKAFNCKYCN	KEYLSLGALK	MHIRSHTLPC	VCGTCGKAFS	RPWLLQGHVR
THTGEKPFSC	PHCSRAFADR	SNLRAHLQTH	SDVKKYQCQA	CARTFSRMSL
LHKHQESGCS	GCPR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Twigg S.R., Wilkie A.O.M. (1999). Characterisation of the human snail (SNAI1) gene and exclusion as a major disease gene in craniosynostosis.. Hum. Genet. 105: 320 — 326. PubMed DOI:10.1007/s004399900143
Paznekas W.A., Okajima K., Schertzer M., Wood S., Jabs E.W. (1999). Genomic organization, expression, and chromosome location of the human SNAIL gene (SNAI1) and a related processed pseudogene (SNAI1P).. Genomics 62: 42 — 49. PubMed DOI:10.1006/geno.1999.6010
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yook J.I., Li X.Y., Ota I., Fearon E.R., Weiss S.J. (2005). Wnt-dependent regulation of the E-cadherin repressor snail.. J. Biol. Chem. 280: 11740 — 11748. PubMed DOI:10.1074/jbc.M413878200
Mingot J.M., Vega S., Maestro B., Sanz J.M., Nieto M.A. (2009). Characterization of Snail nuclear import pathways as representatives of C2H2 zinc finger transcription factors.. J. Cell Sci. 122: 1452 — 1460. PubMed DOI:10.1242/jcs.041749
Lim S.O., Kim H., Jung G. (2010). p53 inhibits tumor cell invasion via the degradation of snail protein in hepatocellular carcinoma.. FEBS Lett. 584: 2231 — 2236. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2010.04.006

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11128 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O95863 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11128 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95863 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.