STUB1

STUB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4KBQ
Ідентифікатори
Символи	STUB1, CHIP, HSPABP2, NY-CO-7, SCAR16, SDCCAG7, UBOX1, STIP1 homology and U-box containing protein 1, SCA48
Зовнішні ІД	OMIM: 607207 MGI: 1891731 HomoloGene: 4281 GeneCards: STUB1
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal recessive spinocerebellar ataxia 16[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp90 protein binding; • protein-macromolecule adaptor activity; • protein homodimerization activity; • misfolded protein binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin-ubiquitin ligase activity; • kinase binding; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • TPR domain binding; • G protein-coupled receptor binding; • ubiquitin protein ligase binding; • transferase activity; • Hsp70 protein binding; • SMAD binding; • heat shock protein binding; • tau protein binding; • chaperone binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ubiquitin ligase complex; • Нуклеоплазма; • Z disc; • Ендоплазматичний ретикулум; • nuclear inclusion body; • Екзосома; • ubiquitin conjugating enzyme complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • chaperone complex;
Біологічний процес	• positive regulation of chaperone-mediated protein complex assembly; • regulation of protein stability; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of glucocorticoid metabolic process; • protein K63-linked ubiquitination; • protein maturation; • protein polyubiquitination; • protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins; • negative regulation of protein binding; • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process; • cellular response to DNA damage stimulus; • Відповідь на незгорнуті білки; • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • Убіквітин-залежний протеоліз; • positive regulation of protein ubiquitination; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Репарація ДНК; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein autoubiquitination; • cellular response to misfolded protein; • ERBB2 signaling pathway; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • response to ischemia; • cellular response to heat; • chaperone-mediated autophagy; • cellular response to hypoxia;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10273
	56424
	ENSG00000103266
	ENSMUSG00000039615
	Q9UNE7
	Q9WUD1
	NM_005861; NM_001293197
	NM_019719
	NP_001280126; NP_005852
	NP_062693
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STUB1 (англ. STIP1 homology and U-box containing protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 303 амінокислот, а молекулярна маса — 34 856[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGKEEKEGG	ARLGAGGGSP	EKSPSAQELK	EQGNRLFVGR	KYPEAAACYG
RAITRNPLVA	VYYTNRALCY	LKMQQHEQAL	ADCRRALELD	GQSVKAHFFL
GQCQLEMESY	DEAIANLQRA	YSLAKEQRLN	FGDDIPSALR	IAKKKRWNSI
EERRIHQESE	LHSYLSRLIA	AERERELEEC	QRNHEGDEDD	SHVRAQQACI
EAKHDKYMAD	MDELFSQVDE	KRKKRDIPDY	LCGKISFELM	REPCITPSGI
TYDRKDIEEH	LQRVGHFDPV	TRSPLTQEQL	IPNLAMKEVI	DAFISENGWV
EDY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hatakeyama S., Yada M., Matsumoto M., Ishida N., Nakayama K.I. (2001). U box proteins as a new family of ubiquitin-protein ligases.. J. Biol. Chem. 276: 33111 — 33120. PubMed DOI:10.1074/jbc.M102755200
Alberti S., Boehse K., Arndt V., Schmitz A., Hoehfeld J. (2004). The cochaperone HspBP1 inhibits the CHIP ubiquitin ligase and stimulates the maturation of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator.. Mol. Biol. Cell 15: 4003 — 4010. PubMed DOI:10.1091/mbc.E04-04-0293
Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology.. Biochem. J. 409: 723 — 729. PubMed DOI:10.1042/BJ20071338
Annamalai B., Liu X., Gopal U., Isaacs J.S. (2009). Hsp90 is an essential regulator of EphA2 receptor stability and signaling: implications for cancer cell migration and metastasis.. Mol. Cancer Res. 7: 1021 — 1032. PubMed DOI:10.1158/1541-7786.MCR-08-0582
Tatham M.H., Plechanovova A., Jaffray E.G., Salmen H., Hay R.T. (2013). Ube2W conjugates ubiquitin to alpha-amino groups of protein N-termini.. Biochem. J. 453: 137 — 145. PubMed DOI:10.1042/BJ20130244

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з STUB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11427 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9UNE7 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з STUB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11427 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9UNE7 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.