SYT4

SYT4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UGK
Ідентифікатори
Символи	SYT4, HsT1192, synaptotagmin 4
Зовнішні ІД	OMIM: 600103 MGI: 101759 HomoloGene: 7559 GeneCards: SYT4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • clathrin binding; • phosphatidylserine binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • SNARE binding; • syntaxin-1 binding; • syntaxin binding; • syntaxin-3 binding; • protein homodimerization activity; • protein heterodimerization activity; • calcium-dependent phospholipid binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • Синапс; • synaptic vesicle membrane; • Міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • neuron projection; • dense core granule; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • Дендрит (нейробіологія); • комплекс Ґольджі; • везикула; • Аксон; • клітинна мембрана; • Синаптичні бульбашки; • integral component of Golgi membrane; • integral component of synaptic vesicle membrane; • secretory granule membrane; • dense core granule membrane; • somatodendritic compartment; • neuronal cell body; • neuron projection terminus; • exocytic vesicle; • astrocyte projection; • microvesicle; • glutamatergic synapse; • integral component of neuronal dense core vesicle membrane;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • brain development; • positive regulation of dendrite extension; • negative regulation of vesicle fusion; • GO:0010554 neurotransmitter secretion; • Екзоцитоз; • vesicle fusion; • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter; • пам'ять; • positive regulation of glutamate secretion; • regulation of dopamine secretion; • regulation of endocytosis; • regulation of vesicle fusion; • negative regulation of catecholamine secretion; • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • negative regulation of neurotransmitter secretion; • negative regulation of short-term neuronal synaptic plasticity; • vesicle fusion with vesicle; • secretory granule maturation; • negative regulation of protein secretion; • negative regulation of retrograde trans-synaptic signaling by neuropeptide; • regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission; • vesicle-mediated transport; • calcium-ion regulated exocytosis; • cellular response to calcium ion; • regulation of presynaptic dense core granule exocytosis; • negative regulation of dense core granule exocytosis; • positive regulation of dense core granule exocytosis; • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6860
	20983
	ENSG00000132872
	ENSMUSG00000024261
	Q9H2B2
	P40749
	NM_020783
	NM_009308
	NP_065834
	NP_033334
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SYT4 (англ. Synaptotagmin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 958[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPITTSREE	FDEIPTVVGI	FSAFGLVFTV	SLFAWICCQR	KSSKSNKTPP
YKFVHVLKGV	DIYPENLNSK	KKFGADDKNE	VKNKPAVPKN	SLHLDLEKRD
LNGNFPKTNL	KPGSPSDLEN	ATPKLFLEGE	KESVSPESLK	SSTSLTSEEK
QEKLGTLFFS	LEYNFERKAF	VVNIKEARGL	PAMDEQSMTS	DPYIKMTILP
EKKHKVKTRV	LRKTLDPAFD	ETFTFYGIPY	TQIQELALHF	TILSFDRFSR
DDIIGEVLIP	LSGIELSEGK	MLMNREIIKR	NVRKSSGRGE	LLISLCYQST
TNTLTVVVLK	ARHLPKSDVS	GLSDPYVKVN	LYHAKKRISK	KKTHVKKCTP
NAVFNELFVF	DIPCEGLEDI	SVEFLVLDSE	RGSRNEVIGQ	LVLGAAAEGT
GGEHWKEICD	YPRRQIAKWH	VLCDG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Ferguson G.D., Chen X.-N., Korenberg J.R., Herschman H.R. (2000). The human synaptotagmin IV gene defines an evolutionary break point between syntenic mouse and human chromosome regions but retains ligand inducibility and tissue specificity.. J. Biol. Chem. 275: 36920 — 36926. PubMed DOI:10.1074/jbc.M005801200
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 65 — 73. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11512 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9H2B2 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11512 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H2B2 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.