SYT7

SYT7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D8K
Ідентифікатори
Символи	SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7
Зовнішні ІД	OMIM: 604146 MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 GeneCards: SYT7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • SNARE binding; • syntaxin binding; • clathrin binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • calcium-dependent phospholipid binding; • calmodulin binding; • phosphatidylserine binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • Синапс; • synaptic vesicle membrane; • Міжклітинні контакти; • terminal bouton; • dense core granule; • Екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • transport vesicle membrane; • гіалоплазма; • Синаптичні бульбашки; • presynaptic membrane; • Лізосома; • Пероксисома; • peroxisomal membrane; • phagocytic vesicle membrane; • клітинна мембрана; • lysosomal membrane; • early phagosome; • Дендрит (нейробіологія); • neuronal cell body; • axon terminus; • Аксон; • neuron projection; • exocytic vesicle; • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• regulation of insulin secretion; • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • Екзоцитоз; • regulation of bone remodeling; • plasma membrane repair; • calcium-ion regulated exocytosis; • regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter; • regulation of glucagon secretion; • phagosome-lysosome fusion; • synaptic vesicle recycling; • vesicle-mediated cholesterol transport; • regulation of phagocytosis; • vesicle fusion; • calcium ion regulated lysosome exocytosis; • Фагоцитоз; • regulation of dopamine secretion; • short-term synaptic potentiation; • vesicle-mediated transport; • cellular response to calcium ion; • calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion; • regulation of synaptic vesicle endocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9066
	54525
	ENSG00000011347
	ENSMUSG00000024743
	O43581
	Q9R0N7
NM_001252065; NM_001300773; NM_004200; NM_001365809; NM_001370210;
	NM_001370211
	NM_018801; NM_173067; NM_173068; NM_001373944
NP_001238994; NP_001287702; NP_004191; NP_001352738; NP_001357139;
	NP_001357140
	NP_061271; NP_775090; NP_775091
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SYT7 (англ. Synaptotagmin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 501[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYRDPEAASP	GAPSRDVLLV	SAIITVSLSV	TVVLCGLCHW	CQRKLGKRYK
NSLETVGTPD	SGRGRSEKKA	IKLPAGGKAV	NTAPVPGQTP	HDESDRRTEP
RSSVSDLVNS	LTSEMLMLSP	GSEEDEAHEG	CSRENLGRIQ	FSVGYNFQES
TLTVKIMKAQ	ELPAKDFSGT	SDPFVKIYLL	PDKKHKLETK	VKRKNLNPHW
NETFLFEGFP	YEKVVQRILY	LQVLDYDRFS	RNDPIGEVSI	PLNKVDLTQM
QTFWKDLKPC	SDGSGSRGEL	LLSLCYNPSA	NSIIVNIIKA	RNLKAMDIGG
TSDPYVKVWL	MYKDKRVEKK	KTVTMKRNLN	PIFNESFAFD	IPTEKLRETT
IIITVMDKDK	LSRNDVIGKI	YLSWKSGPGE	VKHWKDMIAR	PRQPVAQWHQ
LKA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, пероксисомах, синапсах.

Література

Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes.. Genomics 49: 419 — 429. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5291
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Caler E.V., Chakrabarti S., Fowler K.T., Rao S., Andrews N.W. (2001). The Exocytosis-regulatory protein synaptotagmin VII mediates cell invasion by Trypanosoma cruzi.. J. Exp. Med. 193: 1097 — 1104. PubMed DOI:10.1084/jem.193.9.1097
Fukuda M., Ogata Y., Saegusa C., Kanno E., Mikoshiba K. (2002). Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human.. Biochem. J. 365: 173 — 180. PubMed DOI:10.1042/BJ20011877
Chakrabarti S., Andrade L.O., Andrews N.W. (2005). Trypanosoma cruzi invades synaptotagmin VII-deficient cells by a PI-3 kinase independent pathway.. Mol. Biochem. Parasitol. 141: 125 — 128. PubMed DOI:10.1016/j.molbiopara.2005.01.016
Brandt D.S., Coffman M.D., Falke J.J., Knight J.D. (2012). Hydrophobic contributions to the membrane docking of synaptotagmin 7 C2A domain: mechanistic contrast between isoforms 1 and 7.. Biochemistry 51: 7654 — 7664. PubMed DOI:10.1021/bi3007115

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, O43581 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O43581 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.