TCF3

TCF3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MH0, 2YPA, 2YPB, 3U5V
Ідентифікатори
Символи	TCF3, E2A, E47, ITF1, TCF-3, VDIR, bHLHb21, AGM8, transcription factor 3, p75
Зовнішні ІД	OMIM: 147141 MGI: 98510 HomoloGene: 2408 GeneCards: TCF3
Пов'язані генетичні захворювання
	лімфогранульоматоз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein dimerization activity; • protein homodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding; • vitamin D response element binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • bHLH transcription factor binding; • E-box binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription regulator complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • клітинне ядро; • nuclear speck; • Нуклеоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of muscle cell differentiation; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • B cell lineage commitment; • positive regulation of cell cycle; • positive regulation of B cell proliferation; • positive regulation of neuron differentiation; • B cell differentiation; • immunoglobulin V(D)J recombination; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6929
	21423
	ENSG00000071564
	ENSMUSG00000020167
	P15923
	P15806
	NM_001136139; NM_003200; NM_001351778; NM_001351779
NM_001164147; NM_001164148; NM_001164149; NM_001164150; NM_001164151;
	NM_001164152; NM_001164153; NM_011548; NM_001378903; NM_001378904; NM_001378905; NM_001378908; NM_001378910; NM_001378912; NM_001378913; NM_001378914
	NP_001129611; NP_003191; NP_001338707; NP_001338708
NP_001157619; NP_001157620; NP_001157621; NP_001157622; NP_001157623;
	NP_001157624; NP_001157625; NP_035678; NP_001365832; NP_001365833; NP_001365834; NP_001365837; NP_001365839; NP_001365841; NP_001365842; NP_001365843
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TCF3 (англ. Transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 67 600[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQPQRMAPV	GTDKELSDLL	DFSMMFPLPV	TNGKGRPASL	AGAQFGGSGL
EDRPSSGSWG	SGDQSSSSFD	PSRTFSEGTH	FTESHSSLSS	STFLGPGLGG
KSGERGAYAS	FGRDAGVGGL	TQAGFLSGEL	ALNSPGPLSP	SGMKGTSQYY
PSYSGSSRRR	AADGSLDTQP	KKVRKVPPGL	PSSVYPPSSG	EDYGRDATAY
PSAKTPSSTY	PAPFYVADGS	LHPSAELWSP	PGQAGFGPML	GGGSSPLPLP
PGSGPVGSSG	SSSTFGGLHQ	HERMGYQLHG	AEVNGGLPSA	SSFSSAPGAT
YGGVSSHTPP	VSGADSLLGS	RGTTAGSSGD	ALGKALASIY	SPDHSSNNFS
SSPSTPVGSP	QGLAGTSQWP	RAGAPGALSP	SYDGGLHGLQ	SKIEDHLDEA
IHVLRSHAVG	TAGDMHTLLP	GHGALASGFT	GPMSLGGRHA	GLVGGSHPED
GLAGSTSLMH	NHAALPSQPG	TLPDLSRPPD	SYSGLGRAGA	TAAASEIKRE
EKEDEENTSA	ADHSEEEKKE	LKAPRARTSP	DEDEDDLLPP	EQKAEREKER
RVANNARERL	RVRDINEAFK	ELGRMCQLHL	NSEKPQTKLL	ILHQAVSVIL
NLEQQVRERN	LNPKAACLKR	REEEKVSGVV	GDPQMVLSAP	HPGLSEAHNP
AGHM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kamps M.P., Murre C., Sun X.-H., Baltimore D. (1990). A new homeobox gene contributes the DNA binding domain of the t(1;19) translocation protein in pre-B ALL.. Cell 60: 547 — 555. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(90)90658-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Murre C., McCaw P.S., Baltimore D. (1989). A new DNA binding and dimerization motif in immunoglobulin enhancer binding, daughterless, MyoD, and myc proteins.. Cell 56: 777 — 783. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(89)90682-X
Henthorn P., McCarrick-Walmsley R., Kadesch T. (1990). Sequence of the cDNA encoding ITF-1, a positive-acting transcription factor.. Nucleic Acids Res. 18: 677 — 677. PubMed DOI:10.1093/nar/18.3.677
Zhang Y., Bina M. (1991). Sequence of a HeLa cDNA provides the DNA binding domain and carboxy terminus of HE47: a human helix-loop-helix protein related to the enhancer binding factor E47.. DNA Seq. 2: 197 — 202. PubMed DOI:10.3109/10425179109039690
Henthorn P., Kiledjian M., Kadesch T. (1990). Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif.. Science 247: 467 — 470. PubMed DOI:10.1126/science.2105528

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TCF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11633 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P15923 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TCF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11633 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P15923 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.