TERF2

TERF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H6P, 1VF9, 1VFC, 1W0U, 1XG1, 3BU8, 3BUA, 3K6G, 3SJM, 4M7C, 4RQI
Ідентифікатори
Символи	TERF2, TRBF2, TRF2, telomeric repeat binding factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602027 MGI: 1195972 HomoloGene: 4133 GeneCards: TERF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • double-stranded telomeric DNA binding; • protein homodimerization activity; • telomeric DNA binding; • telomerase activity; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • G-rich strand telomeric DNA binding; • enzyme binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• nuclear telomere cap complex; • хромосома; • Теломера; • Mre11 complex; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Ядерні тільця; • shelterin complex; • axon cytoplasm;
Біологічний процес	• negative regulation of telomere single strand break repair; • regulation of telomere maintenance; • negative regulation of telomere maintenance via semi-conservative replication; • negative regulation of gene expression; • negative regulation of beta-galactosidase activity; • protein localization to chromosome, telomeric region; • клітинне старіння; • negative regulation of telomere capping; • positive regulation of gene expression; • positive regulation of nitric-oxide synthase activity; • negative regulation of t-circle formation; • Клітинний цикл; • telomeric loop formation; • negative regulation of cellular senescence; • telomere capping; • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening; • negative regulation of exonuclease activity; • telomeric D-loop disassembly; • negative regulation of telomeric D-loop disassembly; • negative regulation of telomere maintenance via recombination; • telomere maintenance; • RNA-dependent DNA biosynthetic process; • negative regulation of telomere maintenance; • regulation of telomere maintenance via telomerase; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • protection from non-homologous end joining at telomere; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • anterograde axonal transport of messenger ribonucleoprotein complex;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7014
	21750
	ENSG00000132604
	ENSMUSG00000031921
	Q15554
	O35144
	NM_005652
	NM_001083118; NM_001286200; NM_009353
	NP_005643
NP_001076587; NP_001273129; NP_033379; NP_001357994; NP_001357995;
	NP_001357996
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TERF2 (англ. Telomeric repeat binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот, а молекулярна маса — 59 594[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGAGTAGP	ASGPGVVRDP	AASQPRKRPG	REGGEGARRS	DTMAGGGGSS
DGSGRAAGRR	ASRSSGRARR	GRHEPGLGGP	AERGAGEARL	EEAVNRWVLK
FYFHEALRAF	RGSRYGDFRQ	IRDIMQALLV	RPLGKEHTVS	RLLRVMQCLS
RIEEGENLDC	SFDMEAELTP	LESAINVLEM	IKTEFTLTEA	VVESSRKLVK
EAAVIICIKN	KEFEKASKIL	KKHMSKDPTT	QKLRNDLLNI	IREKNLAHPV
IQNFSYETFQ	QKMLRFLESH	LDDAEPYLLT	MAKKALKSES	AASSTGKEDK
QPAPGPVEKP	PREPARQLRN	PPTTIGMMTL	KAAFKTLSGA	QDSEAAFAKL
DQKDLVLPTQ	ALPASPALKN	KRPRKDENES	SAPADGEGGS	ELQPKNKRMT
ISRLVLEEDS	QSTEPSAGLN	SSQEAASAPP	SKPTVLNQPL	PGEKNPKVPK
GKWNSSNGVE	EKETWVEEDE	LFQVQAAPDE	DSTTNITKKQ	KWTVEESEWV
KAGVQKYGEG	NWAAISKNYP	FVNRTAVMIK	DRWRTMKRLG	MN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Broccoli D., Smogorzewska A., Chong L., de Lange T. (1997). Human telomeres contain two distinct Myb-related proteins, TRF1 and TRF2.. Nat. Genet. 17: 231 — 235. PubMed DOI:10.1038/ng1097-231
van Steensel B., Smogorzewska A., de Lange T. (1998). TRF2 protects human telomeres from end-to-end fusions.. Cell 92: 401 — 413. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80932-0
Zhu X.-D., Kuester B., Mann M., Petrini J.H.J., de Lange T. (2000). Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres.. Nat. Genet. 25: 347 — 352. PubMed DOI:10.1038/77139
Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins.. J. Biol. Chem. 279: 51338 — 51342. PubMed DOI:10.1074/jbc.M409293200
de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres.. Genes Dev. 19: 2100 — 2110. PubMed DOI:10.1101/gad.1346005

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11729 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q15554 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11729 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15554 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.