TERF2IP

TERF2IP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FEX, 3K6G, 4RQI
Ідентифікатори
Символи	TERF2IP, DRIP5, RAP1, TERF2 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 605061 MGI: 1929871 HomoloGene: 10357 GeneCards: TERF2IP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • telomeric DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • G-rich strand telomeric DNA binding; • phosphatase binding;
Клітинна компонента	• nuclear telomere cap complex; • nuclear envelope; • хромосома; • shelterin complex; • Теломера; • nuclear chromosome; • Mre11 complex; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Ядерні тільця; • цитоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of DNA recombination at telomere; • telomere maintenance via telomerase; • protection from non-homologous end joining at telomere; • regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • protein localization to chromosome, telomeric region; • positive regulation of protein acetylation; • telomere maintenance via telomere lengthening; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • telomere maintenance; • telomere capping; • negative regulation of protein phosphorylation; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of telomere maintenance; • negative regulation of telomere maintenance; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54386
	57321
	ENSG00000166848
	ENSMUSG00000033430
	Q9NYB0
	Q91VL8
	NM_018975
	NM_020584
	NP_061848
	NP_065609
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TERF2IP (англ. TERF2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 260[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEAMDLGKD	PNGPTHSSTL	FVRDDGSSMS	FYVRPSPAKR	RLSTLILHGG
GTVCRVQEPG	AVLLAQPGEA	LAEASGDFIS	TQYILDCVER	NERLELEAYR
LGPASAADTG	SEAKPGALAE	GAAEPEPQRH	AGRIAFTDAD	DVAILTYVKE
NARSPSSVTG	NALWKAMEKS	SLTQHSWQSL	KDRYLKHLRG	QEHKYLLGDA
PVSPSSQKLK	RKAEEDPEAA	DSGEPQNKRT	PDLPEEEYVK	EEIQENEEAV
KKMLVEATRE	FEEVVVDESP	PDFEIHITMC	DDDPPTPEED	SETQPDEEEE
EEEEKVSQPE	VGAAIKIIRQ	LMEKFNLDLS	TVTQAFLKNS	GELEATSAFL
ASGQRADGYP	IWSRQDDIDL	QKDDEDTREA	LVKKFGAQNV	ARRIEFRKK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Li B., Oestreich S., de Lange T. (2000). Identification of human RAP1: implications for telomere evolution.. Cell 101: 471 — 483. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80858-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes.. Gene 323: 1 — 10. PubMed DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins.. J. Biol. Chem. 279: 51338 — 51342. PubMed DOI:10.1074/jbc.M409293200
de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres.. Genes Dev. 19: 2100 — 2110. PubMed DOI:10.1101/gad.1346005
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19246 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9NYB0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19246 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NYB0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.