THRB

THRB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BSX, 1N46, 1NAX, 1NQ0, 1NQ1, 1NQ2, 1NUO, 1Q4X, 1R6G, 1XZX, 1Y0X, 2J4A, 2NLL, 2PIN, 3D57, 3GWS, 3IMY, 3JZC, 4ZO1
Ідентифікатори
Символи	THRB, C-ERBA-2, C-ERBA-BETA, ERBA2, GRTH, NR1A2, PRTH, THR1, THRB1, THRB2, thyroid hormone receptor beta, TRbeta
Зовнішні ІД	OMIM: 190160 MGI: 98743 HomoloGene: 36025 GeneCards: THRB
Реагує на сполуку
	DL-3,3',5'-triiodothyronine, tiratricol, Трийодтиронін, Левотироксин[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • chromatin DNA binding; • thyroid hormone binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Ядерні тільця; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of heart contraction; • female courtship behavior; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • sensory perception of sound; • type I pneumocyte differentiation; • negative regulation of female receptivity; • animal organ morphogenesis; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • steroid hormone mediated signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of eye photoreceptor cell development; • retinal cone cell development; • retinal cone cell apoptotic process; • multicellular organism development; • hormone-mediated signaling pathway; • Диференціація клітин; • thyroid gland development; • response to lipid; • thyroid hormone mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7068
	21834
	ENSG00000151090
	ENSMUSG00000021779
	P10828
	P37242
NM_000461; NM_001128176; NM_001128177; NM_001252634; NM_001354708;
	NM_001354709; NM_001354710; NM_001354711; NM_001354712; NM_001354713; NM_001354714; NM_001354715; NM_001374822; NM_001374823; NM_001374824; NM_001374825; NM_001374826; NM_001374827
	NM_001113417; NM_009380
NP_000452; NP_001121648; NP_001121649; NP_001239563; NP_001341637;
	NP_001341638; NP_001341639; NP_001341640; NP_001341641; NP_001341642; NP_001341643; NP_001341644; NP_001361751; NP_001361752; NP_001361753; NP_001361754; NP_001361755; NP_001361756
	NP_001106888; NP_033406
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

THRB (англ. Thyroid hormone receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 52 788[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPNSMTENG	LTAWDKPKHC	PDREHDWKLV	GMSEACLHRK	SHSERRSTLK
NEQSSPHLIQ	TTWTSSIFHL	DHDDVNDQSV	SSAQTFQTEE	KKCKGYIPSY
LDKDELCVVC	GDKATGYHYR	CITCEGCKGF	FRRTIQKNLH	PSYSCKYEGK
CVIDKVTRNQ	CQECRFKKCI	YVGMATDLVL	DDSKRLAKRK	LIEENREKRR
REELQKSIGH	KPEPTDEEWE	LIKTVTEAHV	ATNAQGSHWK	QKRKFLPEDI
GQAPIVNAPE	GGKVDLEAFS	HFTKIITPAI	TRVVDFAKKL	PMFCELPCED
QIILLKGCCM	EIMSLRAAVR	YDPESETLTL	NGEMAVTRGQ	LKNGGLGVVS
DAIFDLGMSL	SSFNLDDTEV	ALLQAVLLMS	SDRPGLACVE	RIEKYQDSFL
LAFEHYINYR	KHHVTHFWPK	LLMKVTDLRM	IGACHASRFL	HMKVECPTEL
FPPLFLEVFE	D

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sakurai A., Nakai A., Degroot L.J. (1990). Structural analysis of human thyroid hormone receptor beta gene.. Mol. Cell. Endocrinol. 71: 83 — 91. PubMed DOI:10.1016/0303-7207(90)90245-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Frankton S., Harvey C.B., Gleason L.M., Fadel A., Williams G.R. (2004). Multiple messenger ribonucleic acid variants regulate cell-specific expression of human thyroid hormone receptor beta1.. Mol. Endocrinol. 18: 1631 — 1642. PubMed DOI:10.1210/me.2003-0346
Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator.. Mol. Cell. Biol. 22: 3358 — 3372. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002
Rastinejad F., Perlmann T., Evans R.M., Sigler P.B. (1995). Structural determinants of nuclear receptor assembly on DNA direct repeats.. Nature 375: 203 — 211. PubMed DOI:10.1038/375203a0
Parrilla R., Mixson A.J., McPherson J.A., McClaskey J.H., Weintraub B.D. (1991). Characterization of seven novel mutations of the c-erbA beta gene in unrelated kindreds with generalized thyroid hormone resistance. Evidence for two 'hot spot' regions of the ligand binding domain.. J. Clin. Invest. 88: 2123 — 2130. PubMed DOI:10.1172/JCI115542

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11799 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P10828 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11799 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P10828 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.