TIA1

TIA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MJN, 3BS9
Ідентифікатори
Символи	TIA1, TIA-1, WDM, TIA1 cytotoxic granule-associated RNA binding protein, TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603518 MGI: 107914 HomoloGene: 20692 GeneCards: TIA1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • GO:0001948 protein binding; • poly(A) binding; • RNA binding; • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cytoplasmic stress granule; • nuclear stress granule; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• negative regulation of translation; • positive regulation of epithelial cell apoptotic process; • regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein localization to cytoplasmic stress granule; • Апоптоз; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7072
	21841
	ENSG00000116001
	ENSMUSG00000071337
	P31483
	P52912
	NM_022037; NM_022173
	NM_001164078; NM_001164079; NM_011585
NP_071320; NP_071505; NP_001338437; NP_001338438; NP_001338439;
	NP_001338440; NP_001338441; NP_001338443; NP_001338444; NP_001338445; NP_001338446; NP_001338447; NP_001338448; NP_001338449; NP_001338450; NP_001338451; NP_001338452; NP_001338453; NP_001338454; NP_001338442
	NP_001157550; NP_001157551; NP_035715
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIA1 (англ. TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 963[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDEMPKTLY	VGNLSRDVTE	ALILQLFSQI	GPCKNCKMIM	DTAGNDPYCF
VEFHEHRHAA	AALAAMNGRK	IMGKEVKVNW	ATTPSSQKKD	TSSSTVVSTQ
RSQDHFHVFV	GDLSPEITTE	DIKAAFAPFG	RISDARVVKD	MATGKSKGYG
FVSFFNKWDA	ENAIQQMGGQ	WLGGRQIRTN	WATRKPPAPK	STYESNTKQL
SYDEVVNQSS	PSNCTVYCGG	VTSGLTEQLM	RQTFSPFGQI	MEIRVFPDKG
YSFVRFNSHE	SAAHAIVSVN	GTTIEGHVVK	CYWGKETLDM	INPVQQQNQI
GYPQPYGQWG	QWYGNAQQIG	QYMPNGWQVP	AYGMYGQAWN	QQGFNQTQSS
APWMGPNYGV	QPPQGQNGSM	LPNQPSGYRV	AGYETQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Tian Q., Streuli M., Saito H., Schlossman S.F., Anderson P. (1991). A polyadenylate binding protein localized to the granules of cytolytic lymphocytes induces DNA fragmentation in target cells.. Cell 67: 629 — 639. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(91)90536-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kumar A.O., Swenson M.C., Benning M.M., Kielkopf C.L. (2008). Structure of the central RNA recognition motif of human TIA-1 at 1.95A resolution.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 367: 813 — 819. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2008.01.027

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11802 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P31483 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11802 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P31483 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.