TPM1

TPM1
Ідентифікатори
Символи	TPM1, C15orf13, CMD1Y, CMH3, HTM-alpha, LVNC9, TMSA, HEL-S-265, tropomyosin 1 (alpha), tropomyosin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191010 HomoloGene: 121635 GeneCards: TPM1
Пов'язані генетичні захворювання
	hypertrophic cardiomyopathy 3, dilated cardiomyopathy 1Y[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytoskeletal protein binding; • structural constituent of cytoskeleton; • GO:0001948 protein binding; • actin binding; • structural constituent of muscle; • identical protein binding; • protein homodimerization activity; • protein heterodimerization activity; • actin filament binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • muscle thin filament tropomyosin; • Саркомера; • stress fiber; • ruffle membrane; • bleb; • Цитоскелет; • гіалоплазма; • Мікрофіламенти; • actin cytoskeleton; • Міофібрила; • filamentous actin;
Біологічний процес	• regulation of muscle contraction; • м'язове скорочення; • regulation of heart contraction; • positive regulation of ATP-dependent activity; • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell migration; • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • ruffle organization; • Загоєння ран; • cellular response to reactive oxygen species; • negative regulation of cell migration; • cytoskeleton organization; • regulation of cell shape; • muscle filament sliding; • sarcomere organization; • positive regulation of stress fiber assembly; • positive regulation of cell adhesion; • actin filament organization; • in utero embryonic development; • positive regulation of heart rate by epinephrine; • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; • cardiac muscle contraction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7168
	415209
	ENSG00000140416
	ENSDARG00000104682
	P09493
	н/д
NM_000366; NM_001018004; NM_001018005; NM_001018006; NM_001018007;
	NM_001018008; NM_001018020; NM_001301244; NM_001301289; NM_001330344; NM_001330346; NM_001330351; NM_001365776; NM_001365777; NM_001365778; NM_001365779; NM_001365780; NM_001365781; NM_001365782
	NM_001002119
NP_000357; NP_001018004; NP_001018005; NP_001018006; NP_001018007;
	NP_001018008; NP_001018020; NP_001288173; NP_001288218; NP_001317273; NP_001317275; NP_001317280; NP_001352705; NP_001352706; NP_001352707; NP_001352708; NP_001352709; NP_001352710; NP_001352711; NP_001018006.1
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TPM1 (англ. Tropomyosin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 32 709[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAIKKKMQM	LKLDKENALD	RAEQAEADKK	AAEDRSKQLE	DELVSLQKKL
KGTEDELDKY	SEALKDAQEK	LELAEKKATD	AEADVASLNR	RIQLVEEELD
RAQERLATAL	QKLEEAEKAA	DESERGMKVI	ESRAQKDEEK	MEIQEIQLKE
AKHIAEDADR	KYEEVARKLV	IIESDLERAE	ERAELSEGKC	AELEEELKTV
TNNLKSLEAQ	AEKYSQKEDR	YEEEIKVLSD	KLKEAETRAE	FAERSVTKLE
KSIDDLEDEL	YAQKLKYKAI	SEELDHALND	MTSI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Mische S.M., Manjula B.N., Fischetti V.A. (1987). Relation of streptococcal M protein with human and rabbit tropomyosin: the complete amino acid sequence of human cardiac alpha tropomyosin, a highly conserved contractile protein.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 142: 813 — 818. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(87)91486-0
Lin C.-S., Leavitt J. (1988). Cloning and characterization of a cDNA encoding transformation-sensitive tropomyosin isoform 3 from tumorigenic human fibroblasts.. Mol. Cell. Biol. 8: 160 — 168. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.1.160
McLeod A.R., Gooding C. (1988). Human hTM alpha gene: expression in muscle and nonmuscle tissue.. Mol. Cell. Biol. 8: 433 — 440. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.1.433
Denz C.R., Narshi A., Zajdel R.W., Dube D.K. (2004). Expression of a novel cardiac-specific tropomyosin isoform in humans.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320: 1291 — 1297. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.084
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Houle F., Poirier A., Dumaresq J., Huot J. (2007). DAP kinase mediates the phosphorylation of tropomyosin-1 downstream of the ERK pathway, which regulates the formation of stress fibers in response to oxidative stress.. J. Cell Sci. 120: 3666 — 3677. PubMed DOI:10.1242/jcs.003251

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12010 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P09493 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12010 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P09493 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.