TSEN34

TSEN34
Ідентифікатори
Символи	TSEN34, LENG5, PCH2C, SEN34, SEN34L, tRNA splicing endonuclease subunit 34
Зовнішні ІД	OMIM: 608754 MGI: 1913328 HomoloGene: 44182 GeneCards: TSEN34
Пов'язані генетичні захворювання
	pontocerebellar hypoplasia type 2C[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• tRNA-intron endonuclease activity; • lyase activity; • nucleic acid binding; • nuclease activity;
Клітинна компонента	• Ядерце; • клітинне ядро; • tRNA-intron endonuclease complex; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mRNA processing; • tRNA-type intron splice site recognition and cleavage; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • tRNA processing; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	79042
	66078
ENSG00000278622; ENSG00000274129; ENSG00000274796; ENSG00000278712; ENSG00000275165;
	ENSG00000278605; ENSG00000273896; ENSG00000274078; ENSG00000274672; ENSG00000170892
	ENSMUSG00000035585
	Q9BSV6
	Q8BMZ5
	NM_001077446; NM_001282332; NM_001282333; NM_024075; NM_001386740
	NM_001164204; NM_001164205; NM_024168
	NP_001070914; NP_001269261; NP_001269262; NP_076980
	NP_001157676; NP_001157677; NP_077130
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TSEN34 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 33 652[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVVEVANGR	SLVWGAEAVQ	ALRERLGVGG	RTVGALPRGP	RQNSRLGLPL
LLMPEEARLL	AEIGAVTLVS	APRPDSRHHS	LALTSFKRQQ	EESFQEQSAL
AAEARETRRQ	ELLEKITEGQ	AAKKQKLEQA	SGASSSQEAG	SSQAAKEDET
SDGQASGEQE	EAGPSSSQAG	PSNGVAPLPR	SALLVQLATA	RPRPVKARPL
DWRVQSKDWP	HAGRPAHELR	YSIYRDLWER	GFFLSAAGKF	GGDFLVYPGD
PLRFHAHYIA	QCWAPEDTIP	LQDLVAAGRL	GTSVRKTLLL	CSPQPDGKVV
YTSLQWASLQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, процесинг тРНК. Локалізований у ядрі.

Література

Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation.. Cell 117: 311 — 321. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wende H., Volz A., Ziegler A. (2000). Extensive gene duplications and a large inversion characterize the human leukocyte receptor cluster.. Immunogenetics 51: 703 — 713. PubMed DOI:10.1007/s002510000187
Wende H., Volz A., Ziegler A. (2001). Immunogenetics 52: 3 — 4.

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TSEN34 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15506 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9BSV6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TSEN34 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15506 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9BSV6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.