ULK1

ULK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4WNO, 4WNP, 5CI7
Ідентифікатори
Символи	ULK1, ATG1, ATG1A, UNC51, Unc51.1, hATG1, unc-51 like autophagy activating kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603168 MGI: 1270126 HomoloGene: 2640 GeneCards: ULK1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • kinase activity; • GTPase binding; • identical protein binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • phagophore assembly site membrane; • extrinsic component of omegasome membrane; • Atg1/ULK1 kinase complex; • extrinsic component of phagophore assembly site membrane; • phagophore assembly site; • autophagosome; • extrinsic component of autophagosome membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • recycling endosome; • guanyl-nucleotide exchange factor complex; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • Аксон; • мембрана;
Біологічний процес	• neuron projection regeneration; • protein localization; • axonogenesis; • фосфорилювання; • negative regulation of protein-containing complex assembly; • protein phosphorylation; • peptidyl-serine phosphorylation; • cellular response to nutrient levels; • axon extension; • response to starvation; • protein autophosphorylation; • neuron projection development; • Сигнальна трансдукція; • Автофагія; • macroautophagy; • peptidyl-threonine phosphorylation; • regulation of macroautophagy; • positive regulation of autophagosome assembly; • autophagosome assembly; • regulation of autophagy; • positive regulation of autophagy;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8408
	22241
	ENSG00000177169
	ENSMUSG00000029512
	O75385
	O70405
	NM_003565
	NM_009469; NM_001347394
	NP_003556
	NP_001334323; NP_033495
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ULK1 (англ. Unc-51 like autophagy activating kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 112 631[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPGRGGTET	VGKFEFSRKD	LIGHGAFAVV	FKGRHREKHD	LEVAVKCINK
KNLAKSQTLL	GKEIKILKEL	KHENIVALYD	FQEMANSVYL	VMEYCNGGDL
ADYLHAMRTL	SEDTIRLFLQ	QIAGAMRLLH	SKGIIHRDLK	PQNILLSNPA
GRRANPNSIR	VKIADFGFAR	YLQSNMMAAT	LCGSPMYMAP	EVIMSQHYDG
KADLWSIGTI	VYQCLTGKAP	FQASSPQDLR	LFYEKNKTLV	PTIPRETSAP
LRQLLLALLQ	RNHKDRMDFD	EFFHHPFLDA	SPSVRKSPPV	PVPSYPSSGS
GSSSSSSSTS	HLASPPSLGE	MQQLQKTLAS	PADTAGFLHS	SRDSGGSKDS
SCDTDDFVMV	PAQFPGDLVA	EAPSAKPPPD	SLMCSGSSLV	ASAGLESHGR
TPSPSPPCSS	SPSPSGRAGP	FSSSRCGASV	PIPVPTQVQN	YQRIERNLQS
PTQFQTPRSS	AIRRSGSTSP	LGFARASPSP	PAHAEHGGVL	ARKMSLGGGR
PYTPSPQVGT	IPERPGWSGT	PSPQGAEMRG	GRSPRPGSSA	PEHSPRTSGL
GCRLHSAPNL	SDLHVVRPKL	PKPPTDPLGA	VFSPPQASPP	QPSHGLQSCR
NLRGSPKLPD	FLQRNPLPPI	LGSPTKAVPS	FDFPKTPSSQ	NLLALLARQG
VVMTPPRNRT	LPDLSEVGPF	HGQPLGPGLR	PGEDPKGPFG	RSFSTSRLTD
LLLKAAFGTQ	APDPGSTESL	QEKPMEIAPS	AGFGGSLHPG	ARAGGTSSPS
PVVFTVGSPP	SGSTPPQGPR	TRMFSAGPTG	SASSSARHLV	PGPCSEAPAP
ELPAPGHGCS	FADPITANLE	GAVTFEAPDL	PEETLMEQEH	TEILRGLRFT
LLFVQHVLEI	AALKGSASEA	AGGPEYQLQE	SVVADQISLL	SREWGFAEQL
VLYLKVAELL	SSGLQSAIDQ	IRAGKLCLSS	TVKQVVRRLN	ELYKASVVSC
QGLSLRLQRF	FLDKQRLLDR	IHSITAERLI	FSHAVQMVQS	AALDEMFQHR
EGCVPRYHKA	LLLLEGLQHM	LSDQADIENV	TKCKLCIERR	LSALLTGICA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як автофагія. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Mercer C.A., Kaliappan A., Dennis P.B. (2009). A novel, human Atg13 binding protein, Atg101, interacts with ULK1 and is essential for macroautophagy.. Autophagy 5: 649 — 662. PubMed DOI:10.4161/auto.5.5.8249
Chan E.Y.W., Longatti A., McKnight N.C., Tooze S.A. (2009). Kinase-inactivated ULK proteins inhibit autophagy via their conserved C-terminal domains using an Atg13-independent mechanism.. Mol. Cell. Biol. 29: 157 — 171. PubMed DOI:10.1128/MCB.01082-08
Jung C.H., Seo M., Otto N.M., Kim D.H. (2011). ULK1 inhibits the kinase activity of mTORC1 and cell proliferation.. Autophagy 7: 1212 — 1221. PubMed DOI:10.4161/auto.7.10.16660

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12558 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, O75385 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12558 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75385 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.