XRCC4

XRCC4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FU1, 1IK9, 3II6, 3MUD, 3Q4F, 3RWR, 3SR2, 3W03, 4XA4, 5CHX, 5CJ0, 5CJ4, 5E50
Ідентифікатори
Символи	XRCC4, SSMED, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4, X-ray repair cross complementing 4, hXRCC4
Зовнішні ІД	OMIM: 194363 MGI: 1333799 HomoloGene: 2555 GeneCards: XRCC4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • ligase activity; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Нуклеоплазма; • DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex; • DNA ligase IV complex; • nonhomologous end joining complex; • condensed chromosome; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• DNA recombination; • cellular response to lithium ion; • cellular response to DNA damage stimulus; • establishment of integrated proviral latency; • DNA ligation involved in DNA repair; • positive regulation of ligase activity; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • response to X-ray; • double-strand break repair; • Репарація ДНК;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7518
	108138
	ENSG00000152422
	ENSMUSG00000021615
	Q13426
	Q924T3
	NM_003401; NM_022406; NM_022550; NM_001318012; NM_001318013
	NM_028012
NP_001304941; NP_001304942; NP_003392; NP_071801; NP_072044;
	NP_071801.1; NP_001304941.1; NP_001304942.1
	NP_082288
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XRCC4 (англ. X-ray repair cross complementing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 38 287[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERKISRIHL	VSEPSITHFL	QVSWEKTLES	GFVITLTDGH	SAWTGTVSES
EISQEADDMA	MEKGKYVGEL	RKALLSGAGP	ADVYTFNFSK	ESCYFFFEKN
LKDVSFRLGS	FNLEKVENPA	EVIRELICYC	LDTIAENQAK	NEHLQKENER
LLRDWNDVQG	RFEKCVSAKE	ALETDLYKRF	ILVLNEKKTK	IRSLHNKLLN
AAQEREKDIK	QEGETAICSE	MTADRDPVYD	ESTDEESENQ	TDLSGLASAA
VSKDDSIISS	LDVTDIAPSR	KRRQRMQRNL	GTEPKMAPQE	NQLQEKENSR
PDSSLPETSK	KEHISAENMS	LETLRNSSPE	DLFDEI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Critchlow S.E., Bowater R.P., Jackson S.P. (1997). Mammalian DNA double-strand break repair protein XRCC4 interacts with DNA ligase IV.. Curr. Biol. 7: 588 — 598. PubMed DOI:10.1016/S0960-9822(06)00258-2
Leber R., Wise T.W., Mizuta R., Meek K. (1998). The XRCC4 gene product is a target for and interacts with the DNA-dependent protein kinase.. J. Biol. Chem. 273: 1794 — 1801. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.3.1794
Lee K.J., Jovanovic M., Udayakumar D., Bladen C.L., Dynan W.S. (2004). Identification of DNA-PKcs phosphorylation sites in XRCC4 and effects of mutations at these sites on DNA end joining in a cell-free system.. DNA Repair 3: 267 — 276. PubMed DOI:10.1016/j.dnarep.2003.11.005
Chen L., Trujillo K., Sung P., Tomkinson A.E. (2000). Interactions of the DNA ligase IV-XRCC4 complex with DNA ends and the DNA-dependent protein kinase.. J. Biol. Chem. 275: 26196 — 26205. PubMed DOI:10.1074/jbc.M000491200
Nick McElhinny S.A., Snowden C.M., McCarville J., Ramsden D.A. (2000). Ku recruits the XRCC4-ligase IV complex to DNA ends.. Mol. Cell. Biol. 20: 2996 — 3003. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.9.2996-3003.2000

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12831 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
UniProt, Q13426 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12831 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13426 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.