Віментин

Віментин
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GK4, 1GK6, 1GK7, 3G1E, 3KLT, 3S4R, 3SSU, 3SWK, 3TRT, 3UF1, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD5, 4MDJ, 4YPC, 4YV3
Ідентифікатори
Символи	VIM, CTRCT30, HEL113, vimentin
Зовнішні ІД	OMIM: 193060 MGI: 98932 HomoloGene: 2538 GeneCards: VIM
Пов'язані генетичні захворювання
	cataract 30[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scaffold protein binding; • structural molecule activity; • structural constituent of cytoskeleton; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • structural constituent of eye lens; • identical protein binding; • double-stranded RNA binding; • keratin filament binding; • protein domain specific binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cell projection; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • Пероксисома; • cell leading edge; • neuron projection; • Екзосома; • Цитоскелет; • Проміжні філаменти; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • клітинне ядро; • polysome; • nuclear matrix; • phagocytic vesicle; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• intermediate filament organization; • movement of cell or subcellular component; • negative regulation of neuron projection development; • SMAD protein signal transduction; • astrocyte development; • intermediate filament-based process; • positive regulation of gene expression; • muscle filament sliding; • Bergmann glial cell differentiation; • GO:0022415 viral process; • lens fiber cell development; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of collagen biosynthetic process; • regulation of mRNA stability; • positive regulation of translation; • cellular response to lipopolysaccharide; • cellular response to muramyl dipeptide; • cellular response to interferon-gamma;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7431
	22352
	ENSG00000026025
	ENSMUSG00000026728
	P08670
	P20152
	NM_003380
	NM_011701
	NP_003371
	NP_035831
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Віментин (англ. Vimentin) – білок, який кодується геном VIM, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 53 652[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M S T R S V S S S S	Y R R M F G G P G T	A S R P S S S R S Y	V T T S T R T Y S L	G S A L R P S T S R
S L Y A S S P G G V	Y A T R S S A V R L	R S S V P G V R L L	Q D S V D F S L A D	A I N T E F K N T R
T N E K V E L Q E L	N D R F A N Y I D K	V R F L E Q Q N K I	L L A E L E Q L K G	Q G K S R L G D L Y
E E E M R E L R R Q	V D Q L T N D K A R	V E V E R D N L A E	D I M R L R E K L Q	E E M L Q R E E A E
N T L Q S F R Q D V	D N A S L A R L D L	E R K V E S L Q E E	I A F L K K L H E E	E I Q E L Q A Q I Q
E Q H V Q I D V D V	S K P D L T A A L R	D V R Q Q Y E S V A	A K N L Q E A E E W	Y K S K F A D L S E
A A N R N N D A L R	Q A K Q E S T E Y R	R Q V Q S L T C E V	D A L K G T N E S L	E R Q M R E M E E N
F A V E A A N Y Q D	T I G R L Q D E I Q	N M K E E M A R H L	R E Y Q D L L N V K	M A L D I E I A T Y
R K L L E G E E S R	I S L P L P N F S S	L N L R E T N L D S	L P L V D T H S K R	T L L I K T V E T R
D G Q V I N E T S Q	H H D D L E

Цей білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, проміжних філаментах.

Література

Hartmann T.B., Thiel D., Dummer R., Schadendorf D., Eichmueller S. (2004). SEREX identification of new tumour-associated antigens in cutaneous T-cell lymphoma.. Br. J. Dermatol. 150: 252 — 258. PubMed DOI:10.1111/j.1365-2133.2004.05651.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Perreau J., Lilienbaum A., Vasseur M., Paulin D. (1988). Nucleotide sequence of the human vimentin gene and regulation of its transcription in tissues and cultured cells.. Gene 62: 7 — 16. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(88)90575-6
Gupta A.K., Aubin J.E., Waye M.M.Y. (1990). Isolation of a human vimentin cDNA with a long 3'-noncoding region from a human osteosarcoma cell line (MG-63).. Gene 86: 303 — 304. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(90)90295-3
Kang S.-M., Shin M.-J., Kim J.-H., Oh J.-W. (2005). Proteomic profiling of cellular proteins interacting with the hepatitis C virus core protein.. Proteomics 5: 2227 — 2237. PubMed DOI:10.1002/pmic.200401093
Wang W., Sumiyoshi H., Yoshioka H., Fujiwara S. (2006). Interactions between epiplakin and intermediate filaments.. J. Dermatol. 33: 518 — 527. PubMed DOI:10.1111/j.1346-8138.2006.00127.x

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Віментин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12692 (англ.). Процитовано 16 липня 2019.
UniProt, P08670 (англ.). Процитовано 16 липня 2019.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Віментин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12692 (англ.). Процитовано 16 липня 2019.

[UniProt-5] UniProt, P08670 (англ.). Процитовано 16 липня 2019.