Коактиватор ядерних рецепторів 3

Коактиватор ядерних рецепторів 3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KBH, 3L3X, 3L3Z
Ідентифікатори
Символи	NCOA3, ACTR, AIB-1, AIB1, CAGH16, CTG26, KAT13B, RAC3, SRC-3, SRC3, TNRC14, TNRC16, TRAM-1, bHLHe42, pCIP, nuclear receptor coactivator 3
Зовнішні ІД	OMIM: 601937 MGI: 1276535 HomoloGene: 4764 GeneCards: NCOA3
Пов'язані генетичні захворювання
	lymphoblastic leukemia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein dimerization activity; • protein N-terminus binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • thyroid hormone receptor binding; • histone acetyltransferase activity; • GO:0001948 protein binding; • androgen receptor binding; • nuclear receptor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • acyltransferase activity; • protein heterodimerization activity; • disordered domain specific binding; • RNA polymerase II complex binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • Екзосома; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• androgen receptor signaling pathway; • regulation of RNA biosynthetic process; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of keratinocyte differentiation; • cellular response to estradiol stimulus; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of gene expression; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • receptor transactivation; • intracellular receptor signaling pathway; • histone acetylation; • cellular response to hormone stimulus; • cell dedifferentiation; • positive regulation of stem cell population maintenance; • regulation of stem cell division;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	8202
	17979
	ENSG00000124151
	ENSMUSG00000027678
	Q9Y6Q9
	O09000
	NM_181659; NM_001174087; NM_001174088; NM_006534
	NM_008679; NM_001374779
	NP_001167558; NP_001167559; NP_006525; NP_858045
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Коактиватор ядерних рецепторів 3 (англ. Nuclear receptor coactivator 3) – білок, який кодується геном NCOA3, розташованим у людини на довгому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 424 амінокислот, а молекулярна маса — 155 293[5]. Білок регулює ядерні рецептори та стимулює їх транскрипційну активність, тобто є активатором транскрипції. Працює як гістонова ацетилтрансфераза. Локалізований у цитоплазмі чи ядрі.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGLGENLDP	LASDSRKRKL	PCDTPGQGLT	CSGEKRRREQ	ESKYIEELAE
LISANLSDID	NFNVKPDKCA	ILKETVRQIR	QIKEQGKTIS	NDDDVQKADV
SSTGQGVIDK	DSLGPLLLQA	LDGFLFVVNR	DGNIVFVSEN	VTQYLQYKQE
DLVNTSVYNI	LHEEDRKDFL	KNLPKSTVNG	VSWTNETQRQ	KSHTFNCRML
MKTPHDILED	INASPEMRQR	YETMQCFALS	QPRAMMEEGE	DLQSCMICVA
RRITTGERTF	PSNPESFITR	HDLSGKVVNI	DTNSLRSSMR	PGFEDIIRRC
IQRFFSLNDG	QSWSQKRHYQ	EAYLNGHAET	PVYRFSLADG	TIVTAQTKSK
LFRNPVTNDR	HGFVSTHFLQ	REQNGYRPNP	NPVGQGIRPP	MAGCNSSVGG
MSMSPNQGLQ	MPSSRAYGLA	DPSTTGQMSG	ARYGGSSNIA	SLTPGPGMQS
PSSYQNNNYG	LNMSSPPHGS	PGLAPNQQNI	MISPRNRGSP	KIASHQFSPV
AGVHSPMASS	GNTGNHSFSS	SSLSALQAIS	EGVGTSLLST	LSSPGPKLDN
SPNMNITQPS	KVSNQDSKSP	LGFYCDQNPV	ESSMCQSNSR	DHLSDKESKE
SSVEGAENQR	GPLESKGHKK	LLQLLTCSSD	DRGHSSLTNS	PLDSSCKESS
VSVTSPSGVS	SSTSGGVSST	SNMHGSLLQE	KHRILHKLLQ	NGNSPAEVAK
ITAEATGKDT	SSITSCGDGN	VVKQEQLSPK	KKENNALLRY	LLDRDDPSDA
LSKELQPQVE	GVDNKMSQCT	SSTIPSSSQE	KDPKIKTETS	EEGSGDLDNL
DAILGDLTSS	DFYNNSISSN	GSHLGTKQQV	FQGTNSLGLK	SSQSVQSIRP
PYNRAVSLDS	PVSVGSSPPV	KNISAFPMLP	KQPMLGGNPR	MMDSQENYGS
SMGGPNRNVT	VTQTPSSGDW	GLPNSKAGRM	EPMNSNSMGR	PGGDYNTSLP
RPALGGSIPT	LPLRSNSIPG	ARPVLQQQQQ	MLQMRPGEIP	MGMGANPYGQ
AAASNQLGSW	PDGMLSMEQV	SHGTQNRPLL	RNSLDDLVGP	PSNLEGQSDE
RALLDQLHTL	LSNTDATGLE	EIDRALGIPE	LVNQGQALEP	KQDAFQGQEA
AVMMDQKAGL	YGQTYPAQGP	PMQGGFHLQG	QSPSFNSMMN	QMNQQGNFPL
QGMHPRANIM	RPRTNTPKQL	RMQLQQRLQG	QQFLNQSRQA	LELKMENPTA
GGAAVMRPMM	QPQVSSQQGF	LNAQMVAQRS	RELLSHHFRQ	QRVAMMMQQQ
QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQTQAF	SPPPNVTASP	SMDGLLAGPT
MPQAPPQQFP	YQPNYGMGQQ	PDPAFGRVSS	PPNAMMSSRM	GPSQNPMMQH
PQAASIYQSS	EMKGWPSGNL	ARNSSFSQQQ	FAHQGNPAVY	SMVHMNGSSG
HMGQMNMNPM	PMSGMPMGPD	QKYC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Ген NCOA3

Ген NCOA3 розташований на 20 хромосомі людини та складається з 22 екзонів, що було продемостровано в 2001 р.[6] Також має інші назви: AIB1, TRAM1.

Функція

NCOA3 має властивості транскрипційного коактиватора та має декілька взаємодіючих доменів ядерних рецепторів, а також гістонової ацетилтрансферази. Цей ензим приймає учать в посиленні експресії генів, завдяки здатності зв'язуватись з промотором ДНК ліганд-активованими ядерними рецепторами, що призводить до посилення транскрипції.[7][8]

Клінічне значення

Ампліфікація та посилена експресія NCOA3 (AIB1) була визначена в культурах клітин раку молочної залози та раку яєчників, а також в біоптатах ТАПБ раку молочної залози.[9] Крім того, визначення взаємодії NCOA3 з PAX2 може бути використано для прогнозу ефективності тамоксифену для лікування естроген-залежного раку молочної залози.

Див. також

Хромосома 20

Література

Takeshita A., Cardona G.R., Koibuchi N., Suen C.-S., Chin W.W. (1997). TRAM-1, a novel 160-kDa thyroid hormone receptor activator molecule, exhibits distinct properties from steroid receptor coactivator-1.. J. Biol. Chem. 272: 27629 — 27634. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.44.27629
Li H., Gomes P.J., Chen J.D. (1997). RAC3, a steroid/nuclear receptor-associated coactivator that is related to SRC-1 and TIF2.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8479 — 8484. PubMed DOI:10.1073/pnas.94.16.8479
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chen H., Lin R.J., Xie W., Wilpitz D., Evans R.M. (1999). Regulation of hormone-induced histone hyperacetylation and gene activation via acetylation of an acetylase.. Cell 98: 675 — 686. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80054-9
Werbajh S., Nojek I., Lanz R., Costas M.A. (2000). RAC-3 is a NF-kappa B coactivator.. FEBS Lett. 485: 195 — 199. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(00)02223-7
Hsiao P.W., Fryer C.J., Trotter K.W., Wang W., Archer T.K. (2003). BAF60a mediates critical interactions between nuclear receptors and the BRG1 chromatin-remodeling complex for transactivation.. Mol. Cell. Biol. 23: 6210 — 6220. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.17.6210-6220.2003

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Коактиватор ядерних рецепторів 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7670 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
UniProt, Q9Y6Q9 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.
Reiter R, Wellstein A, Riegel AT (October 2001). An isoform of the coactivator AIB1 that increases hormone and growth factor sensitivity is overexpressed in breast cancer.. J Biol Chem 276 (43): 39736–39741. PMID 11502741. doi:10.1074/jbc.M104744200.
Anzick SL, Kononen J, Walker RL, Azorsa DO, Tanner MM, Guan XY, Sauter G, Kallioniemi OP, Trent JM, Meltzer PS (August 1997). AIB1, a steroid receptor coactivator amplified in breast and ovarian cancer. Science 277 (5328): 965–8. PMID 9252329. doi:10.1126/science.277.5328.965.
Takeshita A, Cardona GR, Koibuchi N, Suen CS, Chin WW (October 1997). TRAM-1, A novel 160-kDa thyroid hormone receptor activator molecule, exhibits distinct properties from steroid receptor coactivator-1. J. Biol. Chem. 272 (44): 27629–34. PMID 9346901. doi:10.1074/jbc.272.44.27629.
Anzick SL, Kononen J, Walker RL, Azorsa DO, Tanner MM, Guan XY, Sauter G, Kallioniemi OP, Trent JM, Meltzer PS (1997). AIB1, a steroid receptor coactivator amplified in breast and ovarian cancer. Science 277 (5328): 965–8. PMID 9252329. doi:10.1126/science.277.5328.965.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Коактиватор ядерних рецепторів 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7670 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[UniProt-5] UniProt, Q9Y6Q9 (англ.). Процитовано 26 квітня 2018.

[pmid11502741-6] Reiter R, Wellstein A, Riegel AT (October 2001). An isoform of the coactivator AIB1 that increases hormone and growth factor sensitivity is overexpressed in breast cancer.. J Biol Chem 276 (43): 39736–39741. PMID 11502741. doi:10.1074/jbc.M104744200.

[pmid9252329-7] Anzick SL, Kononen J, Walker RL, Azorsa DO, Tanner MM, Guan XY, Sauter G, Kallioniemi OP, Trent JM, Meltzer PS (August 1997). AIB1, a steroid receptor coactivator amplified in breast and ovarian cancer. Science 277 (5328): 965–8. PMID 9252329. doi:10.1126/science.277.5328.965.

[pmid9346901-8] Takeshita A, Cardona GR, Koibuchi N, Suen CS, Chin WW (October 1997). TRAM-1, A novel 160-kDa thyroid hormone receptor activator molecule, exhibits distinct properties from steroid receptor coactivator-1. J. Biol. Chem. 272 (44): 27629–34. PMID 9346901. doi:10.1074/jbc.272.44.27629.

[Anzick_1997-9] Anzick SL, Kononen J, Walker RL, Azorsa DO, Tanner MM, Guan XY, Sauter G, Kallioniemi OP, Trent JM, Meltzer PS (1997). AIB1, a steroid receptor coactivator amplified in breast and ovarian cancer. Science 277 (5328): 965–8. PMID 9252329. doi:10.1126/science.277.5328.965.