Тимопоетин

TMPO
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GJJ, 1H9F, 1H9E
Ідентифікатори
Символи	TMPO, CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, thymopoietin
Зовнішні ІД	OMIM: 188380 MGI: 106920 HomoloGene: 31144 GeneCards: TMPO
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • lamin binding; • cadherin binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Хроматин; • nuclear envelope; • клітинне ядро; • хромосома; • цитоплазма; • integral component of membrane; • nuclear inner membrane; • Ядерна мембрана; • мембрана;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7112
	21917
	ENSG00000120802
	ENSMUSG00000019961
	P42166; P42167
	Q61029; Q61033
	NM_001032283; NM_001032284; NM_001307975; NM_003276
NM_001080129; NM_001080130; NM_001080131; NM_001080132; NM_001080134;
	NM_011605; NM_001283048
NP_001027454; NP_001027455; NP_001294904; NP_003267; NP_001027454.1;
	NP_001027455.1; NP_001294904.1; NP_001027454.1
NP_001073598; NP_001073599; NP_001073600; NP_001073601; NP_001269977;
	NP_035735; NP_035735.2
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TMPO (англ. Thymopoietin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот, а молекулярна маса — 75 492[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPEFLEDPSV	LTKDKLKSEL	VANNVTLPAG	EQRKDVYVQL	YLQHLTARNR
PPLPAGTNSK	GPPDFSSDEE	REPTPVLGSG	AAAAGRSRAA	VGRKATKKTD
KPRQEDKDDL	DVTELTNEDL	LDQLVKYGVN	PGPIVGTTRK	LYEKKLLKLR
EQGTESRSST	PLPTISSSAE	NTRQNGSNDS	DRYSDNEEGK	KKEHKKVKST
RDIVPFSELG	TTPSGGGFFQ	GISFPEISTR	PPLGSTELQA	AKKVHTSKGD
LPREPLVATN	LPGRGQLQKL	ASERNLFISC	KSSHDRCLEK	SSSSSSQPEH
SAMLVSTAAS	PSLIKETTTG	YYKDIVENIC	GREKSGIQPL	CPERSHISDQ
SPLSSKRKAL	EESESSQLIS	PPLAQAIRDY	VNSLLVQGGV	GSLPGTSNSM
PPLDVENIQK	RIDQSKFQET	EFLSPPRKVP	RLSEKSVEER	DSGSFVAFQN
IPGSELMSSF	AKTVVSHSLT	TLGLEVAKQS	QHDKIDASEL	SFPFHESILK
VIEEEWQQVD	RQLPSLACKY	PVSSREATQI	LSVPKVDDEI	LGFISEATPL
GGIQAASTES	CNQQLDLALC	RAYEAAASAL	QIATHTAFVA	KAMQADISQA
AQILSSDPSR	THQALGILSK	TYDAASYICE	AAFDEVKMAA	HTMGNATVGR
RYLWLKDCKI	NLASKNKLAS	TPFKGGTLFG	GEVCKVIKKR	GNKH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Harris C.A., Andryuk P.J., Cline S.W., Siekierka J.J., Goldstein G. (1995). Structure and mapping of the human thymopoietin (TMPO) gene and relationship of human TMPO beta to rat lamin-associated polypeptide 2.. Genomics 28: 198 — 205. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1131
Audhya T., Schlesinger D.H., Goldstein G. (1987). Isolation and complete amino acid sequence of human thymopoietin and splenin.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3545 — 3549. PubMed DOI:10.1073/pnas.84.11.3545
Goldstein G., Schlesinger D.H., Audhya T. (1994). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6249 — 6249. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.13.6249
Markiewicz E., Dechat T., Foisner R., Quinlan R.A., Hutchison C.J. (2002). Lamin A/C binding protein LAP2alpha is required for nuclear anchorage of retinoblastoma protein.. Mol. Biol. Cell 13: 4401 — 4413. PubMed DOI:10.1091/mbc.E02-07-0450
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line.. Electrophoresis 28: 2027 — 2034. PubMed DOI:10.1002/elps.200600782
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment.. J. Proteome Res. 7: 5167 — 5176. PubMed DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11875 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P42166 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11875 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P42166 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.