A1CF
A1CF (англ. APOBEC1 complementation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 65 202[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MESNHKSGDG | LSGTQKEAAL | RALVQRTGYS | LVQENGQRKY | GGPPPGWDAA | ||||
PPERGCEIFI | GKLPRDLFED | ELIPLCEKIG | KIYEMRMMMD | FNGNNRGYAF | ||||
VTFSNKVEAK | NAIKQLNNYE | IRNGRLLGVC | ASVDNCRLFV | GGIPKTKKRE | ||||
EILSEMKKVT | EGVVDVIVYP | SAADKTKNRG | FAFVEYESHR | AAAMARRKLL | ||||
PGRIQLWGHG | IAVDWAEPEV | EVDEDTMSSV | KILYVRNLML | STSEEMIEKE | ||||
FNNIKPGAVE | RVKKIRDYAF | VHFSNREDAV | EAMKALNGKV | LDGSPIEVTL | ||||
AKPVDKDSYV | RYTRGTGGRG | TMLQGEYTYS | LGQVYDPTTT | YLGAPVFYAP | ||||
QTYAAIPSLH | FPATKGHLSN | RAIIRAPSVR | EIYMNVPVGA | AGVRGLGGRG | ||||
YLAYTGLGRG | YQVKGDKRED | KLYDILPGME | LTPMNPVTLK | PQGIKLAPQI | ||||
LEEICQKNNW | GQPVYQLHSA | IGQDQRQLFL | YKITIPALAS | QNPAIHPFTP | ||||
PKLSAFVDEA | KTYAAEYTLQ | TLGIPTDGGD | GTMATAAAAA | TAFPGYAVPN | ||||
ATAPVSAAQL | KQAVTLGQDL | AAYTTYEVYP | TFAVTARGDG | YGTF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Цей білок бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину разом з білком APOBEC1. Комплекс редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Він розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF. Від ступеня збігу цієї ділянки різних РНК з послідовністю мРНК ApoB залежить ефективність редагування конкретного цитидину.
Література
- Mehta A., Kinter M.T., Sherman N.E., Driscoll D.M. (2000). Molecular cloning of APOBEC-1 complementation factor, a novel RNA-binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA.. Mol. Cell. Biol. 20: 1846 — 1854. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Henderson J.O., Blanc V., Davidson N.O. (2001). Isolation, characterization and developmental regulation of the human apobec-1 complementation factor (ACF) gene.. Biochim. Biophys. Acta 1522: 22 — 30. PubMed DOI:10.1016/S0167-4781(01)00295-0
- Mehta A., Driscoll D.M. (2002). Identification of domains in apobec-1 complementation factor required for RNA binding and apolipoprotein-B mRNA editing.. RNA 8: 69 — 82. PubMed DOI:10.1017/S1355838202015649
- Blanc V., Kennedy S., Davidson N.O. (2003). A novel nuclear localization signal in the auxiliary domain of apobec-1 complementation factor regulates nucleocytoplasmic import and shuttling.. J. Biol. Chem. 278: 41198 — 41204. PubMed DOI:10.1074/jbc.M302951200
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24086 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
- UniProt, Q9NQ94 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.