A1CF

A1CF (англ. APOBEC1 complementation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 65 202[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESNHKSGDGLSGTQKEAALRALVQRTGYSLVQENGQRKYGGPPPGWDAA
PPERGCEIFIGKLPRDLFEDELIPLCEKIGKIYEMRMMMDFNGNNRGYAF
VTFSNKVEAKNAIKQLNNYEIRNGRLLGVCASVDNCRLFVGGIPKTKKRE
EILSEMKKVTEGVVDVIVYPSAADKTKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLL
PGRIQLWGHGIAVDWAEPEVEVDEDTMSSVKILYVRNLMLSTSEEMIEKE
FNNIKPGAVERVKKIRDYAFVHFSNREDAVEAMKALNGKVLDGSPIEVTL
AKPVDKDSYVRYTRGTGGRGTMLQGEYTYSLGQVYDPTTTYLGAPVFYAP
QTYAAIPSLHFPATKGHLSNRAIIRAPSVREIYMNVPVGAAGVRGLGGRG
YLAYTGLGRGYQVKGDKREDKLYDILPGMELTPMNPVTLKPQGIKLAPQI
LEEICQKNNWGQPVYQLHSAIGQDQRQLFLYKITIPALASQNPAIHPFTP
PKLSAFVDEAKTYAAEYTLQTLGIPTDGGDGTMATAAAAATAFPGYAVPN
ATAPVSAAQLKQAVTLGQDLAAYTTYEVYPTFAVTARGDGYGTF
A1CF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 complementation factor
Зовнішні ІД OMIM: 618199 MGI: 1917115 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
29974
69865
Ensembl
ENSG00000148584
ENSMUSG00000052595
UniProt
Q9NQ94
Q5YD48
RefSeq (мРНК)
NM_001081074
NM_001365078
RefSeq (білок)
NP_001074543
NP_001352007
Локус (UCSC) Хр. 10: 50.8 – 50.89 Mb Хр. 19: 31.85 – 31.93 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Цей білок бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину разом з білком APOBEC1. Комплекс редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Він розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF. Від ступеня збігу цієї ділянки різних РНК з послідовністю мРНК ApoB залежить ефективність редагування конкретного цитидину.

Література

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24086 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NQ94 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.