AICDA

AICDA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5JJ4
Ідентифікатори
Символи	AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, activation-induced cytidine deaminase, activation induced cytidine deaminase
Зовнішні ІД	OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 GeneCards: AICDA
Пов'язані генетичні захворювання
	Hyper-IgM syndrome type 2[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • zinc ion binding; • GO:0001948 protein binding; • каталітична активність; • hydrolase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • зв'язування з іоном металу; • cytidine deaminase activity; • identical protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• Екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • P-body; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• somatic hypermutation of immunoglobulin genes; • DNA demethylation; • mRNA processing; • B cell differentiation; • somatic diversification of immunoglobulins; • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • cytidine deamination; • cellular response to lipopolysaccharide; • Перемикання класу імуноглобулінів; • defense response to bacterium; • regulation of DNA stability; • negative regulation of transposition; • cytidine to uridine editing; • regulation of nuclear cell cycle DNA replication; • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	57379
	11628
	ENSG00000111732
	ENSMUSG00000040627
	Q9GZX7
	Q9WVE0
	NM_020661; NM_001330343
	NM_009645
	NP_001317272; NP_065712
	NP_033775
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AICDA (англ. Activation induced cytidine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 23 954[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSLLMNRRK	FLYQFKNVRW	AKGRRETYLC	YVVKRRDSAT	SFSLDFGYLR
NKNGCHVELL	FLRYISDWDL	DPGRCYRVTW	FTSWSPCYDC	ARHVADFLRG
NPNLSLRIFT	ARLYFCEDRK	AEPEGLRRLH	RAGVQIAIMT	FKDYFYCWNT
FVENHERTFK	AWEGLHENSV	RLSRQLRRIL	LPLYEVDDLR	DAFRTLGL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Muto T., Muramatsu M., Taniwaki M., Kinoshita K., Honjo T. (2000). Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (hAID) gene.. Genomics 68: 85 — 88. PubMed DOI:10.1006/geno.2000.6268
Martin A., Scharff M.D. (2002). Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12304 — 12308. PubMed DOI:10.1073/pnas.192442899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Pasqualucci L., Kitaura Y., Gu H., Dalla-Favera R. (2006). PKA-mediated phosphorylation regulates the function of activation-induced deaminase (AID) in B cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 395 — 400. PubMed DOI:10.1073/pnas.0509969103
Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain.. Cell 145: 423 — 434. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
Demorest Z.L., Li M., Harris R.S. (2011). Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation-induced deaminase and APOBEC3G protein.. J. Biol. Chem. 286: 26568 — 26575. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.235721

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з AICDA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13203 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, Q9GZX7 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з AICDA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13203 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9GZX7 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.