APP

APP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AAP, 1AMB, 1AMC, 1AML, 1BA4, 1BA6, 1BJB, 1BJC, 1BRC, 1CA0, 1HZ3, 1IYT, 1MWP, 1OWT, 1QCM, 1QWP, 1QXC, 1QYT, 1TAW, 1TKN, 1X11, 1Z0Q, 1ZJD, 2BEG, 2BP4, 2FJZ, 2FK1, 2FK2, 2FK3, 2FKL, 2FMA, 2G47, 2IPU, 2LFM, 2LLM, 2LMN, 2LMO, 2LMP, 2LMQ, 2LOH, 2LP1, 2OTK, 2R0W, 2WK3, 2Y29, 2Y2A, 2Y3J, 2Y3K, 2Y3L, 3AYU, 3DXC, 3DXD, 3DXE, 3GCI, 3IFL, 3IFN, 3IFO, 3IFP, 3JTI, 3KTM, 3L33, 3L81, 3MOQ, 3NYL, 3SV1, 3U0T, 3UMH, 3UMI, 3UMK, 4HIX, 1ZE7, 1ZE9, 2LNQ, 2LZ3, 2LZ4, 2M4J, 2M9R, 2M9S, 2MGT, 2MJ1, 2MPZ, 2MVX, 2MXU, 3BAE, 3BKJ, 3JQ5, 3JQL, 3MXC, 3NYJ, 3OVJ, 3OW9, 4JFN, 4M1C, 4MDR, 4NGE, 4OJF, 4ONF, 4ONG, 4PQD, 4PWQ, 4MVI, 4MVK, 4MVL, 4XXD, 5CSZ, 5AMB, 5AEF, 5AM8, 5BUO, 5HOY, 5HOW, 5HOX, 5KK3, 5C67, 2NAO
Ідентифікатори
Символи	APP, AAA, ABETA, ABPP, AD1, APPI, CTFgamma, CVAP, PN-II, PN2, amyloid beta precursor protein, preA4, alpha-sAPP
Зовнішні ІД	OMIM: 104760 MGI: 88059 HomoloGene: 56379 GeneCards: APP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • signaling receptor binding; • acetylcholine receptor binding; • зв'язування з іоном металу; • enzyme binding; • peptidase activator activity; • peptidase inhibitor activity; • GO:0001948 protein binding; • DNA binding; • growth factor receptor binding; • PTB domain binding; • serine-type endopeptidase inhibitor activity; • identical protein binding; • transition metal ion binding; • signaling receptor activator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • гіалоплазма; • trans-Golgi network membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • синапс; • extracellular region; • ciliary rootlet; • spindle midzone; • neuron projection; • rough endoplasmic reticulum; • dendritic spine; • endosome lumen; • dendritic shaft; • cell surface; • terminal bouton; • membrane raft; • Екзосома; • integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • growth cone; • neuromuscular junction; • receptor complex; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • astrocyte projection; • growth cone lamellipodium; • Аксон; • nuclear envelope lumen; • clathrin-coated pit; • platelet alpha granule lumen; • integral component of plasma membrane; • main axon; • smooth endoplasmic reticulum; • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle; • growth cone filopodium; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular space; • Golgi lumen; • perinuclear region of cytoplasm; • early endosome; • endoplasmic reticulum lumen; • Golgi-associated vesicle; • cell projection; • Перикаріон; • presynaptic active zone; • recycling endosome; • клітинне ядро; • Синаптичні бульбашки;
Біологічний процес	• cellular response to nerve growth factor stimulus; • amyloid fibril formation; • negative regulation of neuron differentiation; • neuromuscular process controlling balance; • protein phosphorylation; • regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • cellular copper ion homeostasis; • neuron projection development; • cellular response to cAMP; • suckling behavior; • Апоптоз; • locomotory behavior; • adult locomotory behavior; • positive regulation of mitotic cell cycle; • axo-dendritic transport; • response to oxidative stress; • mRNA polyadenylation; • collateral sprouting in absence of injury; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • Notch signaling pathway; • negative regulation of peptidase activity; • smooth endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis; • synaptic assembly at neuromuscular junction; • neuron remodeling; • dendrite development; • extracellular matrix organization; • cholesterol metabolic process; • mating behavior; • cellular response to norepinephrine stimulus; • нейробіологія розвитку; • адгезія клітин; • response to lead ion; • Регуляція експресії генів; • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • axon midline choice point recognition; • visual learning; • cellular protein metabolic process; • Ендоцитоз; • axonogenesis; • regulation of multicellular organism growth; • platelet degranulation; • positive regulation of peptidase activity; • forebrain development; • regulation of protein binding; • regulation of translation; • regulation of synapse structure or activity; • cellular process; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of endopeptidase activity; • response to yeast; • antibacterial humoral response; • antifungal humoral response; • Вроджений імунітет; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • neuron apoptotic process; • positive regulation of protein phosphorylation; • astrocyte activation involved in immune response; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • learning or memory; • навчення; • negative regulation of cell population proliferation; • response to radiation; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation; • microglia development; • regulation of Wnt signaling pathway; • positive regulation of protein binding; • tumor necrosis factor production; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • positive regulation of phosphorylation; • посттрансляційна модифікація; • positive regulation of JNK cascade; • astrocyte activation; • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • synapse organization; • когнітивність; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of protein metabolic process; • positive regulation of astrocyte activation; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to copper ion; • cellular response to manganese ion; • modulation of age-related behavioral decline; • modulation of excitatory postsynaptic potential; • regulation of spontaneous synaptic transmission; • negative regulation of long-term synaptic potentiation; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of amyloid-beta formation; • positive regulation of microglial cell activation; • cellular response to amyloid-beta; • negative regulation of low-density lipoprotein receptor activity; • regulation of presynapse assembly; • positive regulation of amyloid fibril formation; • neuron projection maintenance; • positive regulation of signaling receptor activity; • regulation of NMDA receptor activity; • positive regulation of T cell migration; • response to interleukin-1; • positive regulation of glycolytic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	351
	11820
	ENSG00000142192
	ENSMUSG00000022892
	P05067
	P12023
NM_201414; NM_000484; NM_001136016; NM_001136129; NM_001136130;
	NM_001136131; NM_001204301; NM_001204302; NM_001204303; NM_201413; NM_001385253
	NM_001198823; NM_001198824; NM_001198825; NM_001198826; NM_007471
NP_000475; NP_001129488; NP_001129601; NP_001129602; NP_001129603;
	NP_001191230; NP_001191231; NP_001191232; NP_958816; NP_958817
	NP_001185752; NP_001185753; NP_001185754; NP_001185755; NP_031497
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

APP (англ. Amyloid beta precursor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 770 амінокислот, а молекулярна маса — 86 943[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPGLALLLL	AAWTARALEV	PTDGNAGLLA	EPQIAMFCGR	LNMHMNVQNG
KWDSDPSGTK	TCIDTKEGIL	QYCQEVYPEL	QITNVVEANQ	PVTIQNWCKR
GRKQCKTHPH	FVIPYRCLVG	EFVSDALLVP	DKCKFLHQER	MDVCETHLHW
HTVAKETCSE	KSTNLHDYGM	LLPCGIDKFR	GVEFVCCPLA	EESDNVDSAD
AEEDDSDVWW	GGADTDYADG	SEDKVVEVAE	EEEVAEVEEE	EADDDEDDED
GDEVEEEAEE	PYEEATERTT	SIATTTTTTT	ESVEEVVREV	CSEQAETGPC
RAMISRWYFD	VTEGKCAPFF	YGGCGGNRNN	FDTEEYCMAV	CGSAMSQSLL
KTTQEPLARD	PVKLPTTAAS	TPDAVDKYLE	TPGDENEHAH	FQKAKERLEA
KHRERMSQVM	REWEEAERQA	KNLPKADKKA	VIQHFQEKVE	SLEQEAANER
QQLVETHMAR	VEAMLNDRRR	LALENYITAL	QAVPPRPRHV	FNMLKKYVRA
EQKDRQHTLK	HFEHVRMVDP	KKAAQIRSQV	MTHLRVIYER	MNQSLSLLYN
VPAVAEEIQD	EVDELLQKEQ	NYSDDVLANM	ISEPRISYGN	DALMPSLTET
KTTVELLPVN	GEFSLDDLQP	WHSFGADSVP	ANTENEVEPV	DARPAADRGL
TTRPGSGLTN	IKTEEISEVK	MDAEFRHDSG	YEVHHQKLVF	FAEDVGSNKG
AIIGLMVGGV	VIATVIVITL	VMLKKKQYTS	IHHGVVEVDA	AVTPEERHLS
KMQQNGYENP	TYKFFEQMQN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

Yoshikai S., Sasaki H., Doh-ura K., Furuya H., Sakaki Y. (1990). Genomic organization of the human amyloid beta-protein precursor gene.. Gene 87: 257 — 263. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(90)90310-N
Yoshikai S., Sasaki H., Doh-ura K., Furuya H., Sakaki Y. (1991). Gene 102: 291 — 292. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(91)90093-Q
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Schon E.A., Mita S., Sadlock J., Herbert J. (1988). A cDNA specifying the human amyloid beta precursor protein (ABPP) encodes a 95-kDa polypeptide.. Nucleic Acids Res. 16: 9351 — 9351. PubMed DOI:10.1093/nar/16.19.9351
La Fauci G., Lahiri D.K., Salton S.R., Robakis N.K. (1989). Characterization of the 5'-end region and the first two exons of the beta-protein precursor gene.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 159: 297 — 304. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(89)92437-6
Kitaguchi N., Takahashi Y., Tokushima Y., Shiojiri S., Ito H. (1988). Novel precursor of Alzheimer's disease amyloid protein shows protease inhibitory activity.. Nature 331: 530 — 532. PubMed DOI:10.1038/331530a0

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:620 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P05067 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:620 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P05067 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.