ATF4

ATF4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CI6
Ідентифікатори
Символи	ATF4, CREB-2, CREB2, TAXREB67, TXREB, activating transcription factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604064 MGI: 88096 HomoloGene: 1266 GeneCards: ATF4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • leucine zipper domain binding; • protein heterodimerization activity; • protein kinase binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ATF1-ATF4 transcription factor complex; • ATF4-CREB1 transcription factor complex; • transcription regulator complex; • dendrite membrane; • клітинне ядро; • Lewy body core; • nuclear periphery; • мембрана; • клітинна мембрана; • Нуклеоплазма; • Центр організації мікротрубочок; • neuron projection; • Цитоскелет; • CHOP-ATF4 complex; • центросома; • protein-containing complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway; • Глюконеогенез; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death; • cellular response to amino acid starvation; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • response to endoplasmic reticulum stress; • PERK-mediated unfolded protein response; • response to manganese-induced endoplasmic reticulum stress; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of neuron apoptotic process; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; • positive regulation of gene expression; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; • Циркадний ритм; • negative regulation of potassium ion transport; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance; • cellular response to glucose starvation; • negative regulation of translational initiation in response to stress; • ритмічний процес; • cellular response to UV; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress; • cellular amino acid metabolic process; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of vascular endothelial growth factor production; • positive regulation of transcription by RNA polymerase I; • cellular response to dopamine; • response to toxic substance; • neuron differentiation; • cellular response to oxygen-glucose deprivation; • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • cellular calcium ion homeostasis; • positive regulation of biomineral tissue development; • negative regulation of cold-induced thermogenesis; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process; • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	468
	11911
	ENSG00000128272
	ENSMUSG00000042406
	P18848
	Q06507
	NM_182810; NM_001675
	NM_001287180; NM_009716
	NP_001666; NP_877962
	NP_001274109; NP_033846
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATF4 (англ. Activating transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 590[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTEMSFLSSE	VLVGDLMSPF	DQSGLGAEES	LGLLDDYLEV	AKHFKPHGFS
SDKAKAGSSE	WLAVDGLVSP	SNNSKEDAFS	GTDWMLEKMD	LKEFDLDALL
GIDDLETMPD	DLLTTLDDTC	DLFAPLVQET	NKQPPQTVNP	IGHLPESLTK
PDQVAPFTFL	QPLPLSPGVL	SSTPDHSFSL	ELGSEVDITE	GDRKPDYTAY
VAMIPQCIKE	EDTPSDNDSG	ICMSPESYLG	SPQHSPSTRG	SPNRSLPSPG
VLCGSARPKP	YDPPGEKMVA	AKVKGEKLDK	KLKKMEQNKT	AATRYRQKKR
AEQEALTGEC	KELEKKNEAL	KERADSLAKE	IQYLKDLIEE	VRKARGKKRV
P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.

Література

Karpinski B.A., Morle G.D., Huggenvik J., Uhler M.D., Leiden J.M. (1992). Molecular cloning of human CREB-2: an ATF/CREB transcription factor that can negatively regulate transcription from the cAMP response element.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 4820 — 4824. PubMed DOI:10.1073/pnas.89.11.4820
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers.. Genes Dev. 3: 2083 — 2090. PubMed DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death.. EMBO J. 24: 1243 — 1255. PubMed DOI:10.1038/sj.emboj.7600596
Su N., Kilberg M.S. (2008). C/EBP homology protein (CHOP) interacts with activating transcription factor 4 (ATF4) and negatively regulates the stress-dependent induction of the asparagine synthetase gene.. J. Biol. Chem. 283: 35106 — 35117. PubMed DOI:10.1074/jbc.M806874200
Shoval Y., Berissi H., Kimchi A., Pietrokovski S. (2011). New modularity of DAP-kinases: alternative splicing of the DRP-1 gene produces a ZIPk-like isoform.. PLoS ONE 6: E17344 — E17344. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0017344

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:786 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P18848 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:786 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P18848 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.