BACE1

BACE1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FKN, 1M4H, 1PY1, 1SGZ, 1TQF, 1UJJ, 1UJK, 1W50, 1W51, 1XN2, 1XN3, 1XS7, 1YM2, 1YM4, 2B8L, 2B8V, 2F3E, 2F3F, 2FDP, 2G94, 2HIZ, 2HM1, 2IQG, 2IRZ, 2IS0, 2NTR, 2OAH, 2OF0, 2OHK, 2OHL, 2OHM, 2OHN, 2OHP, 2OHQ, 2OHR, 2OHS, 2OHT, 2OHU, 2P4J, 2P83, 2P8H, 2PH6, 2PH8, 2Q11, 2Q15, 2QK5, 2QMD, 2QMF, 2QMG, 2QP8, 2QU2, 2QU3, 2QZK, 2QZL, 2VA5, 2VA6, 2VA7, 2VIE, 2VIJ, 2VIY, 2VIZ, 2VJ6, 2VJ7, 2VJ9, 2VKM, 2VNM, 2VNN, 2WEZ, 2WF0, 2WF1, 2WF2, 2WF3, 2WF4, 2WJO, 2XFI, 2XFJ, 2XFK, 2ZDZ, 2ZE1, 2ZHR, 2ZHS, 2ZHT, 2ZHU, 2ZHV, 2ZJH, 2ZJI, 2ZJJ, 2ZJK, 2ZJL, 2ZJM, 2ZJN, 3BRA, 3BUF, 3BUG, 3BUH, 3CIB, 3CIC, 3CID, 3CKP, 3CKR, 3DM6, 3DUY, 3DV1, 3DV5, 3EXO, 3FKT, 3H0B, 3HVG, 3HW1, 3I25, 3IGB, 3IN3, 3IN4, 3IND, 3INE, 3INF, 3INH, 3IVH, 3IVI, 3IXJ, 3IXK, 3KYR, 3L38, 3L3A, 3LHG, 3LNK, 3MSJ, 3MSK, 3MSL, 3N4L, 3NSH, 3OOZ, 3QI1, 3R1G, 3RSV, 3RTM, 3RVI, 3S2O, 3S7L, 3S7M, 3TPJ, 3TPL, 3TPP, 3TPR, 3UDH, 3UDJ, 3UDK, 3UDM, 3UDN, 3UDP, 3UDQ, 3UDR, 3UDY, 3UFL, 3UQP, 3UQR, 3UQU, 3UQW, 3UQX, 3VEU, 3VF3, 3VG1, 3VV6, 3VV7, 3ZMG, 3ZOV, 4ACU, 4ACX, 4AZY, 4B00, 4B05, 4B0Q, 4B1C, 4B1D, 4B1E, 4B70, 4B72, 4B77, 4B78, 4BEK, 4BFD, 4D83, 4D85, 4D88, 4D89, 4D8C, 4DH6, 4DI2, 4DJU, 4DJV, 4DJW, 4DJX, 4DJY, 4DPF, 4DPI, 4DUS, 4DV9, 4DVF, 4EWO, 4EXG, 4FCO, 4FGX, 4FM7, 4FM8, 4FRI, 4FRJ, 4FRK, 4FRS, 4FS4, 4FSE, 4FSL, 4GMI, 4H1E, 4H3F, 4H3G, 4H3I, 4H3J, 4HA5, 4HZT, 4I0E, 4I0F, 4I0G, 4I0H, 4I0J, 4I0Z, 4I10, 4I11, 4I12, 4I1C, 4J0T, 4J0V, 4J0Y, 4J0Z, 4J17, 4J1C, 4J1E, 4J1F, 4J1H, 4J1I, 4J1K, 4JOO, 4JP9, 4JPC, 4JPE, 4K8S, 4K9H, 4KE0, 4KE1, 3K5C, 3K5D, 3K5F, 3K5G, 3KMX, 3KMY, 3KN0, 3L58, 3L59, 3L5B, 3L5C, 3L5D, 3L5E, 3L5F, 3LPI, 3LPJ, 3LPK, 3OHF, 3OHH, 3PI5, 3QBH, 3R2F, 3RSX, 3RTH, 3RTN, 3RU1, 3SKF, 3SKG, 3U6A, 4GID, 4LXA, 4LXK, 4LXM, 3WB4, 3WB5, 4I0D, 4I0I, 4IVS, 4IVT, 4J0P, 4L7G, 4L7H, 4L7J, 4LC7, 4N00, 4PZW, 4PZX, 4R5N, 4R8Y, 4R91, 4R92, 4R93, 4R95, 4RCD, 4RCE, 4RCF, 4RRN, 4RRO, 4RRS, 4WY1, 4WY6, 4X2L, 4X7I, 4XKX, 4XXS, 4YBI, 4TRW, 4TRZ, 4ZSM, 4ZSP, 4ZSQ, 4ZSR, 4TRY, 4ZPF, 4ZPG, 5CLM, 5F01, 5EZZ, 5DQC, 5F00, 5EZX, 5HE7, 5HD0, 5HDX, 5HDV, 5HE5, 5HE4, 5HDU, 5HDZ, 5I3X, 5I3W, 5I3V, 5IE1, 5I3Y, 5ENK
Ідентифікатори
Символи	BACE1, ASP2, BACE, HSPC104, beta-secretase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604252 MGI: 1346542 HomoloGene: 8014 GeneCards: BACE1
шифр КФ	3.4.23.46
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • amyloid-beta binding; • beta-aspartyl-peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • hydrolase activity; • peptidase activity; • aspartic-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• multivesicular body; • late endosome; • endoplasmic reticulum lumen; • мембрана; • клітинна мембрана; • cell surface; • Аксон; • Ендоплазматичний ретикулум; • Golgi-associated vesicle lumen; • endosome membrane; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • integral component of plasma membrane; • membrane raft; • комплекс Ґольджі; • integral component of membrane; • Ендосома; • trans-Golgi network; • Лізосома; • early endosome; • Синаптичні бульбашки; • Дендрит (нейробіологія); • neuronal cell body; • recycling endosome; • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; • presynapse;
Біологічний процес	• cellular protein metabolic process; • protein catabolic process; • Протеоліз; • amyloid-beta metabolic process; • membrane protein ectodomain proteolysis; • modulation of chemical synaptic transmission; • response to radiation; • response to lead ion; • positive regulation of neuron apoptotic process; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • prepulse inhibition; • cellular response to copper ion; • cellular response to manganese ion; • cellular response to amyloid-beta; • regulation of synaptic vesicle exocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23621
	23821
	ENSG00000186318
	ENSMUSG00000032086
	P56817
	P56818
NM_138973; NM_001207048; NM_001207049; NM_012104; NM_138971;
	NM_138972
	NM_001145947; NM_011792
NP_001193977; NP_001193978; NP_036236; NP_620427; NP_620428;
	NP_620429; NP_036236.1
	NP_001139419; NP_035922
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BACE1 (англ. Beta-secretase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 55 764[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQALPWLLL	WMGAGVLPAH	GTQHGIRLPL	RSGLGGAPLG	LRLPRETDEE
PEEPGRRGSF	VEMVDNLRGK	SGQGYYVEMT	VGSPPQTLNI	LVDTGSSNFA
VGAAPHPFLH	RYYQRQLSST	YRDLRKGVYV	PYTQGKWEGE	LGTDLVSIPH
GPNVTVRANI	AAITESDKFF	INGSNWEGIL	GLAYAEIARP	DDSLEPFFDS
LVKQTHVPNL	FSLQLCGAGF	PLNQSEVLAS	VGGSMIIGGI	DHSLYTGSLW
YTPIRREWYY	EVIIVRVEIN	GQDLKMDCKE	YNYDKSIVDS	GTTNLRLPKK
VFEAAVKSIK	AASSTEKFPD	GFWLGEQLVC	WQAGTTPWNI	FPVISLYLMG
EVTNQSFRIT	ILPQQYLRPV	EDVATSQDDC	YKFAISQSST	GTVMGAVIME
GFYVVFDRAR	KRIGFAVSAC	HVHDEFRTAA	VEGPFVTLDM	EDCGYNIPQT
DESTLMTIAY	VMAAICALFM	LPLCLMVCQW	RCLRCLRQQH	DDFADDISLL
K

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, аспартилових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Tanahashi H., Tabira T. (2001). Three novel alternatively spliced isoforms of the human beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme (BACE) and their effect on amyloid beta-peptide production.. Neurosci. Lett. 307: 9 — 12. PubMed DOI:10.1016/S0304-3940(01)01912-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yan R., Han P., Miao H., Greengard P., Xu H. (2001). The transmembrane domain of the Alzheimer's beta-secretase (BACE1) determines its late Golgi localization and access to beta -amyloid precursor protein (APP) substrate.. J. Biol. Chem. 276: 36788 — 36796. PubMed DOI:10.1074/jbc.M104350200
Fischer F., Molinari M., Bodendorf U., Paganetti P. (2002). The disulphide bonds in the catalytic domain of BACE are critical but not essential for amyloid precursor protein processing activity.. J. Neurochem. 80: 1079 — 1088. PubMed DOI:10.1046/j.0022-3042.2002.00806.x
Costantini C., Ko M.H., Jonas M.C., Puglielli L. (2007). A reversible form of lysine acetylation in the ER and Golgi lumen controls the molecular stabilization of BACE1.. Biochem. J. 407: 383 — 395. PubMed DOI:10.1042/BJ20070040
Jonas M.C., Costantini C., Puglielli L. (2008). PCSK9 is required for the disposal of non-acetylated intermediates of the nascent membrane protein BACE1.. EMBO Rep. 9: 916 — 922. PubMed DOI:10.1038/embor.2008.132

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:933 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P56817 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:933 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P56817 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.