BRD4

BRD4
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2I8N, 2LSP, 2MJV, 2OSS, 2OUO, 2YEL, 2YEM, 3MXF, 3P5O, 3SVF, 3SVG, 3U5J, 3U5K, 3U5L, 3UVW, 3UVX, 3UVY, 3UW9, 3ZYU, 4A9L, 4BJX, 4BW1, 4BW2, 4BW3, 4BW4, 4C66, 4C67, 4CFK, 4CFL, 4CL9, 4CLB, 4DON, 4E96, 4F3I, 4GPJ, 4HBV, 4HBW, 4HBX, 4HBY, 4HXK, 4HXL, 4HXM, 4HXN, 4HXO, 4HXP, 4HXR, 4HXS, 4IOO, 4IOQ, 4IOR, 4J0R, 4J0S, 4J3I, 4KV1, 4KV4, 4LR6, 4LRG, 4LYI, 4LYS, 4LYW, 4LZR, 4LZS, 4MEN, 4MEO, 4MEP, 4MEQ, 4MR3, 4MR4, 4NQM, 4NR8, 4NUC, 4NUD, 4NUE, 4O70, 4O71, 4O72, 4O74, 4O75, 4O76, 4O77, 4O78, 4O7A, 4O7B, 4O7C, 4O7E, 4O7F, 4OGI, 4OGJ, 4PCE, 4PCI, 4PS5, 4QB3, 4QR3, 4QR4, 4QR5, 4QZS, 4UIX, 4UIZ, 4UYD, 4WIV, 4XY9, 4XYA, 4Z1Q, 4Z1S, 4Z93, 5A5S, 5A85, 5BT4, 5D3T, 5D3S, 5D3H, 5D3J, 5CTL, 4WHW, 5D3R, 4X2I, 5CPE, 5CRZ, 4YH3, 4ZC9, 5EI4, 5D3P, 5CQT, 5D3L, 5EIS, 5CRM, 5D0C, 5EGU, 5CP5, 5D25, 5CY9, 5COI, 5D26, 4YH4, 5CS8, 5ACY, 5DX4, 5D24, 5HM0, 5HLS, 2N3K, 5JWM, 5DLX, 2NCZ, 2NNU, 5DW2, 2ND1, 4ZW1, 5CFW, 2ND0, 5DLZ
Ідентифікатори
Символи	BRD4, CAP, HUNK1, HUNKI, MCAP, bromodomain containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608749 HomoloGene: 137685 GeneCards: BRD4
Реагує на сполуку
	JQ1, LY-294002, Viroporin 3a [SARS-CoV-2][1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• p53 binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding; • lysine-acetylated histone binding; • RNA polymerase II complex binding; • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity; • enzyme binding; • RNA polymerase II C-terminal domain binding; • P-TEFb complex binding;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • хромосома; • condensed nuclear chromosome; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• Ремоделювання хроматину; • regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of DNA damage checkpoint; • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; • GO:0022415 viral process; • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • chromatin organization; • protein phosphorylation; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of histone H3-K36 trimethylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23476
	н/д
	ENSG00000141867
	н/д
	O60885
	н/д
	NM_014299; NM_058243; NM_001330384; NM_001379291; NM_001379292
	н/д
	NP_001317313; NP_055114; NP_490597; NP_001366220; NP_001366221
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

BRD4 (англ. Bromodomain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 362 амінокислот, а молекулярна маса — 152 219[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAESGPGTR	LRNLPVMGDG	LETSQMSTTQ	AQAQPQPANA	ASTNPPPPET
SNPNKPKRQT	NQLQYLLRVV	LKTLWKHQFA	WPFQQPVDAV	KLNLPDYYKI
IKTPMDMGTI	KKRLENNYYW	NAQECIQDFN	TMFTNCYIYN	KPGDDIVLMA
EALEKLFLQK	INELPTEETE	IMIVQAKGRG	RGRKETGTAK	PGVSTVPNTT
QASTPPQTQT	PQPNPPPVQA	TPHPFPAVTP	DLIVQTPVMT	VVPPQPLQTP
PPVPPQPQPP	PAPAPQPVQS	HPPIIAATPQ	PVKTKKGVKR	KADTTTPTTI
DPIHEPPSLP	PEPKTTKLGQ	RRESSRPVKP	PKKDVPDSQQ	HPAPEKSSKV
SEQLKCCSGI	LKEMFAKKHA	AYAWPFYKPV	DVEALGLHDY	CDIIKHPMDM
STIKSKLEAR	EYRDAQEFGA	DVRLMFSNCY	KYNPPDHEVV	AMARKLQDVF
EMRFAKMPDE	PEEPVVAVSS	PAVPPPTKVV	APPSSSDSSS	DSSSDSDSST
DDSEEERAQR	LAELQEQLKA	VHEQLAALSQ	PQQNKPKKKE	KDKKEKKKEK
HKRKEEVEEN	KKSKAKEPPP	KKTKKNNSSN	SNVSKKEPAP	MKSKPPPTYE
SEEEDKCKPM	SYEEKRQLSL	DINKLPGEKL	GRVVHIIQSR	EPSLKNSNPD
EIEIDFETLK	PSTLRELERY	VTSCLRKKRK	PQAEKVDVIA	GSSKMKGFSS
SESESSSESS	SSDSEDSETE	MAPKSKKKGH	PGREQKKHHH	HHHQQMQQAP
APVPQQPPPP	PQQPPPPPPP	QQQQQPPPPP	PPPSMPQQAA	PAMKSSPPPF
IATQVPVLEP	QLPGSVFDPI	GHFTQPILHL	PQPELPPHLP	QPPEHSTPPH
LNQHAVVSPP	ALHNALPQQP	SRPSNRAAAL	PPKPARPPAV	SPALTQTPLL
PQPPMAQPPQ	VLLEDEEPPA	PPLTSMQMQL	YLQQLQKVQP	PTPLLPSVKV
QSQPPPPLPP	PPHPSVQQQL	QQQPPPPPPP	QPQPPPQQQH	QPPPRPVHLQ
PMQFSTHIQQ	PPPPQGQQPP	HPPPGQQPPP	PQPAKPQQVI	QHHHSPRHHK
SDPYSTGHLR	EAPSPLMIHS	PQMSQFQSLT	HQSPPQQNVQ	PKKQELRAAS
VVQPQPLVVV	KEEKIHSPII	RSEPFSPSLR	PEPPKHPESI	KAPVHLPQRP
EMKPVDVGRP	VIRPPEQNAP	PPGAPDKDKQ	KQEPKTPVAP	KKDLKIKNMG
SWASLVQKHP	TTPSSTAKSS	SDSFEQFRRA	AREKEEREKA	LKAQAEHAEK
EKERLRQERM	RSREDEDALE	QARRAHEEAR	RRQEQQQQQR	QEQQQQQQQQ
AAAVAAAATP	QAQSSQPQSM	LDQQRELARK	REQERRRREA	MAATIDMNFQ
SDLLSIFEEN	LF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Parish J.L., Bean A.M., Park R.B., Androphy E.J. (2006). ChlR1 is required for loading papillomavirus E2 onto mitotic chromosomes and viral genome maintenance.. Mol. Cell 24: 867 — 876. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2006.11.005
Lin A., Wang S., Nguyen T., Shire K., Frappier L. (2008). The EBNA1 protein of Epstein-Barr virus functionally interacts with Brd4.. J. Virol. 82: 12009 — 12019. PubMed DOI:10.1128/JVI.01680-08
Hargreaves D.C., Horng T., Medzhitov R. (2009). Control of inducible gene expression by signal-dependent transcriptional elongation.. Cell 138: 129 — 145. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2009.05.047
Huang B., Yang X.D., Zhou M.M., Ozato K., Chen L.F. (2009). Brd4 coactivates transcriptional activation of NF-kappaB via specific binding to acetylated RelA.. Mol. Cell. Biol. 29: 1375 — 1387. PubMed DOI:10.1128/MCB.01365-08
Wang R., Li Q., Helfer C.M., Jiao J., You J. (2012). Bromodomain protein Brd4 associated with acetylated chromatin is important for maintenance of higher-order chromatin structure.. J. Biol. Chem. 287: 10738 — 10752. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.323493

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Bromodomain containing 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13575 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O60885 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Bromodomain containing 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13575 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O60885 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.