CBX5

CBX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3FDT, 3I3C
Ідентифікатори
Символи	CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCards: CBX5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948 protein binding; • protein-macromolecule adaptor activity; • chromatin binding; • histone deacetylase binding; • methylated histone binding; • ribonucleoprotein complex binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• Кінетохор; • клітинне ядро; • nuclear envelope; • pericentric heterochromatin; • Ядерце; • histone deacetylase complex; • Нуклеоплазма; • chromocenter; • Гетерохроматин; • центромера; • histone methyltransferase complex; • transcription repressor complex; • хромосома; • PML body; • protein-containing complex; • Рибонуклеопротеїни; • site of DNA damage;
Біологічний процес	• зсідання крові; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of G0 to G1 transition; • cellular response to DNA damage stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23468
	12419
	ENSG00000094916
	ENSMUSG00000009575
	P45973
	Q61686
	NM_012117; NM_001127321; NM_001127322
	NM_001076789; NM_001110216; NM_007626; NM_001358950
	NP_001120793; NP_001120794; NP_036249
	NP_001070257; NP_001103686; NP_031652; NP_001345879
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CBX5 (англ. Chromobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 22 225[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKTKRTAD	SSSSEDEEEY	VVEKVLDRRV	VKGQVEYLLK	WKGFSEEHNT
WEPEKNLDCP	ELISEFMKKY	KKMKEGENNK	PREKSESNKR	KSNFSNSADD
IKSKKKREQS	NDIARGFERG	LEPEKIIGAT	DSCGDLMFLM	KWKDTDEADL
VLAKEANVKC	PQIVIAFYEE	RLTWHAYPED	AENKEKETAK	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ye Q., Worman H.J. (1996). Interaction between an integral protein of the nuclear envelope inner membrane and human chromodomain proteins homologous to Drosophila HP1.. J. Biol. Chem. 271: 14653 — 14656. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.25.14653
Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR.. J. Biol. Chem. 272: 14983 — 14989. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.23.14983
Minc E., Allory Y., Worman H.J., Courvalin J.-C., Buendia B. (1999). Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells.. Chromosoma 108: 220 — 234. PubMed DOI:10.1007/s004120050372
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins.. Nature 410: 116 — 120. PubMed DOI:10.1038/35065132
Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929 — 937. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.016

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P45973 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P45973 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.