CCR5

CCR5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L87, 2RLL, 2RRS, 2MZX, 4MBS
Ідентифікатори
Символи	CCR5, CC-CKR-5, CCCKR5, CCR-5, CD195, CKR-5, CKR5, CMKBR5, IDDM22, C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene), C-C motif chemokine receptor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601373 MGI: 107182 HomoloGene: 37325 GeneCards: CCR5
Пов'язані генетичні захворювання
	type 1 diabetes mellitus 22[1]
Реагує на сполуку
	aplaviroc, ценікрівірок, маравірок, vicriviroc[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • coreceptor activity; • chemokine (C-C motif) ligand 5 binding; • virus receptor activity; • signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • chemokine receptor activity; • C-C chemokine receptor activity; • actin binding; • phosphatidylinositol phospholipase C activity; • C-C chemokine binding; • chemokine binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • Ендосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • external side of plasma membrane; • cell surface;
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway; • signaling; • response to cholesterol; • release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • cell-cell signaling; • dendritic cell chemotaxis; • MAPK cascade; • хемотаксис; • cellular defense response; • cell surface receptor signaling pathway; • Імунна відповідь; • inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • calcium ion transport; • calcium-mediated signaling; • Сигнальна трансдукція; • fusion of virus membrane with host plasma membrane; • chemokine-mediated signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • defense response; • negative regulation of macrophage apoptotic process; • cytokine-mediated signaling pathway; • cell chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1234
	12774
	ENSG00000160791
	ENSMUSG00000079227
	P51681
	P51682
	NM_001100168; NM_000579; NM_001394783
	NM_009917
	NP_000570; NP_001093638
	NP_034047
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CCR5 (англ. C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 524[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDYQVSSPIY	DINYYTSEPC	QKINVKQIAA	RLLPPLYSLV	FIFGFVGNML
VILILINCKR	LKSMTDIYLL	NLAISDLFFL	LTVPFWAHYA	AAQWDFGNTM
CQLLTGLYFI	GFFSGIFFII	LLTIDRYLAV	VHAVFALKAR	TVTFGVVTSV
ITWVVAVFAS	LPGIIFTRSQ	KEGLHYTCSS	HFPYSQYQFW	KNFQTLKIVI
LGLVLPLLVM	VICYSGILKT	LLRCRNEKKR	HRAVRLIFTI	MIVYFLFWAP
YNIVLLLNTF	QEFFGLNNCS	SSNRLDQAMQ	VTETLGMTHC	CINPIIYAFV
GEKFRNYLLV	FFQKHIAKRF	CKCCSIFQQE	APERASSVYT	RSTGEQEISV
GL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Samson M., Labbe O., Mollereau C., Vassart G., Parmentier M. (1996). Molecular cloning and functional expression of a new human CC-chemokine receptor gene.. Biochemistry 35: 3362 — 3367. PubMed DOI:10.1021/bi952950g
Raport C.J., Gosling J., Schweichart V.L., Gray P.W., Charo I.F. (1996). Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor (CCR5) for RANTES, MIP-1beta, and MIP-1alpha.. J. Biol. Chem. 271: 17161 — 17166. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.29.17161
Mummidi S., Ahuja S.S., McDaniel B.L., Ahuja S.K. (1997). The human CC chemokine receptor 5 (CCR5) gene. Multiple transcripts with 5'-end heterogeneity, dual promoter usage, and evidence for polymorphisms within the regulatory regions and noncoding exons.. J. Biol. Chem. 272: 30662 — 30671. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.49.30662
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Oppermann M., Mack M., Proudfoot A.E., Olbrich H. (1999). Differential effects of CC chemokines on CC chemokine receptor 5 (CCR5) phosphorylation and identification of phosphorylation sites on the CCR5 carboxyl terminus.. J. Biol. Chem. 274: 8875 — 8885. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.13.8875
Schweneker M., Bachmann A.S., Moelling K. (2005). JM4 is a four-transmembrane protein binding to the CCR5 receptor.. FEBS Lett. 579: 1751 — 1758. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2005.02.037

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1606 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P51681 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1606 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P51681 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.