CD40

CD40
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CZZ, 1D00, 1FLL, 1LB6, 3QD6, 5DMJ, 5IHL, 5DMI
Ідентифікатори
Символи	CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, CD40 deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003823 antigen binding; • signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • tumor necrosis factor-activated receptor activity; • enzyme binding; • ubiquitin protein ligase binding; • protein domain specific binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • cell surface; • CD40 receptor complex; • Екзосома; • external side of plasma membrane; • extracellular space; • neuronal cell body; • varicosity;
Біологічний процес	• positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of interleukin-12 production; • protein kinase B signaling; • positive regulation of protein kinase C signaling; • immune system process; • cellular calcium ion homeostasis; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway; • platelet activation; • multicellular organism development; • B cell activation; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • response to lipopolysaccharide; • B cell proliferation; • cellular response to mechanical stimulus; • positive regulation of endothelial cell apoptotic process; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of B cell proliferation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • defense response to virus; • Імунна відповідь; • regulation of immune response; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • apoptotic signaling pathway; • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • defense response to protozoan; • response to bacterium; • response to nutrient levels; • response to cobalamin; • response to interferon-gamma; • cellular response to erythropoietin; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to peptide; • inflammatory response; • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of angiogenesis; • protein-containing complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	958
	21939
	ENSG00000101017
	ENSMUSG00000017652
	P25942
	P27512
NM_001250; NM_001302753; NM_152854; NM_001322421; NM_001322422;
	NM_001362758
	NM_011611; NM_170702; NM_170703; NM_170704
NP_001241; NP_001289682; NP_001309350; NP_001309351; NP_690593;
	NP_001349687
	NP_035741; NP_733803; NP_733804; NP_733805
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRLPLQCVL	WGCLLTAVHP	EPPTACREKQ	YLINSQCCSL	CQPGQKLVSD
CTEFTETECL	PCGESEFLDT	WNRETHCHQH	KYCDPNLGLR	VQQKGTSETD
TICTCEEGWH	CTSEACESCV	LHRSCSPGFG	VKQIATGVSD	TICEPCPVGF
FSNVSSAFEK	CHPWTSCETK	DLVVQQAGTN	KTDVVCGPQD	RLRALVVIPI
IFGILFAILL	VLVFIKKVAK	KPTNKAPHPK	QEPQEINFPD	DLPGSNTAAP
VQETLHGCQP	VTQEDGKESR	ISVQERQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751 — 1756. PubMed DOI:10.1073/pnas.98.4.1751
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40.. FEBS Lett. 358: 113 — 118. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40.. Proteins 27: 59 — 70. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas.. EMBO J. 8: 1403 — 1410. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P25942 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P25942 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.