CHRNA7

CHRNA7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5AFK, 5AFJ, 5AFL, 2MAW, 5AFN, 5AFM, 5AFH
Ідентифікатори
Символи	CHRNA7, CHRNA7-2, NACHRA7, cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 118511 MGI: 99779 HomoloGene: 593 GeneCards: CHRNA7
Реагує на сполуку
	encenicline, PNU-120596, mecamylamine[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • acetylcholine binding; • acetylcholine-gated cation-selective channel activity; • amyloid-beta binding; • acetylcholine receptor activity; • ion channel activity; • chloride channel regulator activity; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • toxic substance binding; • ligand-gated ion channel activity; • transmembrane signaling receptor activity; • calcium channel activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • acetylcholine-gated channel complex; • postsynaptic membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • Синапс; • Міжклітинні контакти; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • plasma membrane raft; • postsynapse;
Біологічний процес	• response to hypoxia; • Когнітивність; • cellular calcium ion homeostasis; • ion transport; • positive regulation of angiogenesis; • ion transmembrane transport; • positive regulation of cell population proliferation; • транспорт; • calcium ion transport; • Сигнальна трансдукція; • synaptic transmission, cholinergic; • пам'ять; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • response to nicotine; • regulation of postsynaptic membrane potential; • excitatory postsynaptic potential; • positive regulation of protein phosphorylation; • chemical synaptic transmission; • learning or memory; • Короткочасна пам'ять; • regulation of membrane potential; • synapse organization; • nervous system process; • sensory processing; • positive regulation of protein metabolic process; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • calcium ion transmembrane transport; • acetylcholine receptor signaling pathway; • dendritic spine organization; • modulation of excitatory postsynaptic potential; • dendrite arborization; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • regulation of neuron death; • positive regulation of amyloid-beta formation; • negative regulation of amyloid-beta formation; • regulation of amyloid precursor protein catabolic process; • response to amyloid-beta; • response to acetylcholine; • regulation of amyloid fibril formation; • positive regulation of CoA-transferase activity; • positive regulation of excitatory postsynaptic potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1139
	11441
	ENSG00000274542; ENSG00000175344; ENSG00000282088
	ENSMUSG00000030525
	P36544
	P49582
	NM_000746; NM_001190455
	NM_007390
	NP_000737; NP_001177384
	NP_031416
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHRNA7 (англ. CHRNA7 (exons 5-10) and FAM7A (exons A-E) fusion) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 56 449[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRCSPGGVWL	ALAASLLHVS	LQGEFQRKLY	KELVKNYNPL	ERPVANDSQP
LTVYFSLSLL	QIMDVDEKNQ	VLTTNIWLQM	SWTDHYLQWN	VSEYPGVKTV
RFPDGQIWKP	DILLYNSADE	RFDATFHTNV	LVNSSGHCQY	LPPGIFKSSC
YIDVRWFPFD	VQHCKLKFGS	WSYGGWSLDL	QMQEADISGY	IPNGEWDLVG
IPGKRSERFY	ECCKEPYPDV	TFTVTMRRRT	LYYGLNLLIP	CVLISALALL
VFLLPADSGE	KISLGITVLL	SLTVFMLLVA	EIMPATSDSV	PLIAQYFAST
MIIVGLSVVV	TVIVLQYHHH	DPDGGKMPKW	TRVILLNWCA	WFLRMKRPGE
DKVRPACQHK	QRRCSLASVE	MSAVAPPPAS	NGNLLYIGFR	GLDGVHCVPT
PDSGVVCGRM	ACSPTHDEHL	LHGGQPPEGD	PDLAKILEEV	RYIANRFRCQ
DESEAVCSEW	KFAACVVDRL	CLMAFSVFTI	ICTIGILMSA	PNFVEAVSKD
FA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32.. FEBS Lett. 400: 309 — 314. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Riley B., Williamson M., Collier D., Wilkie H., Makoff A. (2002). A 3-Mb map of a large segmental duplication overlapping the alpha7-nicotinic acetylcholine receptor gene (CHRNA7) at human 15q13-q14.. Genomics 79: 197 — 209. PubMed DOI:10.1006/geno.2002.6694
Peng X., Katz M., Gerzanich V., Anand R., Lindstrom J. (1994). Human alpha 7 acetylcholine receptor: cloning of the alpha 7 subunit from the SH-SY5Y cell line and determination of pharmacological properties of native receptors and functional alpha 7 homomers expressed in Xenopus oocytes.. Mol. Pharmacol. 45: 546 — 554. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1960 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P36544 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1960 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P36544 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.