CLC

CLC
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1G86, 1HDK, 1LCL, 1QKQ
Ідентифікатори
Символи	CLC, GAL10, Gal-10, LGALS10, LGALS10A, LPPL_HUMAN, Charcot-Leyden crystal galectin, galectin-10
Зовнішні ІД	OMIM: 153310 HomoloGene: 130498 GeneCards: CLC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • lysophospholipase activity; • GO:0001948 protein binding; • carbohydrate binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • T cell apoptotic process; • regulation of T cell cytokine production; • regulation of activated T cell proliferation; • regulation of T cell anergy;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1178
	н/д
	ENSG00000105205
	н/д
	Q05315
	н/д
	NM_001828
	н/д
	NP_001819
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

CLC (англ. Charcot-Leyden crystal galectin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 453[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLLPVPYTE	AASLSTGSTV	TIKGRPLACF	LNEPYLQVDF	HTEMKEESDI
VFHFQVCFGR	RVVMNSREYG	AWKQQVESKN	MPFQDGQEFE	LSISVLPDKY
QVMVNGQSSY	TFDHRIKPEA	VKMVQVWRDI	SLTKFNVSYL	KR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Dyer K.D., Handen J.S., Rosenberg H.F. (1997). The genomic structure of the human Charcot-Leyden crystal protein gene is analogous to those of the galectin genes.. Genomics 40: 217 — 221. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.4590
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ghafouri B., Irander K., Lindbom J., Tagesson C., Lindahl M. (2006). Comparative proteomics of nasal fluid in seasonal allergic rhinitis.. J. Proteome Res. 5: 330 — 338. PubMed DOI:10.1021/pr050341h
Chua J.C., Douglass J.A., Gillman A., O'Hehir R.E., Meeusen E.N. (2012). Galectin-10, a potential biomarker of eosinophilic airway inflammation.. PLoS ONE 7: E42549 — E42549. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0042549
Swaminathan G.J., Leonidas D.D., Savage M.P., Ackerman S.J., Acharya K.R. (1999). Selective recognition of mannose by the human eosinophil Charcot-Leyden crystal protein (galectin-10): a crystallographic study at 1.8 A resolution.. Biochemistry 38: 13837 — 13843. PubMed DOI:10.1021/bi990756e

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2014 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q05315 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2014 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-3] UniProt, Q05315 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.