COMP

COMP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3FBY
Ідентифікатори
Символи	COMP, EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5, cartilage oligomeric matrix protein, TSP5, CTS2
Зовнішні ІД	OMIM: 600310 MGI: 88469 HomoloGene: 74 GeneCards: COMP
Пов'язані генетичні захворювання
	pseudoachondroplasia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protease binding; • calcium ion binding; • heparan sulfate proteoglycan binding; • heparin binding; • extracellular matrix structural constituent; • GO:0001948 protein binding; • collagen binding; • integrin binding; • BMP binding; • proteoglycan binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Екзосома; • extracellular space; • extracellular region; • protein-containing complex; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• animal organ morphogenesis; • growth plate cartilage development; • skeletal system development; • Адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • negative regulation of apoptotic process; • limb development; • Апоптоз; • ossification; • chondrocyte development; • endochondral bone growth; • response to unfolded protein; • зсідання крові; • protein secretion; • multicellular organism aging; • animal organ senescence; • Регуляція експресії генів; • vascular associated smooth muscle contraction; • protein processing; • collagen fibril organization; • bone mineralization; • regulation of bone mineralization; • BMP signaling pathway; • multicellular organism growth; • chondrocyte proliferation; • tendon development; • skin development; • artery morphogenesis; • musculoskeletal movement; • neuromuscular process; • cartilage development; • bone morphogenesis; • platelet aggregation; • vascular associated smooth muscle cell development; • bone growth; • negative regulation of hemostasis; • positive regulation of chondrocyte proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1311
	12845
	ENSG00000105664
	ENSMUSG00000031849
	P49747
	Q9R0G6
	NM_000095
	NM_016685
	NP_000086
	NP_057894
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COMP (англ. Cartilage oligomeric matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 82 860[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVPDTACVLL	LTLAALGASG	QGQSPLGSDL	GPQMLRELQE	TNAALQDVRE
LLRQQVREIT	FLKNTVMECD	ACGMQQSVRT	GLPSVRPLLH	CAPGFCFPGV
ACIQTESGAR	CGPCPAGFTG	NGSHCTDVNE	CNAHPCFPRV	RCINTSPGFR
CEACPPGYSG	PTHQGVGLAF	AKANKQVCTD	INECETGQHN	CVPNSVCINT
RGSFQCGPCQ	PGFVGDQASG	CQRRAQRFCP	DGSPSECHEH	ADCVLERDGS
RSCVCAVGWA	GNGILCGRDT	DLDGFPDEKL	RCPERQCRKD	NCVTVPNSGQ
EDVDRDGIGD	ACDPDADGDG	VPNEKDNCPL	VRNPDQRNTD	EDKWGDACDN
CRSQKNDDQK	DTDQDGRGDA	CDDDIDGDRI	RNQADNCPRV	PNSDQKDSDG
DGIGDACDNC	PQKSNPDQAD	VDHDFVGDAC	DSDQDQDGDG	HQDSRDNCPT
VPNSAQEDSD	HDGQGDACDD	DDDNDGVPDS	RDNCRLVPNP	GQEDADRDGV
GDVCQDDFDA	DKVVDKIDVC	PENAEVTLTD	FRAFQTVVLD	PEGDAQIDPN
WVVLNQGREI	VQTMNSDPGL	AVGYTAFNGV	DFEGTFHVNT	VTDDDYAGFI
FGYQDSSSFY	VVMWKQMEQT	YWQANPFRAV	AEPGIQLKAV	KSSTGPGEQL
RNALWHTGDT	ESQVRLLWKD	PRNVGWKDKK	SYRWFLQHRP	QVGYIRVRFY
EGPELVADSN	VVLDTTMRGG	RLGVFCFSQE	NIIWANLRYR	CNDTIPEDYE
THQLRQA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chen H., Deere M., Hecht J.T., Lawler J. (2000). Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium-binding protein, and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes.. J. Biol. Chem. 275: 26538 — 26544. PubMed DOI:10.1074/jbc.M909780199
Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias.. J. Biol. Chem. 279: 25294 — 25298. PubMed DOI:10.1074/jbc.M403778200
Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins.. J. Biol. Chem. 280: 32655 — 32661. PubMed DOI:10.1074/jbc.M504778200
Koelling S., Clauditz T.S., Kaste M., Miosge N. (2006). Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis.. Arthritis Res. Ther. 8: R56 — R56. PubMed DOI:10.1186/ar1922
Gagarina V., Carlberg A.L., Pereira-Mouries L., Hall D.J. (2008). Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins.. J. Biol. Chem. 283: 648 — 659. PubMed DOI:10.1074/jbc.M704035200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з COMP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2227 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P49747 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з COMP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2227 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P49747 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.