CTBP2

CTBP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OME, 4LCJ
Ідентифікатори
Символи	CTBP2, C-terminal binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602619 MGI: 1201686 HomoloGene: 75187 GeneCards: CTBP2
Пов'язані генетичні захворювання
	рак простати[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor; • NAD binding; • GO:0001948 protein binding; • oxidoreductase activity; • hydroxypyruvate reductase activity; • protein kinase binding; • glyoxylate reductase (NADP+) activity; • protein homodimerization activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • chromatin binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • retinoic acid receptor binding; • structural constituent of presynaptic active zone;
Клітинна компонента	• Синапс; • Міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • transcription repressor complex; • ribbon synapse; • presynaptic active zone cytoplasmic component; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse; • presynaptic cytosol; • photoreceptor ribbon synapse;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • regulation of transcription, DNA-templated; • viral genome replication; • transcription, DNA-templated; • Обмін речовин; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; • white fat cell differentiation; • positive regulation of chromatin binding; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • synaptic vesicle docking; • maintenance of presynaptic active zone structure;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1488
	13017
	ENSG00000175029
	ENSMUSG00000030970
	P56545
	P56546
NM_001083914; NM_001290214; NM_001290215; NM_001329; NM_022802;
	NM_001321012; NM_001321013; NM_001321014; NM_001363508
	NM_001170744; NM_009980; NM_001347623
NP_001077383; NP_001277143; NP_001277144; NP_001307941; NP_001307942;
	NP_001307943; NP_001320; NP_073713; NP_001350437
	NP_001164215; NP_001334552; NP_034110
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CTBP2 (англ. C-terminal binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 48 945[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALVDKHKVK	RQRLDRICEG	IRPQIMNGPL	HPRPLVALLD	GRDCTVEMPI
LKDLATVAFC	DAQSTQEIHE	KVLNEAVGAM	MYHTITLTRE	DLEKFKALRV
IVRIGSGYDN	VDIKAAGELG	IAVCNIPSAA	VEETADSTIC	HILNLYRRNT
WLYQALREGT	RVQSVEQIRE	VASGAARIRG	ETLGLIGFGR	TGQAVAVRAK
AFGFSVIFYD	PYLQDGIERS	LGVQRVYTLQ	DLLYQSDCVS	LHCNLNEHNH
HLINDFTIKQ	MRQGAFLVNA	ARGGLVDEKA	LAQALKEGRI	RGAALDVHES
EPFSFAQGPL	KDAPNLICTP	HTAWYSEQAS	LEMREAAATE	IRRAITGRIP
ESLRNCVNKE	FFVTSAPWSV	IDQQAIHPEL	NGATYRYPPG	IVGVAPGGLP
AAMEGIIPGG	IPVTHNLPTV	AHPSQAPSPN	QPTKHGDNRE	HPNEQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у ядрі, клітинних контактах, синапсах.

Література

Katsanis N., Fisher E.M.C. (1998). A novel C-terminal binding protein (CTBP2) is closely related to CTBP1, an adenovirus E1A-binding protein, and maps to human chromosome 21q21.3.. Genomics 47: 294 — 299. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.5115
Schmitz F., Koenigstorfer A., Suedhof T.C. (2000). RIBEYE, a component of synaptic ribbons: a protein's journey through evolution provides insight into synaptic ribbon function.. Neuron 28: 857 — 872. PubMed DOI:10.1016/S0896-6273(00)00159-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ueda J., Tachibana M., Ikura T., Shinkai Y. (2006). Zinc finger protein Wiz links G9a/GLP histone methyltransferases to the co-repressor molecule CtBP.. J. Biol. Chem. 281: 20120 — 20128. PubMed DOI:10.1074/jbc.M603087200
Subramanian T., Zhao L.J., Chinnadurai G. (2013). Interaction of CtBP with adenovirus E1A suppresses immortalization of primary epithelial cells and enhances virus replication during productive infection.. Virology 443: 313 — 320. PubMed DOI:10.1016/j.virol.2013.05.018

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CTBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2495 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P56545 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CTBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2495 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P56545 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.