DFFB

DFFB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IBX
Ідентифікатори
Символи	DFFB, DNA fragmentation factor, 40kDa, beta polypeptide (caspase-activated DNase), CAD, CPAN, DFF-40, DFF2, DFF40, DNA fragmentation factor subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 601883 MGI: 1196287 HomoloGene: 3241 GeneCards: DFFB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding; • nuclease activity; • hydrolase activity; • GO:0001948 protein binding; • deoxyribonuclease activity; • protein domain specific binding; • identical protein binding; • disordered domain specific binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Ядерце; • внутрішньоклітинний; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• apoptotic DNA fragmentation; • apoptotic chromosome condensation; • Апоптоз; • DNA catabolic process; • protein homooligomerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1677
	13368
	ENSG00000169598
	ENSMUSG00000029027
	O76075
	O54788
NM_001004285; NM_001004286; NM_001282669; NM_004402; NM_001320132;
	NM_001320136
	NM_007859
	NP_001269598; NP_001307061; NP_001307065; NP_004393
	NP_031885
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DFFB (англ. DNA fragmentation factor subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 39 110[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLQKPKSVKL	RALRSPRKFG	VAGRSCQEVL	RKGCLRFQLP	ERGSRLCLYE
DGTELTEDYF	PSVPDNAELV	LLTLGQAWQG	YVSDIRRFLS	AFHEPQVGLI
QAAQQLLCDE	QAPQRQRLLA	DLLHNVSQNI	AAETRAEDPP	WFEGLESRFQ
SKSGYLRYSC	ESRIRSYLRE	VSSYPSTVGA	EAQEEFLRVL	GSMCQRLRSM
QYNGSYFDRG	AKGGSRLCTP	EGWFSCQGPF	DMDSCLSRHS	INPYSNRESR
ILFSTWNLDH	IIEKKRTIIP	TLVEAIKEQD	GREVDWEYFY	GLLFTSENLK
LVHIVCHKKT	THKLNCDPSR	IYKPQTRLKR	KQPVRKRQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як апоптоз. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Ninios Y.P., Sekeri-Pataryas K.E., Sourlingas T.G. (2010). Histone H1 subtype preferences of DFF40 and possible nuclear localization of DFF40/45 in normal and trichostatin A-treated NB4 leukemic cells.. Apoptosis 15: 128 — 138. PubMed DOI:10.1007/s10495-009-0418-7

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2773 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, O76075 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2773 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O76075 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.