DHFR

DHFR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BOZ, 1DHF, 1DLR, 1DLS, 1DRF, 1HFP, 1HFQ, 1HFR, 1KMS, 1KMV, 1MVS, 1MVT, 1OHJ, 1OHK, 1PD8, 1PD9, 1PDB, 1S3U, 1S3V, 1S3W, 1U71, 1U72, 1YHO, 2C2S, 2C2T, 2DHF, 2W3A, 2W3B, 2W3M, 3EIG, 3F8Y, 3F8Z, 3F91, 3FS6, 3GHC, 3GHV, 3GHW, 3GI2, 3GYF, 3L3R, 3N0H, 3NTZ, 3NU0, 3NXO, 3NXR, 3NXT, 3NXV, 3NXX, 3NXY, 3NZD, 3OAF, 3S3V, 3S7A, 4DDR, 4G95, 4KAK, 4KBN, 4KD7, 4KEB, 4KFJ, 4M6J, 4M6K, 4M6L, 4QHV, 4QJC
Ідентифікатори
Символи	DHFR, DHFRP1, DYR, dihydrofolate reductase
Зовнішні ІД	OMIM: 126060 MGI: 94890 HomoloGene: 56470 GeneCards: DHFR
Реагує на сполуку
	Метотрексат, pemetrexed, pralatrexate, триметрексат[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methotrexate binding; • folic acid binding; • dihydrofolate reductase activity; • NADPH binding; • RNA binding; • oxidoreductase activity; • mRNA binding; • folate reductase activity; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • sequence-specific mRNA binding; • NADP binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • цитоплазма; • мітохондрія; • компонент клітини;
Біологічний процес	• response to methotrexate; • dihydrofolate metabolic process; • one-carbon metabolic process; • axon regeneration; • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • tetrahydrofolate metabolic process; • tetrahydrofolate biosynthetic process; • positive regulation of nitric-oxide synthase activity; • folic acid metabolic process; • tetrahydrobiopterin biosynthetic process; • regulation of removal of superoxide radicals; • negative regulation of translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1719
	13361
	ENSG00000228716
	ENSMUSG00000021707
	P00374
	P00375
	NM_000791; NM_001290354; NM_001290357
	NM_010049
	NP_000782; NP_001277283; NP_001277286
	NP_034179
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DHFR (англ. Dihydrofolate reductase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 187 амінокислот, а молекулярна маса — 21 453[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVGSLNCIVA	VSQNMGIGKN	GDLPWPPLRN	EFRYFQRMTT	TSSVEGKQNL
VIMGKKTWFS	IPEKNRPLKG	RINLVLSREL	KEPPQGAHFL	SRSLDDALKL
TEQPELANKV	DMVWIVGGSS	VYKEAMNHPG	HLKLFVTRIM	QDFESDTFFP
EIDLEKYKLL	PEYPGVLSDV	QEEKGIKYKF	EVYEKND

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах як одновуглецевий метаболізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, НАДФ. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

Masters J.N., Attardi G. (1983). The nucleotide sequence of the cDNA coding for the human dihydrofolic acid reductase.. Gene 21: 59 — 63. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(83)90147-6
Yang J.K., Masters J.N., Attardi G. (1984). Human dihydrofolate reductase gene organization. Extensive conservation of the G + C-rich 5' non-coding sequence and strong intron size divergence from homologous mammalian genes.. J. Mol. Biol. 176: 169 — 187. PubMed DOI:10.1016/0022-2836(84)90419-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163 — 15168. PubMed DOI:10.1073/pnas.1103623108
Oefner C., D'Arcy A., Winkler F.K. (1988). Crystal structure of human dihydrofolate reductase complexed with folate.. Eur. J. Biochem. 174: 377 — 385. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14108.x
Cody V., Galitsky N., Luft J.R., Pangborn W., Gangjee A. (2003). Analysis of two polymorphic forms of a pyrido[2,3-d]pyrimidine N9-C10 reversed-bridge antifolate binary complex with human dihydrofolate reductase.. Acta Crystallogr. D 59: 654 — 661. PubMed DOI:10.1107/S0907444903001951

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з DHFR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2861 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P00374 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з DHFR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2861 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P00374 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.