GRIA2

GRIA2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WJW, 2WJX, 2XHD, 3R7X, 3RN8, 3RNN, 3UA8, 5H8S
Ідентифікатори
Символи	GRIA2, GLUR2, GLURB, GluA2, GluR-K2, HBGR2, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2, gluR-B, gluR-2, NEDLIB
Зовнішні ІД	OMIM: 138247 MGI: 95809 HomoloGene: 20225 GeneCards: GRIA2
Реагує на сполуку
	AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity; • GO:0001948 protein binding; • ionotropic glutamate receptor activity; • extracellularly glutamate-gated ion channel activity; • excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity; • AMPA glutamate receptor activity; • amyloid-beta binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • postsynaptic membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • Синапс; • integral component of plasma membrane; • Міжклітинні контакти; • Ендоплазматичний ретикулум; • AMPA glutamate receptor complex; • external side of plasma membrane; • Дендрит (нейробіологія); • dendritic spine; • excitatory synapse; • postsynapse; • postsynaptic endocytic zone; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення;
Біологічний процес	• ion transport; • ion transmembrane transport; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • транспорт; • Сигнальна трансдукція; • chemical synaptic transmission; • excitatory postsynaptic potential; • synaptic transmission, glutamatergic; • regulation of NMDA receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2891
	14800
	ENSG00000120251
	ENSMUSG00000033981
	P42262
	P23819
	NM_000826; NM_001083619; NM_001083620; NM_001379000; NM_001379001
	NM_001039195; NM_001083806; NM_013540; NM_001357924; NM_001357927
	NP_000817; NP_001077088; NP_001077089; NP_001365929; NP_001365930
	NP_001034284; NP_001077275; NP_038568; NP_001344853; NP_001344856
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GRIA2 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 883 амінокислот, а молекулярна маса — 98 821[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQKIMHISVL	LSPVLWGLIF	GVSSNSIQIG	GLFPRGADQE	YSAFRVGMVQ
FSTSEFRLTP	HIDNLEVANS	FAVTNAFCSQ	FSRGVYAIFG	FYDKKSVNTI
TSFCGTLHVS	FITPSFPTDG	THPFVIQMRP	DLKGALLSLI	EYYQWDKFAY
LYDSDRGLST	LQAVLDSAAE	KKWQVTAINV	GNINNDKKDE	MYRSLFQDLE
LKKERRVILD	CERDKVNDIV	DQVITIGKHV	KGYHYIIANL	GFTDGDLLKI
QFGGANVSGF	QIVDYDDSLV	SKFIERWSTL	EEKEYPGAHT	TTIKYTSALT
YDAVQVMTEA	FRNLRKQRIE	ISRRGNAGDC	LANPAVPWGQ	GVEIERALKQ
VQVEGLSGNI	KFDQNGKRIN	YTINIMELKT	NGPRKIGYWS	EVDKMVVTLT
ELPSGNDTSG	LENKTVVVTT	ILESPYVMMK	KNHEMLEGNE	RYEGYCVDLA
AEIAKHCGFK	YKLTIVGDGK	YGARDADTKI	WNGMVGELVY	GKADIAIAPL
TITLVREEVI	DFSKPFMSLG	ISIMIKKPQK	SKPGVFSFLD	PLAYEIWMCI
VFAYIGVSVV	LFLVSRFSPY	EWHTEEFEDG	RETQSSESTN	EFGIFNSLWF
SLGAFMQQGC	DISPRSLSGR	IVGGVWWFFT	LIIISSYTAN	LAAFLTVERM
VSPIESAEDL	SKQTEIAYGT	LDSGSTKEFF	RRSKIAVFDK	MWTYMRSAEP
SVFVRTTAEG	VARVRKSKGK	YAYLLESTMN	EYIEQRKPCD	TMKVGGNLDS
KGYGIATPKG	SSLRNAVNLA	VLKLNEQGLL	DKLKNKWWYD	KGECGSGGGD
SKEKTSALSL	SNVAGVFYIL	VGGLGLAMLV	ALIEFCYKSR	AEAKRMKVAK
NAQNINPSSS	QNSQNFATYK	EGYNVYGIES	VKI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до глутаматних рецепторів підродини АМРА-рецепторів. Це іонний канал, який відчиняється у відповідь на зв'язування з молекулою глутамінової кислоти та пропускає іони натрію всередину клітини.

На відміну від NMDA-рецепторів та інших АМРА-рецепторів у порі цього каналу в 607-му амінокислотному положенні знаходиться не залишок глутаміну, а залишок аргініну. Це робить іонний канал селективним для іонів натрію, а іони кальцію пройти крізь нього не можуть. Заміна стається завдяки редагуванню матричної РНК цього каналу, і є консервативною для більшості хребетних[6].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Dev K.K., Nakanishi S., Henley J.M. (2004). The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C-alpha and GluR2 as interacting ligands.. J. Biol. Chem. 279: 41393 — 41397. PubMed DOI:10.1074/jbc.M404499200
Sun W., Ferrer-Montiel A.V., Montal M. (1994). Primary structure and functional expression of the AMPA/kainate receptor subunit 2 from human brain.. NeuroReport 5: 441 — 444. PubMed
Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue.. J. Neurochem. 63: 1596 — 1602. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4572 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P42262 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
Konen, Lyndsey M.; Wright, Amanda L.; Royle, Gordon A.; Morris, Gary P.; Lau, Benjamin K.; Seow, Patrick W.; Zinn, Raphael; Milham, Luke T.; Vaughan, Christopher W.; Vissel, Bryce (2020). A new mouse line with reduced GluA2 Q/R site RNA editing exhibits loss of dendritic spines, hippocampal CA1-neuron loss, learning and memory impairments and NMDA receptor-independent seizure vulnerability. Molecular Brain 13 (1). ISSN 1756-6606. doi:10.1186/s13041-020-0545-1.(англ.)

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4572 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P42262 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[KonenWright2020-6] Konen, Lyndsey M.; Wright, Amanda L.; Royle, Gordon A.; Morris, Gary P.; Lau, Benjamin K.; Seow, Patrick W.; Zinn, Raphael; Milham, Luke T.; Vaughan, Christopher W.; Vissel, Bryce (2020). A new mouse line with reduced GluA2 Q/R site RNA editing exhibits loss of dendritic spines, hippocampal CA1-neuron loss, learning and memory impairments and NMDA receptor-independent seizure vulnerability. Molecular Brain 13 (1). ISSN 1756-6606. doi:10.1186/s13041-020-0545-1.(англ.)