HGS

HGS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D3G, 3F1I, 3OBQ, 3ZYQ, 4AVX
Ідентифікатори
Символи	HGS, HRS, hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate
Зовнішні ІД	OMIM: 604375 MGI: 104681 HomoloGene: 37954 GeneCards: HGS
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • ubiquitin-like protein ligase binding;
Клітинна компонента	• ендосома; • early endosome membrane; • multivesicular body membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • early endosome; • Екзосома; • цитоплазма; • Лізосома; • гіалоплазма; • ESCRT-0 complex;
Біологічний процес	• protein localization to membrane; • protein targeting to lysosome; • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • membrane invagination; • multivesicular body assembly; • endosomal transport; • positive regulation of gene expression; • regulation of protein catabolic process; • protein transport; • regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of exosomal secretion; • intracellular protein transport; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; • macroautophagy; • protein deubiquitination; • membrane organization; • транспорт; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • negative regulation of angiogenesis; • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9146
	15239
	ENSG00000185359
	ENSMUSG00000025793
	O14964
	Q99LI8
	NM_004712
	NM_001159328; NM_008244
	NP_004703
	NP_001152800; NP_032270
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HGS (англ. Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми[3]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 86 192[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRGSGTFER	LLDKATSQLL	LETDWESILQ	ICDLIRQGDT	QAKYAVNSIK
KKVNDKNPHV	ALYALEVMES	VVKNCGQTVH	DEVANKQTME	ELKDLLKRQV
EVNVRNKILY	LIQAWAHAFR	NEPKYKVVQD	TYQIMKVEGH	VFPEFKESDA
MFAAERAPDW	VDAEECHRCR	VQFGVMTRKH	HCRACGQIFC	GKCSSKYSTI
PKFGIEKEVR	VCEPCYEQLN	RKAEGKATST	TELPPEYLTS	PLSQQSQLPP
KRDETALQEE	EELQLALALS	QSEAEEKERL	RQKSTYTSYP	KAEPMPSASS
APPASSLYSS	PVNSSAPLAE	DIDPELARYL	NRNYWEKKQE	EARKSPTPSA
PVPLTEPAAQ	PGEGHAAPTN	VVENPLPETD	SQPIPPSGGP	FSEPQFHNGE
SEESHEQFLK	ALQNAVTTFV	NRMKSNHMRG	RSITNDSAVL	SLFQSINGMH
PQLLELLNQL	DERRLYYEGL	QDKLAQIRDA	RGALSALREE	HREKLRRAAE
EAERQRQIQL	AQKLEIMRQK	KQEYLEVQRQ	LAIQRLQEQE	KERQMRLEQQ
KQTVQMRAQM	PAFPLPYAQL	QAMPAAGGVL	YQPSGPASFP	STFSPAGSVE
GSPMHGVYMS	QPAPAAGPYP	SMPSTAADPS	MVSAYMYPAG	ATGAQAAPQA
QAGPTASPAY	SSYQPTPTAG	YQNVASQAPQ	SLPAISQPPQ	SSTMGYMGSQ
SVSMGYQPYN	MQNLMTTLPS	QDASLPPQQP	YIAGQQPMYQ	QMAPSGGPPQ
QQPPVAQQPQ	AQGPPAQGSE	AQLISFD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Lu L., Komada M., Kitamura N. (1998). Human Hrs, a tyrosine kinase substrate in growth factor-stimulated cells: cDNA cloning and mapping of the gene to chromosome 17.. Gene 213: 125 — 132. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(98)00184-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Komada M., Masaki R., Yamamoto A., Kitamura N. (1997). Hrs, a tyrosine kinase substrate with a conserved double zinc finger domain, is localized to the cytoplasmic surface of early endosomes.. J. Biol. Chem. 272: 20538 — 20544. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.33.20538
Bache K.G., Raiborg C., Mehlum A., Stenmark H. (2003). STAM and Hrs are subunits of a multivalent ubiquitin-binding complex on early endosomes.. J. Biol. Chem. 278: 12513 — 12521. PubMed DOI:10.1074/jbc.M210843200
Eastman S.W., Martin-Serrano J., Chung W., Zang T., Bieniasz P.D. (2005). Identification of human VPS37C, a component of endosomal sorting complex required for transport-I important for viral budding.. J. Biol. Chem. 280: 628 — 636. PubMed DOI:10.1074/jbc.M410384200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4897 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O14964 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4897 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14964 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.