HIF1A

HIF1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H2K, 1H2L, 1H2M, 1L3E, 1L8C, 1LM8, 1LQB, 2ILM, 3HQR, 3HQU, 4AJY, 4H6J
Ідентифікатори
Символи	HIF1A, HIF-1-alpha, HIF-1A, HIF-1alpha, HIF1, HIF1-ALPHA, MOP1, PASD8, bHLHe78, hypoxia inducible factor 1 alpha subunit, hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, HIF-1α
Зовнішні ІД	OMIM: 603348 MGI: 106918 HomoloGene: 1171 GeneCards: HIF1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • transcription factor binding; • enzyme binding; • GO:0001948 protein binding; • histone acetyltransferase binding; • protein kinase binding; • Hsp90 protein binding; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • ubiquitin protein ligase binding; • protein heterodimerization activity; • E-box binding; • p53 binding; • protein domain specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • nuclear speck; • motile cilium; • transcription regulator complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • axon cytoplasm; • Нуклеоплазма; • Ядерні тільця; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of neuron apoptotic process; • B-1 B cell homeostasis; • regulation of transforming growth factor beta2 production; • muscle cell cellular homeostasis; • outflow tract morphogenesis; • negative regulation of ossification; • heart looping; • negative regulation of TOR signaling; • blood vessel development; • hemoglobin biosynthetic process; • Ангіогенез; • positive regulation of chemokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • positive regulation of hormone biosynthetic process; • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process; • regulation of aerobic respiration; • positive regulation of neuroblast proliferation; • dopaminergic neuron differentiation; • lactate metabolic process; • regulation of transcription, DNA-templated; • blood vessel morphogenesis; • positive regulation of erythrocyte differentiation; • glucose homeostasis; • vascular endothelial growth factor production; • regulation of thymocyte apoptotic process; • positive regulation of epithelial cell migration; • negative regulation of thymocyte apoptotic process; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • axonal transport of mitochondrion; • positive regulation of macroautophagy; • cartilage development; • positive regulation of nitric-oxide synthase activity; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • Лактація; • negative regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • digestive tract morphogenesis; • Диференціація клітин; • neural fold elevation formation; • positive regulation of autophagy; • retina vasculature development in camera-type eye; • collagen metabolic process; • embryonic placenta development; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of angiogenesis; • regulation of glycolytic process; • Епітеліально-мезенхімальний перехід; • cerebral cortex development; • Регуляція експресії генів; • positive regulation of chemokine production; • intestinal epithelial cell maturation; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • positive regulation of autophagy of mitochondrion; • cardiac ventricle morphogenesis; • response to muscle activity; • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development; • visual learning; • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • negative regulation of bone mineralization; • negative regulation of growth; • response to hypoxia; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; • iris morphogenesis; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway; • vasculature development; • regulation of cell population proliferation; • neural crest cell migration; • embryonic hemopoiesis; • connective tissue replacement involved in inflammatory response wound healing; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process; • positive regulation of vascular endothelial growth factor production; • elastin metabolic process; • positive regulation of glycolytic process; • oxygen homeostasis; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular iron ion homeostasis; • camera-type eye morphogenesis; • cellular response to hypoxia; • cellular response to interleukin-1; • transcription by RNA polymerase II; • protein deubiquitination; • посттрансляційна модифікація; • response to iron ion; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of gene expression; • cytokine-mediated signaling pathway; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • Убіквітин-залежний протеоліз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3091
	15251
	ENSG00000100644
	ENSMUSG00000021109
	Q16665
	Q61221
	NM_181054; NM_001243084; NM_001530
	NM_010431; NM_001313919; NM_001313920
	NP_001230013; NP_001521; NP_851397; NP_001521.1
	NP_001300848; NP_001300849; NP_034561
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIF1A (англ. Hypoxia inducible factor 1 alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 826 амінокислот, а молекулярна маса — 92 670[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGAGGANDK	KKISSERRKE	KSRDAARSRR	SKESEVFYEL	AHQLPLPHNV
SSHLDKASVM	RLTISYLRVR	KLLDAGDLDI	EDDMKAQMNC	FYLKALDGFV
MVLTDDGDMI	YISDNVNKYM	GLTQFELTGH	SVFDFTHPCD	HEEMREMLTH
RNGLVKKGKE	QNTQRSFFLR	MKCTLTSRGR	TMNIKSATWK	VLHCTGHIHV
YDTNSNQPQC	GYKKPPMTCL	VLICEPIPHP	SNIEIPLDSK	TFLSRHSLDM
KFSYCDERIT	ELMGYEPEEL	LGRSIYEYYH	ALDSDHLTKT	HHDMFTKGQV
TTGQYRMLAK	RGGYVWVETQ	ATVIYNTKNS	QPQCIVCVNY	VVSGIIQHDL
IFSLQQTECV	LKPVESSDMK	MTQLFTKVES	EDTSSLFDKL	KKEPDALTLL
APAAGDTIIS	LDFGSNDTET	DDQQLEEVPL	YNDVMLPSPN	EKLQNINLAM
SPLPTAETPK	PLRSSADPAL	NQEVALKLEP	NPESLELSFT	MPQIQDQTPS
PSDGSTRQSS	PEPNSPSEYC	FYVDSDMVNE	FKLELVEKLF	AEDTEAKNPF
STQDTDLDLE	MLAPYIPMDD	DFQLRSFDQL	SPLESSSASP	ESASPQSTVT
VFQQTQIQEP	TANATTTTAT	TDELKTVTKD	RMEDIKILIA	SPSPTHIHKE
TTSATSSPYR	DTQSRTASPN	RAGKGVIEQT	EKSHPRSPNV	LSVALSQRTT
VPEEELNPKI	LALQNAQRKR	KMEHDGSLFQ	AVGIGTLLQQ	PDDHAATTSL
SWKRVKGCKS	SEQNGMEQKT	IILIPSDLAC	RLLGQSMDES	GLPQLTSYDC
EVNAPIQGSR	NLLQGEELLR	ALDQVN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Є основним фактором, індукованим гіпоксією.

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 5510 — 5514. PubMed DOI:10.1073/pnas.92.12.5510
Iyer N.V., Leung S.W., Semenza G.L. (1998). The human hypoxia-inducible factor 1alpha gene: HIF1A structure and evolutionary conservation.. Genomics 52: 159 — 165. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5416
Lukashev D., Sitkovsky M. (2008). Preferential expression of the novel alternative isoform I.3 of hypoxia-inducible factor 1alpha in activated human T lymphocytes.. Hum. Immunol. 69: 421 — 425. PubMed DOI:10.1016/j.humimm.2008.05.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Jiang B.H., Zheng J.Z., Leung S.W., Roe R., Semenza G.L. (1997). Transactivation and inhibitory domains of hypoxia-inducible factor 1alpha. Modulation of transcriptional activity by oxygen tension.. J. Biol. Chem. 272: 19253 — 19260. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.31.19253
Huang L.E., Gu J., Schau M., Bunn H.F. (1998). Regulation of hypoxia-inducible factor 1alpha is mediated by an O2-dependent degradation domain via the ubiquitin-proteasome pathway.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7987 — 7992. PubMed DOI:10.1073/pnas.95.14.7987

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4910 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q16665 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4910 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q16665 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.