HLA-DRA

HLA-DRA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A6A, 1AQD, 1BX2, 1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1DLH, 1FV1, 1FYT, 1H15, 1HXY, 1J8H, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJE, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 1YMM, 1ZGL, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2Q6W, 2WBJ, 2XN9, 3C5J, 3L6F, 3O6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 3T0E, 4AEN, 4AH2, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4H1L, 4C56, 4H25, 4H26, 4I5B, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4OV5, 4Y19, 4Y1A, 4X5X, 4X5W
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRA, HLA-DRA1, MLRW, major histocompatibility complex, class II, DR alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 142860 MGI: 95900 HomoloGene: 7751 GeneCards: HLA-DRA
Пов'язані генетичні захворювання
	Розсіяний склероз, азооспермія, Системна склеродермія, хвороба Паркінсона[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity; • MHC class II protein complex binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • Ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • late endosome membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • lysosomal membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • Екзосома; • MHC class II protein complex;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • Когнітивність; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • T cell costimulation; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • Імунна відповідь; • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex; • GO:0022415 viral process; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3122
	100504404
ENSG00000206308; ENSG00000228987; ENSG00000230726; ENSG00000204287; ENSG00000227993;
	ENSG00000226260; ENSG00000234794; ENSG00000277263
	ENSMUSG00000036322
	P01903
	P04224; P01904
	NM_019111
	NM_010381
	NP_061984
	NP_034511
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DRA (англ. Major histocompatibility complex, class II, DR alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 254 амінокислот, а молекулярна маса — 28 607[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAISGVPVLG	FFIIAVLMSA	QESWAIKEEH	VIIQAEFYLN	PDQSGEFMFD
FDGDEIFHVD	MAKKETVWRL	EEFGRFASFE	AQGALANIAV	DKANLEIMTK
RSNYTPITNV	PPEVTVLTNS	PVELREPNVL	ICFIDKFTPP	VVNVTWLRNG
KPVTTGVSET	VFLPREDHLF	RKFHYLPFLP	STEDVYDCRV	EHWGLDEPLL
KHWEFDAPSP	LPETTENVVC	ALGLTVGLVG	IIIGTIFIIK	GVRKSNAAER
RGPL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Schamboeck A., Korman A.J., Kamb A., Strominger J.L. (1983). Organization of the transcriptional unit of a human class II histocompatibility antigen: HLA-DR heavy chain.. Nucleic Acids Res. 11: 8663 — 8675. PubMed DOI:10.1093/nar/11.24.8663
Das H.K., Lawrance S.K., Weissman S.M. (1983). Structure and nucleotide sequence of the heavy chain gene of HLA-DR.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 3543 — 3547. PubMed DOI:10.1073/pnas.80.12.3543
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Korman A.J., Auffray C., Schamboeck A., Strominger J.L. (1982). The amino acid sequence and gene organization of the heavy chain of the HLA-DR antigen: homology to immunoglobulins.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79: 6013 — 6017. PubMed DOI:10.1073/pnas.79.19.6013
Kralovicova J., Marsh S.G., Waller M.J., Hammarstrom L., Vorechovsky I. (2002). The HLA-DRA*0102 allele: correct nucleotide sequence and associated HLA haplotypes.. Tissue Antigens 60: 266 — 267. PubMed DOI:10.1034/j.1399-0039.2002.600310.x
Thursz M.R., Thomas H.C., Greenwood B.M., Hill A.V.S. (1997). Heterozygote advantage for HLA class-II type in hepatitis B virus infection.. Nat. Genet. 17: 11 — 12. PubMed DOI:10.1038/ng0997-11

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4947 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01903 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4947 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P01903 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.