HLA-DRB5

HLA-DRB5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FV1, 1H15, 1HQR, 1ZGL
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRB5, HLA-DRB, major histocompatibility complex, class II, DR beta 5, HLA-DRB5*
Зовнішні ІД	OMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 GeneCards: HLA-DRB5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • late endosome membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • Екзосома;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • T cell costimulation; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • Імунна відповідь; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3127
	14969
	ENSG00000198502
	ENSMUSG00000060586
	Q30154
P04231; P04230; P18468; P18469; O78196;
	н/д
	NM_002125
	NM_010382
	NP_002116
	NP_034512
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DRB5 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DR beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 30 056[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCLKLPGGS	YMAKLTVTLM	VLSSPLALAG	DTRPRFLQQD	KYECHFFNGT
ERVRFLHRDI	YNQEEDLRFD	SDVGEYRAVT	ELGRPDAEYW	NSQKDFLEDR
RAAVDTYCRH	NYGVGESFTV	QRRVEPKVTV	YPARTQTLQH	HNLLVCSVNG
FYPGSIEVRW	FRNSQEEKAG	VVSTGLIQNG	DWTFQTLVML	ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT	SPLTVEWRAQ	SESAQSKMLS	GVGGFVLGLL	FLGAGLFIYF
KNQKGHSGLH	PTGLVS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Wu S., Saunders T.L., Bach F.H. (1986). Polymorphism of human Ia antigens generated by reciprocal intergenic exchange between two DR beta loci.. Nature 324: 676 — 679. PubMed DOI:10.1038/324676a0
Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic.. Immunogenetics 27: 449 — 455. PubMed DOI:10.1007/BF00364432
Demopulos J.T., Hodge T.W., Wooten V., Acton R.T. (1991). A novel DRB1 allele in DR2-positive American blacks.. Hum. Immunol. 30: 41 — 44. PubMed DOI:10.1016/0198-8859(91)90069-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591 — 4595. PubMed DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
Kervaire B., Tiercy J. (1997). Sequence of a new HLA-DR allele, DRB5*0106.. Eur. J. Immunogenet. 24: 225 — 228. PubMed DOI:10.1111/j.1365-2370.1997.00267.x

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4953 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q30154 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4953 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q30154 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.