KPNA2

KPNA2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1EFX, 1QGK, 1QGR, 3FEX, 3FEY, 3WPT, 4E4V, 4WV6
Ідентифікатори
Символи	KPNA2, IPOA1, QIP2, RCH1, SRP1alpha, Karyopherin alpha 2, SRP1-alpha, karyopherin subunit alpha 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600685 MGI: 103561 HomoloGene: 1708 GeneCards: KPNA2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone deacetylase binding; • GO:0001948 protein binding; • nuclear localization sequence binding; • RNA binding; • nuclear import signal receptor activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • Ядерна пора; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • host cell; • extrinsic component of postsynaptic specialization membrane; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• regulation of DNA recombination; • protein import into nucleus; • DNA metabolic process; • protein transport; • GO:0022415 viral process; • NLS-bearing protein import into nucleus; • modulation by virus of host cellular process; • GO:0046795 intracellular transport of virus; • транспорт; • postsynapse to nucleus signaling pathway; • entry of viral genome into host nucleus through nuclear pore complex via importin; • positive regulation of viral life cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3838
	16647
	ENSG00000182481
	ENSMUSG00000018362
	P52292
	P52293
	NM_002266; NM_001320611
	NM_010655
	NP_001307540; NP_002257
	NP_034785
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KPNA2 (англ. Karyopherin subunit alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 57 862[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTNENANTP	AARLHRFKNK	GKDSTEMRRR	RIEVNVELRK	AKKDDQMLKR
RNVSSFPDDA	TSPLQENRNN	QGTVNWSVDD	IVKGINSSNV	ENQLQATQAA
RKLLSREKQP	PIDNIIRAGL	IPKFVSFLGR	TDCSPIQFES	AWALTNIASG
TSEQTKAVVD	GGAIPAFISL	LASPHAHISE	QAVWALGNIA	GDGSVFRDLV
IKYGAVDPLL	ALLAVPDMSS	LACGYLRNLT	WTLSNLCRNK	NPAPPIDAVE
QILPTLVRLL	HHDDPEVLAD	TCWAISYLTD	GPNERIGMVV	KTGVVPQLVK
LLGASELPIV	TPALRAIGNI	VTGTDEQTQV	VIDAGALAVF	PSLLTNPKTN
IQKEATWTMS	NITAGRQDQI	QQVVNHGLVP	FLVSVLSKAD	FKTQKEAVWA
VTNYTSGGTV	EQIVYLVHCG	IIEPLMNLLT	AKDTKIILVI	LDAISNIFQA
AEKLGETEKL	SIMIEECGGL	DKIEALQNHE	NESVYKASLS	LIEKYFSVEE
EEDQNVVPET	TSEGYTFQVQ	DGAPGTFNF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Weis K., Mattaj I.W., Lamond A.I. (1995). Identification of hSRP1 alpha as a functional receptor for nuclear localization sequences.. Science 268: 1049 — 1053. PubMed DOI:10.1126/science.7754385
Doerr S., Schlicker M., Hansmann I. (2001). Genomic structure of karyopherin alpha2 (KPNA2) within a low-copy repeat on chromosome 17q23-q24 and mutation analysis in patients with Russell-Silver syndrome.. Hum. Genet. 109: 479 — 486. PubMed DOI:10.1007/s004390100605
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cuomo C.A., Kirch S.A., Gyuris J., Brent R., Oettinger M.A. (1994). Rch1, a protein that specifically interacts with the RAG-1 recombination-activating protein.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6156 — 6160. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.13.6156
Moroianu J., Hijikata M., Blobel G., Radu A. (1995). Mammalian karyopherin alpha 1 beta and alpha 2 beta heterodimers: alpha 1 or alpha 2 subunit binds nuclear localization signal and beta subunit interacts with peptide repeat-containing nucleoporins.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 6532 — 6536. PubMed DOI:10.1073/pnas.92.14.6532
Kutay U., Bischoff F.R., Kostka S., Kraft R., Goerlich D. (1997). Export of importin-alpha from the nucleus is mediated by a specific nuclear transport factor.. Cell 90: 1061 — 1071. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80372-4

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6395 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P52292 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6395 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P52292 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.