LGR5

LGR5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4BSR, 4BSS, 4BST, 4BSU, 4KNG, 4UFR, 4UFS
Ідентифікатори
Символи	LGR5, FEX, GPR49, GPR67, GRP49, HG38, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606667 MGI: 1341817 HomoloGene: 20807 GeneCards: LGR5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • G protein-coupled receptor activity; • transmembrane signaling receptor activity; • signal transducer activity; • protein-hormone receptor activity; • G protein-coupled peptide receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • комплекс Ґольджі; • integral component of plasma membrane; • trans-Golgi network membrane; • мембрана;
Біологічний процес	• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • hair follicle development; • inner ear development; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis; • regulation of cell population proliferation; • oocyte differentiation; • Сигнальна трансдукція; • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • activation of adenylate cyclase activity; • hormone-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8549
	14160
	ENSG00000139292
	ENSMUSG00000020140
	O75473
	Q9Z1P4
	NM_001277226; NM_001277227; NM_003667
	NM_010195
	NP_001264155; NP_001264156; NP_003658
	NP_034325
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LGR5 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 907 амінокислот, а молекулярна маса — 99 998[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTSRLGVLL	SLPVLLQLAT	GGSSPRSGVL	LRGCPTHCHC	EPDGRMLLRV
DCSDLGLSEL	PSNLSVFTSY	LDLSMNNISQ	LLPNPLPSLR	FLEELRLAGN
ALTYIPKGAF	TGLYSLKVLM	LQNNQLRHVP	TEALQNLRSL	QSLRLDANHI
SYVPPSCFSG	LHSLRHLWLD	DNALTEIPVQ	AFRSLSALQA	MTLALNKIHH
IPDYAFGNLS	SLVVLHLHNN	RIHSLGKKCF	DGLHSLETLD	LNYNNLDEFP
TAIRTLSNLK	ELGFHSNNIR	SIPEKAFVGN	PSLITIHFYD	NPIQFVGRSA
FQHLPELRTL	TLNGASQITE	FPDLTGTANL	ESLTLTGAQI	SSLPQTVCNQ
LPNLQVLDLS	YNLLEDLPSF	SVCQKLQKID	LRHNEIYEIK	VDTFQQLLSL
RSLNLAWNKI	AIIHPNAFST	LPSLIKLDLS	SNLLSSFPIT	GLHGLTHLKL
TGNHALQSLI	SSENFPELKV	IEMPYAYQCC	AFGVCENAYK	ISNQWNKGDN
SSMDDLHKKD	AGMFQAQDER	DLEDFLLDFE	EDLKALHSVQ	CSPSPGPFKP
CEHLLDGWLI	RIGVWTIAVL	ALTCNALVTS	TVFRSPLYIS	PIKLLIGVIA
AVNMLTGVSS	AVLAGVDAFT	FGSFARHGAW	WENGVGCHVI	GFLSIFASES
SVFLLTLAAL	ERGFSVKYSA	KFETKAPFSS	LKVIILLCAL	LALTMAAVPL
LGGSKYGASP	LCLPLPFGEP	STMGYMVALI	LLNSLCFLMM	TIAYTKLYCN
LDKGDLENIW	DCSMVKHIAL	LLFTNCILNC	PVAFLSFSSL	INLTFISPEV
IKFILLVVVP	LPACLNPLLY	ILFNPHFKED	LVSLRKQTYV	WTRSKHPSLM
SINSDDVEKQ	SCDSTQALVT	FTSSSITYDL	PPSSVPSPAY	PVTESCHLSS
VAFVPCL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.

Література

Hsu S.Y., Liang S.-G., Hsueh A.J.W. (1998). Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine-rich repeats and a G protein-coupled, seven-transmembrane region.. Mol. Endocrinol. 12: 1830 — 1845. PubMed DOI:10.1210/mend.12.12.0211
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Becker L., Huang Q., Mashimo H. (2008). Immunostaining of Lgr5, an intestinal stem cell marker, in normal and premalignant human gastrointestinal tissue.. ScientificWorldJournal 8: 1168 — 1176. PubMed DOI:10.1100/tsw.2008.148
Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452 — 11457. PubMed DOI:10.1073/pnas.1106083108
Snyder J.C., Rochelle L.K., Lyerly H.K., Caron M.G., Barak L.S. (2013). Constitutive Internalization of the Leucine-rich G Protein-coupled Receptor-5 (LGR5) to the Trans-Golgi Network.. J. Biol. Chem. 288: 10286 — 10297. PubMed DOI:10.1074/jbc.M112.447540
Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43.. Genes Dev. 27: 1345 — 1350. PubMed DOI:10.1101/gad.219915.113

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4504 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, O75473 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4504 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75473 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.